영어프랑스어스페인어

Ad


온웍스 파비콘

Linux용 rRNAFinder 다운로드

rRNAFinder Linux 앱을 무료로 다운로드하여 Ubuntu 온라인, Fedora 온라인 또는 Debian 온라인에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.

이것은 rRNAFinder-v1.1.1.zip으로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 rRNAFinder라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.

OnWorks가 포함된 rRNAFinder라는 이 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행하세요.

이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.

- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.

- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.

- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.

- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.

- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.

- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.

rRNAFinder


Ad


기술

rRNAFinder는 조립된 게놈/메타게놈 컨티그를 입력으로 사용하여 리보솜 RNA 유전자를 자동으로 예측하고 분류하는 데 사용할 수 있는 작은 펄 소프트웨어 패키지입니다. 이 소프트웨어는 Linux 운영 체제에서만 테스트되었습니다.

패키지에 포함된 "rRNAFinder.pl" 프로그램은 arc.hmm, bac.hmm 및 euk.hmm 데이터베이스를 검색하는 nhmmer 프로그램을 사용하여 입력 콘티그에서 rRNA 유전자를 식별합니다. 예측된 rRNA 유전자는 16S, 18S, 23S, 28S, 5S 및 5.8S rRNA 유전자를 포함합니다.

"rna2taxon.pl" 프로그램은 위에서 생성된 fasta 형식 rRNA 유전자 서열을 입력 유전자에 대한 분류학적 할당을 생성하기 위한 입력으로 받아들입니다. 입력 rRNA 유전자 서열은 blastn을 사용하여 다운로드 및 재포맷된 SILVA SSU 및 LSU 데이터베이스에 대해 검색됩니다.

rRNAFinder GitHub 리포지토리의 README.md 파일을 참조하십시오. https://github.com/xiaoli-dong/rRNAFinder rRNAFinder 구성 및 실행 지침



특징

  • rRNA 유전자 예측(5s, 5.8s, 16s, 18s, 23s, 28s rRNA 유전자)
  • SILVA SSU 및 LSU 데이터베이스에 대한 blastn 검색을 사용하여 예측된 rRNA 유전자의 분류학적 할당
  • 빠르고 여러 CPU 스레드를 사용할 수 있습니다.


오디언스 (Audience)

과학/연구


사용자 인터페이스

명령줄



카테고리

생명정보학

이것은 https://sourceforge.net/projects/rrnafinder/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.


무료 서버 및 워크스테이션

Windows 및 Linux 앱 다운로드

  • 1
    통음
    통음
    SWIG는 소프트웨어 개발 도구입니다.
    C로 작성된 프로그램과
    다양한 고급 수준의 C++
    프로그래밍 언어. SWIG는 다음과 함께 사용됩니다.
    다른...
    SWIG 다운로드
  • 2
    WooCommerce Nextjs 반응 테마
    WooCommerce Nextjs 반응 테마
    React WooCommerce 테마,
    다음 JS, Webpack, Babel, Node 및
    GraphQL 및 Apollo를 사용한 Express
    고객. React의 WooCommerce 스토어(
    포함: 제품...
    WooCommerce Nextjs 반응 테마 다운로드
  • 3
    Archlabs_repo
    Archlabs_repo
    ArchLabs용 패키지 저장소 이것은
    가져올 수 있는 응용 프로그램

    https://sourceforge.net/projects/archlabs-repo/.
    그것은 OnWorks에서 호스팅되었습니다 ...
    archlabs_repo 다운로드
  • 4
    제퍼 프로젝트
    제퍼 프로젝트
    Zephyr 프로젝트는 새로운 세대입니다.
    실시간 운영체제(RTOS)
    여러 하드웨어 지원
    아키텍처. 그것은
    작은 크기의 커널...
    Zephyr 프로젝트 다운로드
  • 5
    SC콘
    SC콘
    SCons는 소프트웨어 구축 도구입니다.
    그것은에 대한 우수한 대안입니다
    고전적인 "만들기" 빌드 도구
    우리 모두는 알고 사랑합니다. 스콘은
    구현 ...
    SCons 다운로드
  • 6
    PSeInt
    PSeInt
    PSeInt는 의사 코드 해석기입니다.
    스페인어를 구사하는 프로그래밍 학생.
    주요 목적은 다음을 위한 도구가 되는 것입니다.
    기본을 배우고 이해하기
    개념...
    PSeInt 다운로드
  • 더»

Linux 명령

Ad