Wellmeth-1.0.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 WellMeth라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks가 포함된 WellMeth라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
웰메스
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기술
WellMeth는 감소된 표현 Bisulfite-Seq 분석을 위한 통합 프레임워크입니다.
기능
- 게놈 DNA에서 메틸화된 시토신 검출에 대한 GBS(Genotyping by Sequencing) 접근 방식을 확장합니다.
- 고품질 참조 게놈의 가용성에 의존하고 라이브러리 구성을 위해 XNUMX개의 메틸화 비감수성 효소를 사용한 이중 제한 분해가 권장됩니다.
- 페어드 엔드 짧은 판독 시퀀싱의 경우 비대칭 정방향 및 역방향 어댑터가 4~6nt 길이의 바코드와 바코드에 인접한 고정된 수의 무작위 뉴클레오티드(Unique Molecular Identifiers, UMI)와 함께 적용됩니다.
- UMI 정보는 PCR 중복물의 정렬 후 식별에 사용됩니다.
- 전처리, 매핑, 메틸화 변형 감지 및 차등 메틸화의 XNUMX개 오버레이 모듈로 구성됩니다.
- 모듈은 완전히 자동화된 실행을 허용하는 사용자 정의 가능한 래퍼 스크립트로 상호 연결됩니다.
- 빠르고 정확하고 가벼운
사용자 인터페이스
콘솔/터미널
카테고리
생명정보학
이는 https://sourceforge.net/projects/wellmeth/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 시스템 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
