demux - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

demux - ປ່ຽນການຢັບຢັ້ງໄລຍະຫ່າງ XPLOR ເປັນຮູບແບບ Gromacs

ສະຫຼຸບສັງລວມ

demux md0.log ພິເສດ

ລາຍລະອຽດ

ຖ້າທ່ານຕ້ອງການທີ່ຈະເຮັດໃຫ້ເສັ້ນທາງຂອງທ່ານຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງອີກເທື່ອຫນຶ່ງ, ທ່ານສາມາດນໍາໃຊ້ demux ອ່ານ
ໄຟລ໌ md0.log ຂອງທ່ານ (ທ່ານສາມາດ concatenate ຫຼາຍຖ້າຈໍາເປັນ) ແລະຜະລິດຜົນຜະລິດຈໍານວນຫນ້ອຍຫນຶ່ງ
ໄຟລ໌. ໜຶ່ງໃນນັ້ນແມ່ນໄຟລ໌ .xvg (replica_ndx.xvg) ທີ່ສາມາດຜ່ານໄປ trjcat(1​) ພ້ອມ
ກັບໄຟລ໌ trajectory ຕົ້ນສະບັບ, ໃນຄໍາສັ່ງທີ່ຈະຜະລິດ trajectories ຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ. ອື່ນໆ
ແຟ້ມ (replica_temp.xvg) ປະກອບດ້ວຍອຸນຫະພູມສໍາລັບແຕ່ລະ replica, ເລີ່ມຕົ້ນທີ່
ອຸນ​ຫະ​ພູມ​ຕົ້ນ​ສະ​ບັບ​. ດັ່ງນັ້ນຖ້າ replica ຂອງທ່ານມີຄວາມສົນໃຈເລີ່ມຕົ້ນ, ເວົ້າວ່າ, 300 K, ທ່ານສາມາດປະຕິບັດຕາມ
ເສັ້ນທາງຂອງມັນຜ່ານພື້ນທີ່ອຸນຫະພູມ. ມັນຈະເປັນຫນ້າສົນໃຈທີ່ຈະເພີ່ມບາງຢ່າງ
ການທໍາງານເພື່ອເຮັດໃຫ້ histograms ຂອງການແຜ່ກະຈາຍອຸນຫະພູມສໍາລັບແຕ່ລະ replica, ເຊິ່ງ
ອີງຕາມຜູ້ຂຽນສ່ວນໃຫຍ່, ຄວນຈະແປ. ເສັ້ນທາງ demuxed ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ກັບ
g_kinetics(1​) ເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຮັບ kinetics folding ທາດໂປຼຕີນຈາກ REMD trajectories.

OPTIONS

md0.log ບັນທຶກໄຟລ໌ຂອງການແລ່ນ trajectory ທີ່ທ່ານຕ້ອງການເພື່ອເຮັດໃຫ້ຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ. ໄຟລ໌ຫຼາຍສາມາດເປັນ
ຄັດຕິດເຂົ້າກັນ.

ພິເສດ ຈຳນວນເທື່ອຂອງແຕ່ລະລາຍການໃນໄຟລ໌ບັນທຶກຈະຖືກສຳເນົາ. (ຈຳນວນເຕັມ)

ຂອບເຂດ ຈຳ ກັດ

ຖ້າການແລກປ່ຽນຂອງທ່ານແມ່ນທຸກໆ N ps ແລະທ່ານໄດ້ບັນທຶກທຸກ M ps ທ່ານສາມາດເຮັດສໍາລັບສິ່ງທີ່ຂາດຫາຍໄປ
ກອບໂດຍການຕັ້ງຄ່າ ພິເສດ ເຖິງ (N/M - 1). ຖ້າ N/M ບໍ່ແມ່ນຈຳນວນເຕັມ, ເຈົ້າເສຍໂຊກແລ້ວ
ຈະບໍ່ສາມາດ demux trajectories ຂອງທ່ານທັງຫມົດ.

ໃຊ້ demux ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net