dcmstack - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

dcmstack - DICOM ເປັນ NIFTI ແປງ

ລາຍລະອຽດ

ການນໍາໃຊ້: dcmstack [-h] [--force-read] [--file-ext FILE_EXT] [--allow-dummies]

[--dest-dir DEST_DIR] [-o OUTPUT_NAME] [--output-ext OUTPUT_EXT] [-d]
[--embed-meta] [-g GROUP_BY] [--voxel-order VOXEL_ORDER] [-t TIME_VAR]
[--vector-var VECTOR_VAR] [--time-order TIME_ORDER] [--vector-order VECTOR_ORDER]
[-l] [--disable-translator DISABLE_TRANSLATOR] [--extract-private] [-i
INCLUDE_REGEX] [-e EXCLUDE_REGEX] [--default-regexes] [-v] [--strict] [--version]
[src_dirs [src_dirs ...]]

ວາງໄຟລ໌ DICOM ຈາກແຕ່ລະໄດເລກະທໍລີແຫຼ່ງເຂົ້າໄປໃນປະລິມານ 2D ຫາ 5D, ທາງເລືອກໃນການສະກັດ
ຂໍ້ມູນ meta.

ຕຳ ແໜ່ງ ການໂຕ້ຖຽງ:
src_dirs
ໄດເລກະທໍລີແຫຼ່ງທີ່ປະກອບດ້ວຍໄຟລ໌ DICOM.

ທາງເລືອກ ການໂຕ້ຖຽງ:
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ

ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ຕົວເລືອກ:
--force-read
ລອງອ່ານໄຟລ໌ທັງໝົດເປັນ DICOM, ເຖິງແມ່ນວ່າພວກມັນຈະຂາດຄຳນຳ.

--file-ext FILE_EXT
ພຽງແຕ່ພະຍາຍາມອ່ານໄຟລ໌ທີ່ມີນາມສະກຸນທີ່ໃຫ້. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: .dcm

--allow-dummies
ອະ​ນຸ​ຍາດ​ໃຫ້​ໄຟລ​໌ DICOM ທີ່​ຂາດ​ໄປ​ຂໍ້​ມູນ pixels ລວງ, ຕື່ມ​ຂໍ້​ມູນ​ໃສ່​ພາກ​ສ່ວນ​ຂອງ​ຜົນ​ໄດ້​ຮັບ
nifti ທີ່ມີຄ່າທີ່ເປັນຕົວແທນສູງສຸດ.

ຜົນຜະລິດ ຕົວເລືອກ:
--dest-dir DEST_DIR
ໄດເຣັກທໍຣີປາຍທາງ, ເລີ່ມຕົ້ນເປັນໄດເຣັກທໍຣີແຫຼ່ງທີ່ມາ.

-o OUTPUT_NAME, --output-name OUTPUT_NAME
ສະຕຣິງຮູບແບບ Python ກໍານົດຊື່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດໂດຍອີງໃສ່ແທັກ DICOM.

--output-ext OUTPUT_EXT
ສ່ວນຂະຫຍາຍສໍາລັບປະເພດໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: .nii.gz

-d, --dump-meta
ຖິ້ມຂໍ້ມູນ meta ທີ່ຖືກສະກັດເຂົ້າໄປໃນໄຟລ໌ JSON ທີ່ມີຊື່ພື້ນຖານດຽວກັນກັບ
ສ້າງ Nifti

--embed-meta
ຝັງຂໍ້ມູນ meta ທີ່ສະກັດອອກມາເຂົ້າໄປໃນສ່ວນຂະຫຍາຍຫົວ Nifti (ໃນຮູບແບບ JSON).

Stacking ຕົວເລືອກ:
-g GROUP_BY, --ກຸ່ມໂດຍ GROUP_BY
ບັນຊີລາຍຊື່ທີ່ແຍກກັນດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດຂອງລະຫັດຂໍ້ມູນ meta ເພື່ອຈັດກຸ່ມໄຟລ໌ປ້ອນເຂົ້າເປັນ stacks ກັບ.

--voxel-order VOXEL_ORDER
ສັ່ງ voxels ເພື່ອໃຫ້ຕົວຊີ້ວັດທາງກວ້າງຂອງພື້ນທີ່ເລີ່ມຕົ້ນຈາກທິດທາງເຫຼົ່ານີ້ຢູ່ໃນຄົນເຈັບ
ຊ່ອງ. ທິດທາງໃນພື້ນທີ່ຂອງຄົນເຈັບຄວນຈະເປັນລະຫັດສາມຕົວອັກສອນ:
(l) ຊ້າຍ, (r) ຂວາ, (ກ) ພາຍນອກ, (p) ຂ້າງຫຼັງ, (s) ດ້ານເທິງ, (i) ຕ່ໍາກວ່າ. ຜ່ານເປົ່າຫວ່າງ
ສະຕຣິງຈະປິດການວາງທິດທາງຄືນໃໝ່. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: LAS

-t TIME_VAR, --time-var TIME_VAR
ຄໍາສໍາຄັນອົງປະກອບ DICOM ທີ່ຈະໃຊ້ສໍາລັບການສັ່ງ stack ຕາມຂະຫນາດເວລາ.

