ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ indigo-depict ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
indigo-depict - ໂມເລກຸນແລະປະຕິກິລິຍາ rendering utility
ສະຫຼຸບສັງລວມ
indigo - depict infile.{mol,rxn,cml,smi} outfile.{png,svg,pdf} [ພາລາມິເຕີ]
indigo - depict infile.{cml,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} outfile_%s.{png,svg,pdf} [ພາລາມິເຕີ]
indigo - depict infile.smi outfile.{cml,mol,rdf,rxn,sdf} [ພາລາມິເຕີ]
indigo - depict - SMILES outfile.{cml,mol,pdf,png,rxn,svg} [ພາລາມິເຕີ]
indigo - depict -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
indigo - depict ແມ່ນໃຊ້ສໍາລັບການພັນລະນາໂມເລກຸນ.
OPTIONS
indigo - depict ສາມາດອ່ານໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ ຫຼືລະຫັດ SMILES ຈາກວັດສະດຸປ້ອນມາດຕະຖານ. ເຫຼົ່ານີ້ສາມາດ
ປະຕິບັດຕາມໂດຍຫນຶ່ງຫຼືຫຼາຍຕົວກໍານົດການດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້.
-w
ຄວາມກວ້າງຂອງຮູບເປັນ pixels
-h
ຄວາມສູງຂອງຮູບເປັນ pixels
- ພັນທະບັດ
ຄວາມຍາວພັນທະບັດສະເລ່ຍເປັນ pixels
- ຂອບ
ຂອບລວງນອນ ແລະແນວຕັ້ງ, ເປັນ pixels. ບໍ່ມີຂອບຕາມຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ
- ຄວາມຫນາແຫນ້ນ
ກໍານົດປັດໄຈຄວາມຫນາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 1.0
- ຄວາມກວ້າງເສັ້ນ
ກໍານົດປັດໄຈຄວາມກວ້າງຂອງເສັ້ນພັນທະບັດ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 1.0
- ປ້າຍຊື່
ຕັ້ງໂໝດສະແດງປ້າຍອະຕອມ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ terminal-hetero
- ໄຮໂດຣ
ສະແດງໃຫ້ເຫັນ hydrogens implicit. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ on
-[de]ອາຣອມ
ບັງຄັບ [de]ການເຮັດໃຫ້ກິ່ນຫອມ
- ສະເຕຣິໂອ
ໂໝດສະແດງກຸ່ມສະເຕີຣອຍ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ ອາຍຸ
-cdbwsa
ກາງພັນທະບັດຄູ່ທີ່ມີພັນທະບັດສະເຕີລິໂອຕິດກັນ (ປິດການໃຊ້ງານໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ)
- ສອບຖາມ ປະຕິບັດການປ້ອນຂໍ້ມູນເປັນໂມເລກຸນແບບສອບຖາມ ຫຼືປະຕິກິລິຍາ (ປິດການໃຊ້ງານໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ)
- ສະຫຼາດ
ປະຕິບັດການປ້ອນຂໍ້ມູນເປັນໂມເລກຸນຄໍາຖາມ SMARTS ຫຼືປະຕິກິລິຍາ (ປິດການໃຊ້ງານໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ)
-idfield
ຊ່ອງຂໍ້ມູນ SDF/RDF ທີ່ຈະໃສ່ແທນ '%s' ໃນຊື່ຂອງໄຟລ໌ທີ່ບັນທຶກໄວ້ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ
