ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ hmm-assembler.pl ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
hmm-assembler.pl - ໂມດູນ SNAP hmm-assembler.pl
ສະຫຼຸບສັງລວມ
hmm-assembler.pl [- ທາງເລືອກ [-MORE_OPTIONS]] [--] [PROGRAM_ARG1 ... ]
OPTIONS
ໄດ້ ດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້ ລັກສະນະດຽວ ທາງເລືອກໃນການ ມີ ຍອມຮັບ:
ດ້ວຍການໂຕ້ຖຽງ: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Boolean (ໂດຍບໍ່ມີການໂຕ້ຖຽງ): -r -o -x -p -t -1
ທາງເລືອກອາດຈະຖືກລວມເຂົ້າກັນ. -- ຢຸດການປະມວນຜົນທາງເລືອກ. ພື້ນທີ່ບໍ່ຈໍາເປັນ
ລະຫວ່າງທາງເລືອກແລະການໂຕ້ຖຽງຂອງພວກເຂົາ.
ຕົວເລືອກ:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] ປະກອບມີຮູບແບບ 3'UTR, ຕ້ອງການ -a
-a [] ປະກອບມີຮູບແບບ PolyA, ຕ້ອງການ -3
-5 [] ປະກອບມີ 5'UTR moel, ຕ້ອງການ -p
-p ປະກອບມີຮູບແບບການສົ່ງເສີມທົ່ວໄປ, ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີ -5
-r ປະກອບມີຮູບແບບການເຮັດເລື້ມຄືນທົ່ວໄປ
-o ປະກອບມີຮູບແບບ ORF ປີ້ນກັບກັນ
-x ໃຊ້ຕົວແບບ intro ໄລຍະເວລາທີ່ຊັດເຈນ
-t ປະກອບມີ C.elegans trans-spling, ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີ -p, -5
-Z ກໍານົດຄ່າສະເພາະ clade (ແມ່ທ້ອງ, ແມງວັນ, ພືດ)
-1 ຕົວແບບ gene ດຽວ
-c
ປະກອບມີ GC-AG splice ແບບຜູ້ໃຫ້ທຶນ
ໃຊ້ hmm-assembler.pl ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ການບໍລິການ onworks.net
