gt-readjoiner-prefilter - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

gt-readjoiner-prefilter - ເອົາການອ່ານທີ່ບັນຈຸແລະມີຄຸນນະພາບຕ່ໍາແລະເຂົ້າລະຫັດການອ່ານທີ່ກໍານົດໄວ້ໃນ
ຮູບແບບ GtEncseq.

ສະຫຼຸບສັງລວມ

gt ຜູ້ອ່ານ ຕົວຕື່ມ [ທາງ​ເລືອກ ...]

ລາຍລະອຽດ

- ຊຸດ​ອ່ານ​ [string]
ລະບຸຊື່ readset ເລີ່ມຕົ້ນ: ຊື່ໄຟລ໌ຂອງ input sequence_file ທໍາອິດ

-db
ລະບຸລາຍຊື່ຫ້ອງສະໝຸດວັດສະດຸປ້ອນ (Fasta/FastQ); ສໍາ​ລັບ​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ​ທີ່​ສິ້ນ​ສຸດ​ການ​ນໍາ​ໃຊ້​
ຊື່ໄຟລ໌ (ທີ່ບໍ່ໄດ້ຮັບອະນຸຍາດໃຫ້ມີ : ສັນຍາລັກ); ສໍາລັບຫ້ອງສະຫມຸດທີ່ຈັບຄູ່ກັບ
ອ່ານ interleaved (f,r,f,r,...) ໃນໄຟລ໌ດຽວໃຊ້ notation
: [, ] (stdev ອາດຈະຖືກລະເວັ້ນ); ສໍາລັບການຈັບຄູ່ທ້າຍດ້ວຍການອ່ານ
ໃນສອງໄຟລ໌ (f, r) ໃຊ້ notation : : [, ]

-v [ແມ່ນ|ບໍ່]
be verbose (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-q [ແມ່ນ|ບໍ່]
ສະກັດກັ້ນຂໍ້ຄວາມຜົນຜະລິດມາດຕະຖານ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-ຈາກ [ແມ່ນ|ບໍ່]
ເກັບຮັກສາ Fasta IDs (ຫຼືຄໍາອະທິບາຍທັງຫມົດທີ່ໃຊ້ຮ່ວມກັນກັບ -clipdes no) ເຕືອນ:
ເພີ່ມຄວາມຕ້ອງການຄວາມຊົງຈໍາ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-clipdes [ແມ່ນ|ບໍ່]
clip ຄໍາອະທິບາຍ Fasta ຫຼັງຈາກຊ່ອງທໍາອິດຕັ້ງເປັນຜິດຖ້າຫາກວ່າທ່ານຕ້ອງການຄໍາອະທິບາຍທັງຫມົດ
(ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ແມ່ນແລ້ວ)

- memdes [ແມ່ນ|ບໍ່]
ໃຊ້ການເກັບຮັກສາຄວາມຊົງຈໍາສໍາລັບຄໍາອະທິບາຍ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ໃຊ້ບ່ອນເກັບຂໍ້ມູນຊົ່ວຄາວ)

-maxlow [ມູນຄ່າ]
ຈໍານວນຕໍາແໜ່ງຄຸນນະພາບຕໍ່າສູງສຸດຢູ່ໃນຄ່າເລີ່ມຕົ້ນທີ່ອ່ານໄດ້: ບໍ່ມີຂອບເຂດ

- ລະດັບຕໍ່າ [ມູນຄ່າ]
ຄຸນ​ນະ​ພາບ​ສູງ​ສຸດ​ສໍາ​ລັບ​ຕໍາ​ແຫນ່ງ​ທີ່​ຈະ​ພິ​ຈາ​ລະ​ນາ​ຄຸນ​ນະ​ພາບ​ຕ​່​ໍ​າ (ຄ່າ​ເລີ່ມ​ຕົ້ນ​: 3​)

-phred64 [ແມ່ນ|ບໍ່]
ໃຊ້ຄະແນນ phred64 ສໍາລັບຮູບແບບ FastQ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່)

-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອສໍາລັບທາງເລືອກພື້ນຖານແລະການອອກ

-help+
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອສໍາລັບທາງເລືອກທັງຫມົດແລະອອກ

-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ

ການລາຍງານ ບັກ

ລາຍງານບັກຫາ[email protected]>.

ໃຊ້ gt-readjoiner-prefilter ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net