ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ glam2scan ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
glam2scan - ຊອກຫາ motif GLAM2 ໃນຖານຂໍ້ມູນ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
glam2scan [ທາງເລືອກໃນການ] ຫນັງສື my_motif.glam2 my_seqs.fa
ຕົວອັກສອນອື່ນນອກຈາກ p or n ຖືກຕີຄວາມໝາຍວ່າເປັນຊື່ຂອງໄຟລ໌ຕົວອັກສອນ.
ລາຍລະອຽດ
glam2scan ຊອກຫາການຈັບຄູ່, ໃນຖານຂໍ້ມູນລໍາດັບ, ກັບ motif ຄົ້ນພົບໂດຍ glam2ທີ່ຢູ່ ແຕ່ລະຄົນ
ການແຂ່ງຂັນໄດ້ຮັບຄະແນນ, ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າມັນເຫມາະກັບ motif ແນວໃດ.
OPTIONS (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ ການຕັ້ງຄ່າ)
-h
ສະແດງຕົວເລືອກທັງໝົດ ແລະການຕັ້ງຄ່າເລີ່ມຕົ້ນຂອງພວກມັນ.
-o
ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ (stdout).
-n
ຈໍານວນການຈັດລໍາດັບທີ່ຈະລາຍງານ (25).
-2
ກວດເບິ່ງທັງສອງ strands - ປະກອບໄປຂ້າງຫນ້າແລະປີ້ນກັບກັນ.
-D
ການລຶບ pseudocount (0.1).
-E
ບໍ່ມີການລຶບ pseudocount (2.0).
-I
Insertion pseudocount (0.02).
-J
No-insertion pseudocount (1.0).
-d
ໄຟລ໌ປະສົມ Dirichlet.
ໃຊ້ glam2scan ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net