--vector-var VECTOR_VAR
ຄໍາສໍາຄັນອົງປະກອບ DICOM ທີ່ຈະໃຊ້ສໍາລັບການສັ່ງ stack ຕາມຂະຫນາດ vector.

--ສັ່ງເວລາ TIME_ORDER
ໃຫ້ໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມທີ່ມີຄໍາສັ່ງທີ່ຕ້ອງການສໍາລັບຄ່າ (ຫນຶ່ງຕໍ່ແຖວ) ຂອງ
ຄຸນລັກສະນະທີ່ໃຊ້ເປັນຕົວແປເວລາ. ທາງເລືອກນີ້ບໍ່ຄ່ອຍຈໍາເປັນ.

--vector-order VECTOR_ORDER
ໃຫ້ໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມທີ່ມີຄໍາສັ່ງທີ່ຕ້ອງການສໍາລັບຄ່າ (ຫນຶ່ງຕໍ່ແຖວ) ຂອງ
ຄຸນລັກສະນະທີ່ໃຊ້ເປັນຕົວແປ vector. ທາງເລືອກນີ້ບໍ່ຄ່ອຍຈໍາເປັນ.

Meta ການຂຸດຄົ້ນ ແລະ ການກັ່ນຕອງ ຕົວເລືອກ:
-l, --list-ນັກແປ
ລາຍຊື່ຜູ້ແປທີ່ເປີດໃຊ້ແລ້ວແລະອອກ

--disable-ນັກແປ DISABLE_TRANSLATOR
ປິດການໃຊ້ງານຕົວແປສຳລັບແທັກທີ່ສະໜອງໃຫ້. ແທັກຄວນຈະຖືກໃຫ້ໃນຮູບແບບ
"0x0_0x0". ສາມາດໃຫ້ຫຼາຍກວ່າໜຶ່ງໃນລາຍການທີ່ແຍກດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດ. ຖ້າຄໍາວ່າ "ທັງຫມົດ"
ສະຫນອງໃຫ້, ນັກແປທັງຫມົດຈະຖືກປິດໃຊ້ງານ.

--ສະກັດ-ເອກະຊົນ
ສະກັດຂໍ້ມູນ meta ຈາກອົງປະກອບສ່ວນຕົວ, ເຖິງແມ່ນວ່າບໍ່ມີນັກແປ. ຖ້າ
ຄ່າສໍາລັບອົງປະກອບປະກອບດ້ວຍ non-ascii bytes ມັນຈະຍັງຖືກລະເລີຍ. ໄດ້
ຂໍ້ມູນ meta ທີ່ສະກັດອອກມາອາດຈະຍັງຖືກກັ່ນຕອງອອກໂດຍການສະແດງອອກປົກກະຕິ.

-i INCLUDE_REGEX, --include-regex INCLUDE_REGEX
ລວມເອົາຂໍ້ມູນ meta ໃດໆທີ່ລະຫັດກົງກັບການສະແດງຜົນປົກກະຕິທີ່ສະຫນອງໃຫ້. ນີ້
ຈະ override ໃດ exclude expressions. ນຳໃຊ້ກັບຂໍ້ມູນ meta ທັງໝົດ.

-e EXCLUDE_REGEX, --exclude-regex EXCLUDE_REGEX
ບໍ່ລວມຂໍ້ມູນ meta ໃດໆທີ່ລະຫັດກົງກັບການສະແດງຜົນປົກກະຕິທີ່ສະຫນອງໃຫ້. ນີ້
ຈະເພີ່ມຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ exclude expressions. ນຳໃຊ້ກັບຂໍ້ມູນ meta ທັງໝົດ.

--default-regexes
ພິມລາຍການຂອງຄ່າເລີ່ມຕົ້ນລວມມີ ແລະບໍ່ລວມການສະແດງອອກປົກກະຕິ ແລະອອກ.

ໂດຍ​ທົ່ວ​ໄປ ຕົວເລືອກ:
-v, -- verbose
ພິມຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ.

--ເຄັ່ງຄັດ
ລົ້ມເຫລວໃນຂໍ້ຍົກເວັ້ນທໍາອິດແທນທີ່ຈະສະແດງຄໍາເຕືອນ.

- ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງສະບັບແລະອອກ.

ມັນເປັນຄວາມຮັບຜິດຊອບຂອງເຈົ້າທີ່ຈະຮູ້ວ່າມີຂໍ້ມູນສຸຂະພາບສ່ວນຕົວຢູ່ໃນ METADATA
ສະກັດໂດຍໂຄງການນີ້.

ໃຊ້ dcmstack ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net