이것은 최신 릴리스를 RNAseqR_1.1.tar.gz로 다운로드할 수 있는 RNAseqR이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 RNAseqR이라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행해 보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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RNAseqR
기술
RNAseqR은 RNA-seq 데이터의 발현 분석을 위해 설계되었으며 복제되지 않은 여러 라이브러리의 분석에 가장 적합합니다. 현재 Linux 시스템용으로 컴파일된 C++ 코딩 프로그램입니다.
GUI 및 명령줄 인터페이스를 통해 로그, PPM 및/또는 RPKM(길이가 제공된 경우) 변환은 물론 음의 이항 누적 분포 함수(CDF) 또는 R 테스트 통계를 사용하여 미분 표현에 대한 통계 분석을 수행할 수 있습니다. Stekel 등이 EST 분석을 위해 도입했습니다.
출력을 통해 CDF 확률, 상위 R 값 또는 R 값과 무작위 데이터의 비교를 기반으로 결정을 내릴 수 있습니다. 비교는 Stekel 등의 신뢰도 메트릭 또는 주어진 평균 표현에서 관찰된 R과 예상 R입니다. 무작위화는 포아송 또는 음이항 분포 또는 열 셔플링을 통해 이루어집니다.
프로그래밍 언어
C + +
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
