ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gbrowse ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
GBrowse2 - ຕົວທ່ອງເວັບຂອງ Genome ທົ່ວໄປ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
libgbrowse-perl [-ຊ]
ການຕິດຕັ້ງ
ຖ້າ Apache2 ຖືກຕິດຕັ້ງຢູ່ໃນລະບົບ, ຊອບແວໄດ້ຕັ້ງຄ່າມັນເພື່ອເຊື່ອມຕໍ່ URLs
GBrowse directory. ການເລີ່ມຕົ້ນ Apache ຄືນໃໝ່ແມ່ນຕ້ອງການເພື່ອພິຈາລະນາມັນ.
ການຕັ້ງຄ່າແມ່ນມີຢູ່ໃນໄຟລ໌ /etc/gbrowse2/apache2.conf.
ຖ້າເຄື່ອງແມ່ຂ່າຍເວັບອື່ນຖືກນໍາໃຊ້, ຫນຶ່ງຄວນອ້າງອີງໃສ່ແມ່ແບບ apache2 ເພື່ອແຜນທີ່ urls
ວິທີການດຽວກັນ.
ຂຶ້ນກັບ
ການເພິ່ງພາອາໄສ perl ທາງເລືອກເພີ່ມເຕີມມີຢູ່ເພື່ອໃຫ້ຄຸນສົມບັດເພີ່ມເຕີມ. ກະລຸນາອ້າງອີງ
ໄປຫາໂມດູນທາງເລືອກໃນໄຟລ໌ INSTALL ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ.
CONFIGURATION
gbrowse2 ໄຟລ໌ການຕັ້ງຄ່າຢູ່ໃນ /etc/gbrowse. ໄຟລ໌ການຕັ້ງຄ່າຕົ້ນຕໍແມ່ນ
GBrowse.conf. ມັນປະກອບດ້ວຍອົງປະກອບການຕັ້ງຄ່າທົ່ວໂລກ. ໄຟລ໌ການຕັ້ງຄ່າສະເພາະ
ຕັ້ງຢູ່ໃນໄດເລກະທໍລີດຽວກັນຕໍ່ທະນາຄານຂໍ້ມູນ. ສໍາລັບລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມ, ຫນຶ່ງຄວນອ້າງອີງເຖິງ
GBBrowse ເອກະສານ.
ການຕິດຕັ້ງແມ່ນໃຫ້ຕົວຢ່າງ genome ຂອງເຊື້ອລາ.
ລາຍລະອຽດ
GBrowse ແມ່ນງ່າຍດາຍແຕ່ສູງ
ຕົວທ່ອງເວັບຂອງ genome ທີ່ສາມາດຕັ້ງຄ່າໄດ້. ມັນເປັນອົງປະກອບຂອງ
ໂຄງການຖານຂໍ້ມູນລະບົບອົງການຈັດຕັ້ງແບບທົ່ວໄປ (GMOD).
ບາງລັກສະນະຂອງຕົນ:
* ຕານົກພ້ອມໆກັນແລະທັດສະນະລາຍລະອຽດຂອງ genome;
* ເລື່ອນ, ຊູມ, ສູນ;
* ແນບ URL ທີ່ມັກໃສ່ກັບຄໍາບັນຍາຍໃດໆ;
* ຄໍາສັ່ງແລະຮູບລັກສະນະຂອງການຕິດຕາມແມ່ນປັບແຕ່ງໂດຍຜູ້ບໍລິຫານແລະ
ຜູ້ໃຊ້ສຸດທ້າຍ;
* ຄົ້ນຫາໂດຍ ID ຄໍາບັນຍາຍ, ຊື່, ຫຼືຄໍາຄິດຄໍາເຫັນ;
* ສະຫນັບສະຫນູນຄໍາອະທິບາຍພາກສ່ວນທີສາມໂດຍນໍາໃຊ້ຮູບແບບ GFF;
* ການຕັ້ງຄ່າຍັງຄົງຢູ່ໃນທົ່ວກອງປະຊຸມ;
* DNA ແລະ GFF dumps;
* ການເຊື່ອມຕໍ່ກັບຖານຂໍ້ມູນທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ລວມທັງ BioSQL ແລະ Chado;
* ສະຫນັບສະຫນູນຫຼາຍພາສາ;
* ການໂຫຼດຄຸນນະສົມບັດພາກສ່ວນທີສາມ;
* ສະຖາປັດຕະຍະກຳ plug-in ທີ່ສາມາດປັບແຕ່ງໄດ້ (ເຊັ່ນ: ແລ່ນ BLAST, dump & import many
ຮູບແບບ, ຊອກຫາ oligonucleotides, primers ອອກແບບ, ສ້າງແຜນທີ່ຈໍາກັດ,
ແກ້ໄຂຄຸນນະສົມບັດ).
ເວັບໄຊຕ໌ ACCESS
GBrowse ແມ່ນສາມາດເຂົ້າເຖິງໄດ້ທີ່ URL http://localhost/gbrowse2
ໃຊ້ gbrowse ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
