ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ indigo-deco ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
indigo-deco - ການກວດສອບໂມເລກຸນ scaffold ແລະ R-group deconvolution
ສະຫຼຸບສັງລວມ
indigo-deco ໄຟ [ພາລາມິເຕີ]
indigo-deco -h
ລາຍລະອຽດ
indigo-deco perfoms ການກວດສອບ scaffold ໂມເລກຸນແລະ R-group deconvolution. ຍອມຮັບ
ຮູບແບບແມ່ນ: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES ແລະ CML.
OPTIONS
indigo-deco ຍອມຮັບຕົວກໍານົດການດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້.
-h ພິມຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອ
-a ການຄິດໄລ່ scaffold ໂດຍປະມານ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນແນ່ນອນ)
-s
ຂຽນ scaffold ທີ່ພົບເຫັນສູງສຸດໄປຫາ molfile
-S
ຂຽນ scaffolds ທີ່ພົບເຫັນທັງຫມົດໃສ່ SD-file
-l
ຢ່າຄິດໄລ່ scaffold, ແຕ່ໂຫລດຈາກໄຟລ໌
-sr
ຂຽນ scaffold ກັບ R-sites ໃສ່ໄຟລ໌
-o
ຂຽນໂມເລກຸນທີ່ເນັ້ນໃສ່ຜົນໄດ້ຮັບ
-r
ຂຽນໂມເລກຸນຜົນໄດ້ຮັບດ້ວຍກຸ່ມ r ແຍກເພື່ອຍື່ນ
ສ້າງ ບໍ່ມີການພິຈາລະນາທີ່ມີກິ່ນຫອມ
-- ໝາຍຈຸດສິ້ນສຸດຂອງຕົວເລືອກ
ຕົວຢ່າງ
indigo-deco *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
ອ່ານໂມເລກຸນຈາກ molfiles ໃນໄດເລກະທໍລີປະຈຸບັນ, ບັນທຶກ scaffold ທີ່ພົບເຫັນສູງສຸດ
ເພື່ອ scaf.mol ແລະບັນທຶກໂມເລກຸນທີ່ເນັ້ນໃສ່ hl.sdf.
indigo-deco structure.mol many.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
ອ່ານໜຶ່ງໂມເລກຸນຈາກໂຄງສ້າງ.mol ແລະຫຼາຍໂມເລກຸນຈາກ many.sdf, ບັນທຶກ
ໂມເລກຸນທີ່ມີ r-rgoups ກັບ rg.sdf ແລະບັນທຶກ scaffolds ທີ່ພົບເຫັນທັງຫມົດໄວ້ໃນ allscafs.sdf.
indigo-deco *.sm -d readyscaf.mol -o hl.sdf
ອ່ານຫຼາຍໂມເລກຸນຈາກທຸກໆໄຟລ໌ SMILES ໃນໄດເລກະທໍລີປະຈຸບັນ, ອ່ານ
scaffold ຈາກ readyscaf.mol ແລະບັນທຶກໂມເລກຸນທີ່ເນັ້ນໃສ່ hl.sdf.
ໃຊ້ indigo-deco ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
