ນີ້ແມ່ນ bamtools ຄໍາສັ່ງທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
bamtools - ເຄື່ອງມືສໍາລັບການຈັດການໄຟລ໌ BAM (ການຈັດລໍາດັບ genome).
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ເຄື່ອງມືໄມ້ໄຜ່ [--help] ຄໍາສັ່ງ [ARGS]
ລາຍລະອຽດ
BamTools ອຳນວຍຄວາມສະດວກໃນການວິເຄາະການຄົ້ນຄວ້າ ແລະການຈັດການຂໍ້ມູນໂດຍໃຊ້ໄຟລ໌ BAM. ມັນຮັບມືກັບ
ຂໍ້ມູນຈໍານວນຫຼວງຫຼາຍທີ່ຜະລິດໂດຍເຕັກໂນໂລຊີການຈັດລໍາດັບໃນປະຈຸບັນທີ່ເປັນປົກກະຕິ
ເກັບຮັກສາໄວ້ຢູ່ໃນຮູບແບບຖານສອງທີ່ບີບອັດ ທີ່ບໍ່ຖືກຈັດການໄດ້ງ່າຍໂດຍຕົວແຍກວິເຄາະຂໍ້ຄວາມ
ຖືກນໍາໃຊ້ທົ່ວໄປໃນການຄົ້ນຄວ້າ bioinformatics.
OPTIONS
ແປງ
ແປງລະຫວ່າງ BAM ແລະຮູບແບບອື່ນໆຈໍານວນຫນຶ່ງ
ນັບຈໍານວນການພິມຂອງການຈັດວາງໃນໄຟລ໌ BAM
ການຄຸ້ມຄອງ
ພິມສະຖິຕິການຄຸ້ມຄອງຈາກໄຟລ໌ BAM ທີ່ປ້ອນເຂົ້າ
ການກັ່ນຕອງການກັ່ນຕອງໄຟລ໌ BAM ໂດຍເງື່ອນໄຂທີ່ຜູ້ໃຊ້ກໍານົດ
header ພິມ BAM header ຂໍ້ມູນ
index ສ້າງດັດສະນີສໍາລັບໄຟລ໌ BAM
ລວມໄຟລ໌ BAM ຫຼາຍໄຟລ໌ເຂົ້າໄປໃນໄຟລ໌ດຽວ
random ເລືອກການຈັດຮຽງແບບສຸ່ມຈາກໄຟລ໌ BAM ທີ່ມີຢູ່ແລ້ວ, ມີຈຸດປະສົງເພີ່ມເຕີມເປັນການທົດສອບ
ເຄື່ອງມື.
ແກ້ໄຂ
ແກ້ໄຂການອ່ານຄູ່ທ້າຍ (ຫມາຍທຸງ IsProperPair ຕາມທີ່ຈໍາເປັນ)
revert ລົບເຄື່ອງຫມາຍທີ່ຊ້ໍາກັນແລະຟື້ນຟູຄຸນນະພາບພື້ນຖານຕົ້ນສະບັບ
sort ຈັດຮຽງໄຟລ໌ BAM ຕາມເງື່ອນໄຂບາງຢ່າງ
ແຍກ Splits ໄຟລ໌ BAM ໃນຄຸນສົມບັດທີ່ຜູ້ໃຊ້ກໍານົດ, ສ້າງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ BAM ໃຫມ່ສໍາລັບ
ແຕ່ລະຄ່າທີ່ພົບເຫັນ
ສະຖິຕິພິມສະຖິຕິພື້ນຖານບາງຢ່າງຈາກການປ້ອນໄຟລ໌ BAM
ເບິ່ງ 'bamtools help Command' ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບຄໍາສັ່ງສະເພາະ.
ໃຊ້ bamtools ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
