ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fdnamlke ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fdnamlk - ຄາດຄະເນ phylogeny nucleotide ໂດຍຄວາມເປັນໄປໄດ້ສູງສຸດ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
fdnamlk - ລໍາດັບ seqsetall -intreefile ເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ [- ປະເພດ integer] -ອັດຕາ array
- ປະເພດ ຄຸນສົມບັດ [- ນໍ້າໜັກ ຄຸນສົມບັດ] [-tratio float] [-freqs ຈາກ toggle]
- ຄວາມຖີ່ພື້ນຖານ array [- ແກມມາ ບັນຊີລາຍຊື່] - ປະສິດທິພາບ gamma float -ngammacat integer
- invarcoefficient float -ninvarcat integer - invarfrac float
-nhmm ໝວດໝູ່ integer -hmrates array -hmmprobabilities array -adjsite ປຸ້ຍ
- lambda float - ມ່ວນ integer - ແກ່ນ integer - ທົ່ວໂລກ ປຸ້ຍ - ຄວາມຍາວ ປຸ້ຍ
-outfile outfile [-trout toggle] - outtreefile outfile [- ຂໍ້ມູນການພິມ ປຸ້ຍ]
[- ຄວາມຄືບຫນ້າ ປຸ້ຍ] [- ເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ ປຸ້ຍ] [-hypstate ປຸ້ຍ]
fdnamlk -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
fdnamlk ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Phylogeny: Molecular sequence" (s).
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqsetall
ໄຟລ໌ທີ່ມີການຈັດຮຽງລໍາດັບໜຶ່ງ ຫຼືຫຼາຍກວ່ານັ້ນ
-intreefile ເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ
- ປະເພດ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
-ອັດຕາ array
- ປະເພດ ຄຸນສົມບັດ
- ນໍ້າໜັກ ຄຸນສົມບັດ
ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
-tratio float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 2.0
-freqs ຈາກ toggle
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y
- ຄວາມຖີ່ພື້ນຖານ array
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.25 0.25 0.25 0.25
- ແກມມາ ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ອັດຕາຄົງທີ່
- ປະສິດທິພາບ gamma float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
-ngammacat integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
- invarcoefficient float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
-ninvarcat integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
- invarfrac float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.0
-nhmm ໝວດໝູ່ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
-hmrates array
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1.0
-hmmprobabilities array
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1.0
-adjsite ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- lambda float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1.0
- ມ່ວນ integer
- ແກ່ນ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1
- ທົ່ວໂລກ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- ຄວາມຍາວ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile outfile
-trout toggle
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y
- outtreefile outfile
- ຂໍ້ມູນການພິມ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- ຄວາມຄືບຫນ້າ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y
- ເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y
-hypstate ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
ໃຊ້ fdnamlke ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
