ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ bp_sreformatp ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
bpsreformat - ປ່ຽນຮູບແບບລໍາດັບ
ລາຍລະອຽດ
ສະຄຣິບນີ້ໃຊ້ລະບົບ SeqIO ທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ປ່ຽນຮູບແບບລໍາດັບ
ຂໍ້ມູນລໍາດັບຫຼືຂໍ້ມູນການຈັດລໍາດັບຫຼາຍ. ຊື່ມາຈາກຄວາມຈິງທີ່ວ່າ Sean
Eddy's program sreformat (ສ່ວນຫນຶ່ງຂອງ HMMER pkg) ເຮັດແບບນີ້ແລ້ວ. ໂຄງການ Sean ພະຍາຍາມ
ເພື່ອຄາດເດົາຮູບແບບການປ້ອນຂໍ້ມູນໃນຂະນະທີ່ຢູ່ໃນລະຫັດຂອງພວກເຮົາໃນປັດຈຸບັນພວກເຮົາຕ້ອງການໃຫ້ທ່ານລະບຸວ່າແມ່ນຫຍັງ
ຮູບແບບການປ້ອນຂໍ້ມູນແລະຜົນຜະລິດແມ່ນແລະຖ້າຫາກວ່າຂໍ້ມູນແມ່ນມາຈາກການຈັດລຽງລໍາດັບຫຼາຍຫຼືຈາກ
ໄຟລ໌ລໍາດັບຊື່.
ການນໍາໃຊ້:
bpsreformat -if INFORMAT -of OUTFORMAT -i FILENAME -o output.FORMAT
-h/--help ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອນີ້
-if/--informat ລະບຸຮູບແບບການປ້ອນຂໍ້ມູນ
-of/--outformat ລະບຸຮູບແບບຜົນຜະລິດ
-i/--input ລະບຸຊື່ໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ
(ເພື່ອສົ່ງຂໍ້ມູນໃນ STDIN ໃຊ້ເຄື່ອງໝາຍລົບເປັນຊື່ໄຟລ໌)
-o/--output ລະບຸຊື່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ
(ເພື່ອສົ່ງຂໍ້ມູນອອກໃນ STDOUT ໃຊ້ເຄື່ອງຫມາຍລົບເປັນຊື່ໄຟລ໌)
--msa ລະບຸວ່ານີ້ແມ່ນຂໍ້ມູນການຈັດລໍາດັບຫຼາຍອັນ
--special ຈະສົ່ງຕໍ່ຕົວກໍານົດການພິເສດໃຫ້ກັບ AlignIO/SeqIO
ວັດຖຸ -- ສ່ວນໃຫຍ່ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນສໍາລັບວັດຖຸ Bio::AlignIO
ບັນຊີລາຍຊື່ທີ່ແຍກດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດຕໍ່ໄປນີ້
nointerleaved -- ສໍາລັບ phylip, ຮູບແບບທີ່ບໍ່ແມ່ນ interleaved
idlinebreak -- ສໍາລັບ phylip, ເຮັດໃຫ້ມັນເປັນຮູບແບບ molphy
ເປີເຊັນ -- ສໍາລັບ clustalw, ສະແດງ %id ຕໍ່ແຖວ
ໃຊ້ bp_sreformatp ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