ເລກໂມເລກຸນ/ປະຕິກິລິຍາ)
- catalysts
ການຈັດວາງ catalysts ປະຕິກິລິຍາ wrt ລູກສອນ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ ຂ້າງເທິງແລະຂ້າງລຸ່ມ
- ຄໍາເຫັນ
ຂໍ້ຄວາມສະແດງຄວາມຄິດເຫັນທີ່ຈະໃສ່ຂ້າງເທິງໂມເລກຸນຫຼືປະຕິກິລິຍາ. ບໍ່ມີຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ
- ຄໍາຄິດເຫັນ offset
ພື້ນທີ່ຕັ້ງ (ເປັນ pixels) ລະຫວ່າງຄໍາເຫັນແລະໂຄງສ້າງ
- ຊ່ອງຄໍາເຫັນ
ໃຊ້ຊ່ອງຂໍ້ມູນ SDF/RDF ທີ່ລະບຸເປັນຄຳເຫັນ
- ຄໍາເຫັນ
ໃຊ້ຊື່ໂມເລກຸນ/ປະຕິກິລິຍາເປັນຄຳເຫັນ
- ຄວາມຄິດເຫັນ
ຂໍ້ຄວາມສະແດງຄວາມຄິດເຫັນກ່ຽວກັບຂະຫນາດຕົວອັກສອນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມຫນາຂອງພັນທະບັດ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 6
- ຄໍາເຫັນ
ຕໍາແຫນ່ງຄວາມຄິດເຫັນຂອງຂໍ້ຄວາມ (ທາງລຸ່ມເປັນຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ)
- ຄວາມຄິດເຫັນ <0..1>
ການຈັດຮຽງຄຳເຫັນຂໍ້ຄວາມ, ຄ່າເລື່ອນ: 0 = ຊ້າຍ, 0.5 = ສູນກາງ 1 = ສິດ
- ການໃສ່ສີ
ເປີດ/ປິດ ການໃສ່ສີ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ on
- ໜາ
ເປີດໃຊ້ການໄຮໄລ້ດ້ວຍເສັ້ນໜາ ແລະຕົວອັກສອນໜາ
-hlcolor
ເປີດໃຊ້ການໄຮໄລ້ດ້ວຍສີ. ຄ່າອົງປະກອບຕ້ອງຢູ່ໃນໄລຍະ [0..255]
-bgcolor
ຕັ້ງສີພື້ນຫຼັງ. ຄ່າອົງປະກອບຕ້ອງຢູ່ໃນໄລຍະ [0..255]
- ສີພື້ນຖານ
ຕັ້ງຄ່າສີພື້ນໜ້າເລີ່ມຕົ້ນ. ຄ່າອົງປະກອບຕ້ອງຢູ່ໃນໄລຍະ [0..255]
-aamcolor
ກໍານົດສີຂອງດັດຊະນີ AAM. ຄ່າອົງປະກອບຕ້ອງຢູ່ໃນໄລຍະ [0..255]
-dsgcolor
ກໍານົດສີຂອງຂໍ້ມູນ SGroups. ຄ່າອົງປະກອບຕ້ອງຢູ່ໃນໄລຍະ [0..255]
- ສີຄໍາຄິດເຫັນ
ກໍານົດສີຂອງຄໍາເຫັນ. ຄ່າອົງປະກອບຕ້ອງຢູ່ໃນໄລຍະ [0..255]
- ຈໍານວນປະລໍາມະນູ
ສະແດງຕົວເລກອະຕອມ (ເພື່ອຈຸດປະສົງການດີບັກເທົ່ານັ້ນ)
- ເລກພັນທະບັດ
ສະແດງຕົວເລກພັນທະບັດ (ເພື່ອຈຸດປະສົງການດີບັກເທົ່ານັ້ນ)
-onebased
ເລີ່ມດັດຊະນີອະຕອມ ແລະພັນທະບັດຈາກອັນໜຶ່ງ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນມາຈາກສູນ
-ຊ່ວຍ ພິມຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້
ຕົວຢ່າງ
indigo - depict infile.mol outfile.png - ການໃສ່ສີ ໄປ - ອາລົມ
indigo - depict database.sdf molecule_%s.png -idfield cdbregno - ຄວາມຫນາແຫນ້ນ 1.1
indigo - depict database.smi database.sdf
indigo - depict - CC.[O-][*-]([O-])=O query.png - ສອບຖາມ
indigo - depict - OCO>>CC(C)N ຕິກິຣິຍາ.rxn
ໃຊ້ indigo-depict ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
