ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ createChemistryHeader ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
createChemistryHeader.py - ສ້າງສ່ວນຫົວ SAM ກັບ PacBio sequencing chemistry
ຂໍ້ມູນຂ່າວສານ
ລາຍລະອຽດ
ການນໍາໃຊ້: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
input_alignment_file output_header_file
createChemistryHeader ສ້າງສ່ວນຫົວ SAM ທີ່ປະກອບດ້ວຍຂໍ້ມູນເຄມີທີ່ໃຊ້ໂດຍ
Quiver.
ຕຳ ແໜ່ງ ການໂຕ້ຖຽງ:
input_alignment_file
ໄຟລ໌ SAM ຫຼື BAM ທີ່ຜະລິດໂດຍ BLASR.
output_header_file
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ຫົວ SAM ຫຼື BAM ທີ່ຈະຖືກສ້າງຂື້ນດ້ວຍຂໍ້ມູນເຄມີ
ໂຫຼດແລ້ວ.
ທາງເລືອກ ການໂຕ້ຖຽງ:
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ
--debug
ສົ່ງຂໍ້ມູນບັນທຶກລາຍລະອຽດ. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ຖືກຕ້ອງ)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
ໄຟລ໌ bas ຫຼື bax ທີ່ປະກອບດ້ວຍການອ່ານທີ່ສອດຄ່ອງຢູ່ໃນ
input_alignment_file. ຍັງສາມາດເປັນ fofn ຂອງໄຟລ໌ bas ຫຼື bax. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ມີ)
ໃຊ້ createChemistryHeader ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
