์ด๊ฒ์ ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ pan2hgenev2.jar๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ Pan1.9Hgene Software๋ผ๋ Windows ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
OnWorks์ ํจ๊ป Pan2Hgene Software๋ผ๋ ์ฑ์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ์ญ์์ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ ๋ชจ๋ OS OnWorks ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํ์ง๋ง ๋ ๋์ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Windows OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํฉ๋๋ค.
- 7. Linux ๋ฐฐํฌ ์ํํธ์จ์ด ์ ์ฅ์์์ Wine์ ๋ค์ด๋ก๋ํฉ๋๋ค. ์ค์น๊ฐ ์๋ฃ๋๋ฉด ์ฑ์ ๋ ๋ฒ ํด๋ฆญํ์ฌ Wine๊ณผ ํจ๊ป ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ธ๊ธฐ ์๋ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ ๋ฐ ๊ฒ์์ ์ค์นํ๋ ๋ฐ ๋์์ด ๋๋ Wine์ ํตํ ๋ฉ์ง ์ธํฐํ์ด์ค์ธ PlayOnLinux๋ฅผ ์ฌ์ฉํด ๋ณผ ์๋ ์์ต๋๋ค.
Wine์ Linux์์ Windows ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ์คํํ๋ ๋ฐฉ๋ฒ์ด์ง๋ง Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์์ต๋๋ค. Wine์ ๋ชจ๋ Linux ๋ฐ์คํฌํ์์ ์ง์ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋ ์คํ ์์ค Windows ํธํ์ฑ ๊ณ์ธต์ ๋๋ค. ๋ณธ์ง์ ์ผ๋ก Wine์ Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์๊ณ ๋ชจ๋ Windows ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋๋ก Windows๋ฅผ ์ฒ์๋ถํฐ ์ถฉ๋ถํ ๋ค์ ๊ตฌํํ๋ ค๊ณ ํฉ๋๋ค.
์คํฌ๋ฆฐ ์ท
Ad
Pan2Hgene ์ํํธ์จ์ด
๊ธฐ์
์์ ํ ๊ฒ๋๊ณผ ์ด์ ๊ฒ๋ ๋ชจ๋์ ๋ํ ์๋ํ๋ ๋น๊ต ๋ถ์๊ณผ ํจ๊ป ์๋ ๊ฒ๋ ์์ด์์ ๋๋ฝ๋ ์ ์ ์ ์ฐ๋ฌผ์ ์๋ณ์ ํ์ฉํ๋ ๊ณ์ฐ ๋๊ตฌ์ธ PAN2HGENE์ ์ฌ์ฉํ์ฌ ์ด๋ฌํ ์ ํ์ ํด๊ฒฐํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ด ์ฐ๊ตฌ์์ PAN2HGENE์ ์๋ก์ด ์ ํ์ ์๋ณํ๋ ๋ฐ ์ฌ์ฉ๋์์ผ๋ฉฐ ๊ฒฐ๊ณผ์ ์ผ๋ก ์๋ ๊ฒ๋ ์์ด์ ๋ณ๊ฒฝํ์ง ์๊ณ ํฌ๊ฒ๋์ ์ํ ๊ฐ ๋์์ ๋ณ๊ฒฝํ์ต๋๋ค. ์ฐ๋ฆฌ์ ์ฐ๊ตฌ ๊ฒฐ๊ณผ์ ๋ฐ๋ฅด๋ฉด ์ด ๋๊ตฌ๋ ๊ฐ๋จํ๊ณ ์ง๊ด์ ์ธ ๊ทธ๋ํฝ ์ธํฐํ์ด์ค๋ฅผ ํตํด ๋น๊ต ๋ถ์์ ์ํ ํจ์จ์ ์ธ ๋์์ ๋ํ๋ ๋๋ค.
ํน์ง
- pan2hgene ๋ฒ์ 1.6์์ ๊ณ ์ ์ ์ ์, ์ก์ธ์๋ฆฌ ๊ฒ๋ ๋ฐ ํต์ฌ ๊ฒ๋์ ๋ํ ๋ณด๊ณ ์๋ฅผ ์์ฑํฉ๋๋ค. FASTA ํ์์ ๋ชจ๋ ์ํ์ค์ ๊ฐ์ต๋๋ค.
- RAST ๋ฐฐ์น ์ธํฐํ์ด์ค์ ์ค๋จ์ผ๋ก ์ธํด pan2gene 1.8์ ์ฃผ์ ํ๋ก์ธ์ค๋ฅผ ์ํํ๊ธฐ ์ํด Prokka์ Patrick์ด๋ผ๋ ๋ ๊ฐ์ ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ์ฑํํ์ต๋๋ค. ์ฌ์ฉ์๋ ๊ทธ๋ํฝ ์ธํฐํ์ด์ค ๋ด์์ ์์ ๋กญ๊ฒ ์ ํํ ์ ์์ต๋๋ค.
- tbl2asn ์ํํธ์จ์ด์ ๋ฌธ์ ๊ฐ ์๋ ๊ฒฝ์ฐ ๋ฐฉ๋ฒ ํ์ผ์์ ๋ฌธ์ ํด๊ฒฐ ์ง์นจ์ ์ฌ์ฉํ ์ ์์ต๋๋ค.
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/pan2hgene-software/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ์ฐ๋ฆฌ์ ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.