이것은 최신 릴리스를 PARSEC_Deployment_Package_v2.zip으로 다운로드할 수 있는 PARSEC - PAtteRn SEarch / Context라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
PARSEC - PAtteRn SEarch / Context with OnWorks라는 이름의 이 앱을 온라인에서 무료로 다운로드하고 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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PARSEC - 패턴 검색 / 컨텍스트
기술
게놈 사이트의 특성화는 차세대 시퀀싱 데이터를 이해하고 활용하는 데 있어 주요 과제입니다. 대부분의 게놈 부위는 산재된 분포와 때로는 생물학적 기능(예: 유전자 발현 조절, 스플라이싱 패턴 또는 후생유전학 신호)이 있는 짧고 퇴화된 모티프로 표현됩니다. 이러한 모티프는 엄청난 양의 노이즈와 연관되어 있기 때문에 정확한 게놈 부위 검출을 위한 전산 플랫폼의 개발은 오탐을 걸러내기 위해 다양한 대규모 생물학적 데이터의 통합이 필요합니다.
PARSEC는 사용자 친화적인 환경에서 생물학적 위치의 비선형 지역화 및 특성화를 수행하기 위해 다양한 게놈 정보를 효율적으로 통합하기 위한 직관적인 모듈식(쉽게 확장 가능) 올인원 솔루션을 나타냅니다.
하드웨어 요구 사항 및 지원되는 브라우저는 wiki를 참조하십시오.
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
웹 기반
프로그래밍 언어
C++, 자바
데이터베이스 환경
JDBC, MySQL, PostgreSQL(pgsql)
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.