gt-eval - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

gt-eval - ປຽບທຽບໄຟລ໌ annotation ແລະສະແດງມາດຕະການຄວາມຖືກຕ້ອງ (ການຄາດຄະເນທຽບກັບເອກະສານອ້າງອີງ).

ສະຫຼຸບສັງລວມ

gt ການປະເມີນ reference_file ການຄາດເດົາ_file

ລາຍລະອຽດ

- ນູກ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ການ​ປະ​ເມີນ​ລະ​ດັບ nucleotide (ການ​ບໍ​ລິ​ໂພກ​ຫນ່ວຍ​ຄວາມ​ຈໍາ​ແມ່ນ​ອັດ​ຕາ​ສ່ວນ​ກັບ​ຂະ​ຫນາດ​ໄຟລ​໌​ປ້ອນ​ຂໍ້​ມູນ​)
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ແມ່ນແລ້ວ)

-ltr [ແມ່ນ|ບໍ່]
ປະເມີນການຄາດຄະເນ LTR retrotransposon ແທນທີ່ຈະເປັນການຄາດຄະເນ gene (ທັງຫມົດ
ອົງປະກອບ LTR_retrotransposon ຖືກພິຈາລະນາວ່າມີສາຍທີ່ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ) (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ:
ບໍ່)

-ltdelta [ມູນຄ່າ]
ຕັ້ງຄ່າ delta ທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ສໍາລັບ LTR ຊາຍແດນທີ່ຖືວ່າເທົ່າທຽມກັນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 20)

-v [ແມ່ນ|ບໍ່]
be verbose (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-o [ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ]
ປ່ຽນເສັ້ນທາງຜົນຜະລິດໄປຫາໄຟລ໌ທີ່ລະບຸ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)

-gzip [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນ gzip ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-bzip2 [ແມ່ນ|ບໍ່]
ຂຽນໄຟລ໌ຜົນຜະລິດທີ່ຖືກບີບອັດ bzip2 (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

- ຜົນບັງຄັບໃຊ້ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ບັງຄັບໃຫ້ຂຽນເປັນໄຟລ໌ອອກ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອແລະອອກ

-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ

ໂປຣແກຣມສະແດງຄ່າຄວາມອ່ອນໄຫວ ແລະສະເພາະສຳລັບບາງປະເພດຄຸນສົມບັດ (ຕົວຢ່າງ:
gene, mRNA, ແລະ exon). ສໍາ​ລັບ​ບາງ​ປະ​ເພດ​ຄຸນ​ນະ​ສົມ​ບັດ​ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ​ການ​ຂາດ​ຫາຍ​ໄປ​ແລະ​ລັກ​ສະ​ນະ​ຜິດ​ພາດ​ຂອງ​
ປະເພດນັ້ນຍັງສະແດງໃຫ້ເຫັນ. ດ້ວຍເຫດນີ້, "ຂາດ" ຫມາຍເຖິງຈໍານວນຂອງລັກສະນະປະເພດນັ້ນຈາກ
"ການອ້າງອິງ" ໂດຍບໍ່ມີການທັບຊ້ອນກັບລັກສະນະຂອງປະເພດນັ້ນຈາກ "ການຄາດເດົາ". ຮອງ
ກົງກັນຂ້າມ, "ຜິດ" ຫມາຍເຖິງຈໍານວນຂອງລັກສະນະປະເພດນັ້ນຈາກ "ການຄາດເດົາ" ໂດຍບໍ່ມີ
ທັບຊ້ອນກັນກັບລັກສະນະຂອງປະເພດນັ້ນຈາກ "ການອ້າງອີງ".

ການລາຍງານ ບັກ

ລາຍງານບັກຫາ[email protected]>.

ໃຊ້ gt-eval ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net