이것은 최신 릴리스를 meta_phat.tar.gz로 다운로드할 수 있는 MetaPhat -meta-pheno-association-tracker라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 MetaPhat -meta-pheno-association-tracker라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
기술
MetaPhat은 단변량 GWAS 연구의 요약 통계를 사용하여 다변량 연관이 있는 변형을 탐지하는 활성 및 오픈 소스(MIT 라이선스) 도구입니다. 또한 애플리케이션은 다변량 리드 변형에 대한 최적의 BIC 하위 집합 및 P-값 동인 특성을 찾아 분해를 수행합니다. 표현형-유전자형 관계를 해부하는 데 도움이 되도록 변형 결과를 추적하고 클러스터링합니다.설치 지침, 필수 GWAS 데이터 형식 및 테스트 명령을 사용한 예제 입력에 대해서는 wiki 홈을 참조하십시오. https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
글로벌 지질(GLGC, Willer 2013) 데이터/소스 타르 예 - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
예제를 시도하고 자습서를 읽은 후 문제가 발생하거나 기능 요청이 있는 경우 이메일을 보내주십시오. [이메일 보호]
저작권 <2019> [이메일 보호], [이메일 보호]
특징
- 다변량 게놈 차원의 특성 분석
- p-값 및 BIC 기반 최적 특성 하위 집합 선택
- 특성 분해 추적 플롯
- 리드 SNP 및 드라이버 특성 요약 파일
- snp-snp 특성 순위 창병 클러스터
이것은 https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.