clusterProfiler라는 Windows 앱이며, 최신 릴리스는 clusterProfilersourcecode.tar.gz 파일로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
clusterProfiler라는 앱을 OnWorks와 함께 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행해보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린 샷
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클러스터프로파일러
기술
clusterProfiler는 고처리량 오믹스 결과를 해석하기 위한 기능적 농축 분석을 위한 통합 워크플로를 제공하는 R/Bioconductor 패키지입니다. 과대표성 분석과 유전자 집합 농축 분석을 모두 지원하여, 차등 파이프라인에서 순위가 매겨지지 않은 유전자 목록이나 순위가 매겨진 통계를 다룰 수 있습니다. 이 패키지는 일관된 인터페이스를 통해 Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH 등 다양한 지식 베이스와 연결되므로 코드를 다시 작성하지 않고도 다양한 생물학적 관점을 쿼리할 수 있습니다. 지속적으로 업데이트되는 주석을 활용하여 코딩 및 비코딩 특징과 수천 개의 유기체를 포괄하는 광범위한 기능을 제공하도록 설계되었습니다. 결과는 깔끔하고 조작하기 쉬운 구조로 반환되며, 경로, 용어 및 유전자 집합 관계를 요약하는 풍부한 시각화 기능(컴패니언 툴링 사용)과 자연스럽게 연동됩니다.
기능
- 여러 주석 소스에 걸친 통합 ORA 및 GSEA 워크플로
- 최신 유전자 주석을 사용한 광범위한 종 지원
- 다운스트림 R 데이터 파이프라인과 깔끔하게 통합되는 깔끔한 출력
- 동반 플로팅 도구를 통한 농축 결과의 내장된 시각화
- 교차 조건 분석을 위한 다중 그룹 비교 유틸리티(예: compareCluster)
- 재현 가능한 종단 간 농축 연구를 위한 자세한 비네트 및 매뉴얼
프로그래밍 언어
R
카테고리
이 애플리케이션은 https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/에서도 다운로드할 수 있습니다. OnWorks에 호스팅되어 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉽게 온라인에서 실행할 수 있도록 설계되었습니다.
