cluster3 - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

cluster3 — ການ​ຈັດ​ກຸ່ມ Eisen ຂອງ​ຂໍ້​ມູນ microarray​

ສະຫຼຸບສັງລວມ

ກຸ່ມ 3 [-f ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ] [-l 0|1] [-u ຊື່ວຽກ] [-g [0..9]] [-e [0..9]] [-m [msca]] [-k
ຈໍານວນ] [-s 0|1] [-x ຈໍານວນ] [-y ຈໍານວນ]

OPTIONS

-h--ຊ່ວຍ ສະແດງສະຫຼຸບຂອງທາງເລືອກ.

-f ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ
ການ​ຕັ້ງ​ໄຟລ​໌​

-u ຊື່ວຽກ
ອະນຸຍາດໃຫ້ທ່ານລະບຸຊື່ທີ່ແຕກຕ່າງກັນສໍາລັບໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນມາຈາກ
ຈາກ​ຊື່​ໄຟລ​໌​ປ້ອນ​ຂໍ້​ມູນ​)

-l 0 | 1 ລະບຸວ່າຈະ log-transform ຂໍ້ມູນຫຼືບໍ່ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 0, ບໍ່ມີ log-transform)

-k ຈໍານວນ ລະບຸວ່າຈະເປີດໃຊ້ k-means clustering ແທນການຈັດກຸ່ມຕາມລຳດັບຫຼືບໍ່,
ແລະຈໍານວນກຸ່ມ k ທີ່ຈະໃຊ້ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0)

-x ຈໍານວນ ລະບຸຂະໜາດລວງນອນຂອງຕາຂ່າຍ SOM (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 2)

-y ຈໍານວນ ລະບຸຂະໜາດແນວຕັ້ງຂອງຕາຂ່າຍ SOM (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1)

-s 0 | 1 ລະບຸວ່າຈະຄິດໄລ່ SOM ແທນການຈັດກຸ່ມຕາມລຳດັບຫຼືບໍ່
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0)

-v - ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງເວີຊັນຂອງໂຄງການ.

-g [0..9] ລະບຸໄລຍະຫ່າງຂອງ gene clustering 0: ບໍ່ມີ gene clustering 1:
Uncentered correlation 2: Pearson correlation 3: Uncentered correlation, ຄ່າຢ່າງແທ້ຈິງ 4:
Pearson correlation, ຄ່າຢ່າງແທ້ຈິງ 5: Spearman's correlation 6: Kendall's tau 7:
ໄລຍະຫ່າງ Euclidean 8: ໄລຍະຫ່າງ Euclidean ສະຫຼຸບຄວາມກົມກຽວກັນ 9: ໄລຍະຫ່າງຂອງເມືອງ.
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1)

-e [0..9] ລະບຸໄລຍະຫ່າງຂອງ microarray clustering 0: ບໍ່ມີ clustering 1:
Uncentered correlation 2: Pearson correlation 3: Uncentered correlation, ຄ່າຢ່າງແທ້ຈິງ 4:
Pearson correlation, ຄ່າຢ່າງແທ້ຈິງ 5: Spearman's correlation 6: Kendall's tau 7:
ໄລຍະຫ່າງ Euclidean 8: ໄລຍະຫ່າງ Euclidean ສະຫຼຸບຄວາມກົມກຽວກັນ 9: ໄລຍະຫ່າງຂອງເມືອງ.
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0)

-m [msca] ລະບຸວິທີການຈັດກຸ່ມຕາມລຳດັບທີ່ຈະໃຊ້ m: Pairwise complete-
linkage s: Pairwise single-linkage c: Pairwise centroid-linkage a: Pairwise average-
ການເຊື່ອມໂຍງ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: m)

ໃຊ້ cluster3 ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ການບໍລິການ onworks.net