이것은 ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 PPSeq: 병렬 NGS 분석이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
PPSeq: Parallel NGS Analysis라는 이름의 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks와 함께 Linux에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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PPSeq: 온라인에서 Linux에서 실행되는 병렬 NGS 분석
기술
고처리량 NGS(Next Generation Sequencing) 기술은 생물 의학 연구의 여러 측면에서 강력한 도구로 빠르게 부상했습니다. 그러나 NGS의 급속한 발전과 함께 NGS의 데이터 규모와 분석 복잡성은 독립 실행형 워크스테이션의 멀티스레딩 알고리즘과 같은 기존 소규모 컴퓨팅 시설의 용량과 기능을 훨씬 능가합니다. 이 문제를 해결하기 위해 여기에서는 MPP(Massive Parallel Processing) 시스템에 의해 계속 증가하는 처리 능력 공급을 사용하는 솔루션을 제시합니다.특징
- ppalgn - 긴 참조 시퀀스에 대한 시퀀싱 읽기 정렬
- ppbwt - 일련의 DNA 시퀀스에서 FM 인덱스 구축
오디언스 (Audience)
교육, 공학, 의료 산업, 정보 기술, 비영리 단체, 과학/연구
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
C + +
https://sourceforge.net/projects/ppseq/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
