이것은 최신 릴리스를 binaries.zip으로 다운로드할 수 있는 JSiteDescriptor라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 JSiteDescriptor라는 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
JSiteDescriptor
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기술
PDB 파일에서 좌표 및 화학 정보를 추출하는 Java 프로그램 세트입니다.
바인딩 사이트 영역은 그리드 기반 체계를 사용하여 추출됩니다.
바인딩 사이트의 경우 Kalidas 박사(이 프로젝트의 저자)의 PocketMatch 알고리즘을 기반으로 spatio-chemical descriptor가 생성됩니다.
기능
- 바인딩 사이트에 대한 PocketMatch 기반 벡터 설명자 생성
- 단일 PDB 파일 모드 또는 배치 모드에서 실행
- 리간드 이웃으로 사이트 지정 - (리간드 코드, 이름 및 체인 ID)
- REGULAR EXPRESSIONS를 사용하여 PDB 하위 집합 이웃으로 사이트 지정
- 바인딩 사이트를 라이닝하는 원자의 여러 범위 지정
- 배치 모드 처리 파일은 XML 파일 + XSD 사양 준수를 통해 입력 매개변수 캡처
- 구성 가능성 향상 - 잔류물 그룹 선택, 부지 반경 및 범주
- GUI용 Java Swing 기술
- 향후 개발을 위한 단순하고 확장 가능한 소프트웨어 아키텍처
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
자바 스윙
프로그래밍 언어
자바
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
