이것은 mipgen_v15.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 MIPGen이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 MIPGen이라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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밉젠
기술
분자 상호 작용 전위 발생기
MIPGEN은 분자 상호 작용 전위 그리드를 계산하는 파이썬 프로그램입니다.
단백질 또는 작은 유기 화합물(약물)일 수 있는 주어진 분자에 대해.
출력은 사용자가 사용할 수 있는 DX 형식(*.dx)의 일련의 그리드입니다.
VMD, PyMol, Chimera와 같은 분자 시각화 프로그램을 사용하여 시각화...
종속성 및 사용법에 대한 자세한 내용은 설명서를 참조하십시오.
사용자는 BUGS & REQUESTS 메뉴에 버그나 요청을 게시할 수 있습니다. (sourceforge 계정이 필요합니다).
특징
- 간단한 PDB 파일이 주어지면 완전 자동 MIP 생성.
- 오픈 소스 코드. 사용자는 프로브를 확장하거나 코드를 개선하는 데 기여할 수 있습니다.
- 펩타이드 및 기타 거대분자 시스템에 대한 그리드 기반 분자 상호작용 전위 계산(대형 시스템의 경우 여전히 느릴 수 있음)
- 작은 분자에 대한 MIP 계산
- 맞춤형 프로브. 이미 구현됨: 소수성, H-결합 기증자, H-결합 수용자 및 정전기 프로브.
- 오픈 소스 Antechamber 및 AmbertTools 패키지의 tLeap과 인터페이스하여 소분자와 단백질에 대한 원자 유형의 자동 할당(http://ambermd.org)
오디언스 (Audience)
과학/연구, 고급 최종 사용자, 개발자, 최종 사용자/데스크톱
사용자 인터페이스
콘솔/터미널
프로그래밍 언어
Python
데이터베이스 환경
SQLite는
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/mipgen/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
