ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ contig_drawp ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
search_overview -- ສະເໜີລາຍງານຕົວວິເຄາະ SearchIO ໃຫ້ເປັນຮູບພາບລວມທີ່ງ່າຍດາຍ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
search_overview -i filename [-f format] [-o outputfilename] [--labels]
ລາຍລະອຽດ
script ນີ້ຈະເອົາບົດລາຍງານ Bio::SearchIO parseable ແລະປ່ຽນເປັນແບບງ່າຍໆ
ພາບລວມຂອງບົດລາຍງານ. ສໍາລັບຈຸດປະສົງຂອງພວກເຮົາ, ພວກເຮົາສົມມຸດວ່າ BLAST ແລະລະເບີດ
ຄະແນນເມື່ອກຳນົດສີ. ຜົນຜະລິດແມ່ນໄຟລ໌ຮູບແບບ PNG.
ອັນນີ້ບໍ່ໄດ້ຕັ້ງໃຈເປັນສະຄຣິບທີ່ກຳນົດເອງຫຼາຍເກີນໄປ, ແຕ່ມັນອາດຈະເປັນພຽງແຕ່
ບໍ່ວ່າຈະເປັນການເບິ່ງທີ່ໄວແລະເປື້ອນຢູ່ໃນບົດລາຍງານຫຼືຈຸດເລີ່ມຕົ້ນສໍາລັບຄວາມສັບສົນຫຼາຍ
ການຈັດຕັ້ງປະຕິບັດ.
ສີແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍຄະແນນຕີທີ່ປະຈຸບັນໄດ້ຖືກ pegged ກັບໂຄງການ NCBI
ເຊິ່ງເບິ່ງຄືວ່ານີ້
ສີແດງ E = 200
ສີມ່ວງ 80-200
ສີຂຽວ 50-80
ຄຳ ຂາວ 40-50
ດຳ E 40
ຕົວເລືອກ:
-i/--input ຊື່ໄຟລ໌ input, ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນ input ແມ່ນສົມມຸດວ່າ STDIN -o/--output
ຊື່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ, ນີ້ແມ່ນທາງເລືອກ, ຖ້າທ່ານບໍ່ເຮັດ
ໃຫ້ຊື່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ສະຄຣິບຈະສ້າງໄຟລ໌
ການນໍາໃຊ້ຊື່ຂອງລໍາດັບການສອບຖາມແລະຈະດໍາເນີນການ
ລໍາດັບທັງຫມົດໃນໄຟລ໌. ຖ້າຊື່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ
IS ສະຫນອງໃຫ້ສະຄິບຈະສະແດງພຽງແຕ່ຮູບພາບສໍາລັບການ
ອັນທໍາອິດ.
-f/--format ຕົວວິເຄາະຮູບແບບ SearchIO ທີ່ຈະໃຊ້, ຖ້າບໍ່ໄດ້ສະໜອງໃຫ້
SearchIO ຈະຄາດເດົາໂດຍອີງໃສ່ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌.
-l/--labels ສະແດງຊື່ລໍາດັບ hit ເປັນປ້າຍຊື່ໃນພາບລວມ.
ສໍາລັບຫຼາຍໆລໍາດັບນີ້ຈະເຮັດໃຫ້ຮູບພາບຍາວຫຼາຍ
ດັ່ງນັ້ນໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນມັນຖືກປິດ.
ຜູ້ຂຽນ Jason Stajich
Jason Stajich, jason[-at-]open-bio[-dot-]org.
ໃຊ້ contig_drawp ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
