ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fastaq-sequence_trim ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fastaq_sequence_trim - ຕັດໃຫ້ກົງກັນກັບສະຕຣິງທີ່ໃຫ້ໄວ້ໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນຂອງທຸກໆ
ລໍາດັບ
ລາຍລະອຽດ
ການນໍາໃຊ້: fastaq_sequence_trim [ຕົວເລືອກ]
Trims ລໍາດັບອອກຈາກການເລີ່ມຕົ້ນຂອງລໍາດັບທັງຫມົດໃນຄູ່ຂອງໄຟລ໌ລໍາດັບ, ທຸກຄັ້ງຢູ່ທີ່ນັ້ນ
ເປັນການແຂ່ງຂັນທີ່ສົມບູນແບບ. ພຽງແຕ່ຮັກສາຄູ່ທີ່ອ່ານໄດ້ຖ້າທັງສອງອ່ານຂອງຄູ່ແມ່ນຢ່າງຫນ້ອຍ a
ຄວາມຍາວຕໍ່າສຸດຫຼັງຈາກການຕັດໃດໆ
ຕຳ ແໜ່ງ ການໂຕ້ຖຽງ:
infile_1
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ forward fasta/q ທີ່ຈະຕັດອອກ
infile_2
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ fasta/q ປີ້ນກັບກັນທີ່ຈະຕັດອອກ
outfile_1
ຊື່ຂອງຜົນຜະລິດຕໍ່ໄຟລ໌ fasta/q
outfile_2
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ reverse fasta/q ຜົນຜະລິດ
trim_seqs
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ລໍາດັບທີ່ຈະຄົ້ນຫາໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນຂອງແຕ່ລະລໍາດັບການປ້ອນຂໍ້ມູນ
ທາງເລືອກ ການໂຕ້ຖຽງ:
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ
--min_length INT
ຄວາມຍາວຕໍາ່ສຸດຂອງລໍາດັບຜົນຜະລິດ [50]
--revcomp
ຕັດສ່ວນທ້າຍຂອງແຕ່ລະລຳດັບຖ້າມັນກົງກັບສ່ວນເສີມດ້ານຫຼັງ. ທາງເລືອກນີ້ແມ່ນ
ມີຈຸດປະສົງສໍາລັບການຕັດ primer PCR
ໃຊ້ fastaq-sequence_trim ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ການບໍລິການ onworks.net
