ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gene2xml ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gene2xml - ປ່ຽນ NCBI Entrez Gene ASN.1 ເປັນ XML
ສະຫຼຸບສັງລວມ
gene2xml [-] [-b] [-c] [-i ຊື່ເອກະສານ] [-l] [-o ຊື່ເອກະສານ] [-p ເສັ້ນທາງ] [-r ເສັ້ນທາງ] [-t N] [-x]
[-y] [-z]
ລາຍລະອຽດ
gene2xml ເປັນໂຄງການທີ່ຕັ້ງຢູ່ຄົນດຽວທີ່ແປງ Entrez Gene ASN.1 ເປັນ XML. Entrez Gene
ຂໍ້ມູນຖືກເກັບໄວ້ເປັນໄຟລ໌ Binary Entrezgene-Set ASN.1 ທີ່ຖືກບີບອັດຢູ່ໃນເວັບໄຊ NCBI ftp, ແລະ
ມີຄຳຕໍ່ທ້າຍ .ags.gz. ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນນ້ອຍກວ່າໄຟລ໌ XML ທີ່ບີບອັດຫຼາຍເທົ່າ,
ສົ່ງຜົນໃຫ້ມີການປະຢັດຢ່າງຫຼວງຫຼາຍຂອງການເກັບຮັກສາແຜ່ນແລະແບນວິດເຄືອຂ່າຍ. ປົກກະຕິ
ການປຸງແຕ່ງໂດຍ gene2xml ຜະລິດໄຟລ໌ XML ຂໍ້ຄວາມທີ່ມີຊື່ດຽວກັນແຕ່ມີ .xgs ເປັນ
បច្ច័យ.
OPTIONS
ສະຫຼຸບຂອງທາງເລືອກແມ່ນລວມຢູ່ຂ້າງລຸ່ມນີ້.
- ພິມຂໍ້ຄວາມການນໍາໃຊ້
-b ໄຟລ໌ແມ່ນ Binary
-c ໄຟລ໌ຖືກບີບອັດ
-i ຊື່ເອກະສານ
ໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນດຽວ (ການປ້ອນຂໍ້ມູນມາດຕະຖານຕາມຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ) ເມື່ອບໍ່ໄດ້ໃຊ້ -p
-l ການປຸງແຕ່ງບັນຊີລາຍການ (ບັນຊີລາຍຊື່ໄຟລ໌ການປຸງແຕ່ງໃນເວລາທີ່ການນໍາໃຊ້ -p)
-o ຊື່ເອກະສານ
ໄຟລ໌ Output ດຽວ (ຜົນຜະລິດມາດຕະຖານຕາມຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ) ເມື່ອບໍ່ໄດ້ໃຊ້ -p
-p ເສັ້ນທາງ
ເສັ້ນທາງໄປຫາໄຟລ໌ (ຖ້າຫາກວ່າການປຸງແຕ່ງທັງຫມົດລະບົບ)
-r ເສັ້ນທາງ
ເສັ້ນທາງສໍາລັບຜົນໄດ້ຮັບໃນເວລາທີ່ການນໍາໃຊ້ -p; ເປັນຄ່າເລີ່ມຕົ້ນຂອງລາຍການປ້ອນຂໍ້ມູນ
-t N ຈຳກັດໃສ່ ID Taxon ທີ່ໃຫ້ໄວ້ (ຕໍ່ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/)
-x ສະກັດ .ags ເປັນຂໍ້ຄວາມ .agc (ຮູບແບບທີ່ແຈກຢາຍກ່ອນໜ້ານີ້)
-y ສົມທົບ .agc ກັບຂໍ້ຄວາມ .ags (ສໍາລັບການທົດສອບ)
-z ສົມທົບ .agc ກັບ binary .ags, ຈາກນັ້ນ gzip
ໃຊ້ gene2xml ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
