เบžเบฒเบชเบฒเบญเบฑเบ‡เบเบดเบ”เบžเบฒเบชเบฒเบเบฃเบฑเปˆเบ‡เปเบญเบชเบ›เบฒเป‚เบเบ™

Ad


OnWorks favicon

map2slimp - เบญเบญเบ™เบฅเบฒเบเปƒเบ™เบ„เบฅเบฒเบง

เป€เบ›เบตเบ”เปƒเบŠเป‰ map2slimp เปƒเบ™ OnWorks เบœเบนเป‰เปƒเบซเป‰เบšเปเบฅเบดเบเบฒเบ™เป‚เบฎเบ”เบ•เบดเป‰เบ‡เบŸเบฃเบตเบœเปˆเบฒเบ™ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator เบซเบผเบท MAC OS online emulator

เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบ„เปเบฒเบชเบฑเปˆเบ‡ map2slimp เบ—เบตเปˆเบชเบฒเบกเบฒเบ”เบ”เปเบฒเป€เบ™เบตเบ™เบเบฒเบ™เป„เบ”เป‰เปƒเบ™ OnWorks เบœเบนเป‰เปƒเบซเป‰เบšเปเบฅเบดเบเบฒเบ™เป‚เบฎเบ”เบ•เบดเป‰เบ‡เบŸเบฃเบตเป‚เบ”เบเปƒเบŠเป‰เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เปƒเบ™เบซเบผเบฒเบเป†เบšเปˆเบญเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบญเบญเบ™เป„เบฅเบ™เปŒเบ‚เบญเบ‡เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเป€เบŠเบฑเปˆเบ™ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator เบซเบผเบท MAC OS online emulator

เป‚เบ„เบ‡เบเบฒเบ™:

NAME


map2slim - เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเป„เบ›เบชเบนเปˆ ontology 'เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”'

เบชเบฐเบซเบผเบธเบšเบชเบฑเบ‡เบฅเบงเบก


cd เป„เบ›
map2slim GO_slims/goslim_generic.obo ontology/gene_ontology.obo gene-associations/gene_association.fb

เบฅเบฒเบเบฅเบฐเบญเบฝเบ”


เปƒเบซเป‰เป„เบŸเบฅเปŒ GO slim, เปเบฅเบฐ ontology เบ›เบฐเบˆเบธเบšเบฑเบ™ (เปƒเบ™เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบซเบผเบทเบซเบผเบฒเบเป„เบŸเบฅเปŒ), script เบ™เบตเป‰เบˆเบฐเปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ.
เป„เบŸเบฅเปŒเบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒ (เบ›เบฐเบเบญเบšเบ”เป‰เบงเบเบ„เปเบฒเบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš GO เบชเบฐเบšเบฑเบšเป€เบ•เบฑเบก) เบเบฑเบšเบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เปƒเบ™ GO
เบšเบฒเบ‡.

เบชเบฐเบ„เบฃเบดเบšเบชเบฒเบกเบฒเบ”เปƒเบŠเป‰เป€เบžเบทเปˆเบญเบชเป‰เบฒเบ‡เป„เบŸเบฅเปŒเบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเบญเบฑเบ™เปƒเปเปˆ, เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เบ›เบฐเบเบญเบšเบกเบตเบซเบผเบฒเบเบชเบธเบ”
GO slim accessions เบ—เบตเปˆเบเปˆเบฝเบงเบ‚เป‰เบญเบ‡, เบซเบผเบทเปƒเบ™เป‚เบซเบกเบ”เบ™เบฑเบš, เปƒเบ™เบเปเบฅเบฐเบ™เบตเบ™เบตเป‰เบกเบฑเบ™เบˆเบฐเปƒเบซเป‰ gene เบ—เบตเปˆเปเบ•เบเบ•เปˆเบฒเบ‡เบเบฑเบ™.
เบเบฒเบ™เบ™เบฑเบšเบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเปเบ•เปˆเบฅเบฐเป„เบฅเบเบฐเบšเบฒเบ‡เป†

เบฎเบนเบšเปเบšเบšเป€เบญเบเบฐเบชเบฒเบ™เบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเป„เบ”เป‰เบ–เบทเบเบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบขเบนเปˆเบ—เบตเปˆเบ™เบตเป‰:

<http://www.geneontology.org/GO.annotation.shtml#เป„เบŸเบฅเปŒ>

เบเบฒเบ™เป‚เบ•เป‰เบ–เบฝเบ‡


-b เบ–เบฑเบ‡ เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ” เป€เบญเบเบฐเบชเบฒเบ™
เบเบฒเบ™เป‚เบ•เป‰เบ–เบฝเบ‡เบ™เบตเป‰เป€เบžเบตเปˆเบก เบ–เบฑเบ‡ เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” เบเบฑเบš ontology เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”; เป€เบšเบดเปˆเบ‡เป€เบญเบเบฐเบชเบฒเบ™เบ‚เป‰เบฒเบ‡เบฅเบธเปˆเบกเบ™เบตเป‰เบชเปเบฒเบฅเบฑเบš
เบ„เปเบฒเบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบ. เป„เบŸเบฅเปŒ ontology เบ—เบตเปˆเบญเปˆเบญเบ™เป‚เบเบ™เปƒเบซเบกเปˆ, เบฅเบงเบกเบ—เบฑเบ‡เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” bucket เบˆเบฐเบ–เบทเบเบ‚เบฝเบ™เป€เบ–เบดเบ‡
เบ–เบฑเบ‡ เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ” เป€เบญเบเบฐเบชเบฒเบ™

- เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ” เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ เป€เบญเบเบฐเบชเบฒเบ™
เบ™เบตเป‰เบˆเบฐเบชเป‰เบฒเบ‡เป„เบŸเบฅเปŒเปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบ—เบธเบเป†เบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเปƒเบ™ ontology เป€เบ•เบฑเบกเบ—เบตเปˆเบชเบฐเปเบ”เบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™เบ—เบฑเบ‡เบชเบญเบ‡
เบ„เบณเบชเบฑเบšเบ—เบตเปˆเบกเบตเบ„เบงเบฒเบกเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบ—เบตเปˆเบเปˆเบฝเบงเบ‚เป‰เบญเบ‡เบ—เบตเปˆเบชเบธเบ” เปเบฅเบฐเบ—เบธเบเบ„เบณเบ—เบตเปˆเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบ—เบตเปˆเป€เบ›เบฑเบ™เบšเบฑเบ™เบžเบฐเบšเบธเบฅเบธเบ”. เบ–เป‰เบฒเบ—เปˆเบฒเบ™เปƒเบŠเป‰เบ™เบตเป‰
เบ—เบฒเบ‡เป€เบฅเบทเบญเบ, เบขเปˆเบฒเบชเบฐเบซเบ™เบญเบ‡เป„เบŸเบฅเปŒเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒ

เบŠเบทเปˆเบชเบฐเปเบ”เบ‡
(เปƒเบŠเป‰เป„เบ”เป‰เบเบฑเบš -outmap เป€เบ—เบปเปˆเบฒเบ™เบฑเป‰เบ™)

เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบŠเบทเปˆเบ‚เบญเบ‡เบ„เบณเบชเบฑเบšเปƒเบ™เป„เบŸเบฅเปŒเปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเปเบšเบšเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”

-c เบ™เบตเป‰เบˆเบฐเบšเบฑเบ‡เบ„เบฑเบšเปƒเบซเป‰ map2slim เปƒเบซเป‰เบเบฒเบ™เบ™เบฑเบšเบ‚เบญเบ‡เป„เบŸเบฅเปŒ assoc, เปเบ—เบ™เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเป€เบ›เบฑเบ™เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบกเบฑเบ™

-t เป€เบกเบทเปˆเบญเปƒเบŠเป‰เบฎเปˆเบงเบกเบเบฑเบš -c เบˆเบฐเปเบ–เบšเบœเบปเบ™เบœเบฐเบฅเบดเบ”เป€เบžเบทเปˆเบญเปƒเบซเป‰ indentation เบชเบฐเบ—เป‰เบญเบ™เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™
เบฅเบณเบ”เบฑเบšเบ•เบปเป‰เบ™เป„เบกเป‰เบขเบนเปˆเปƒเบ™เป„เบŸเบฅเปŒเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”

-o เบญเบญเบ เป€เบญเบเบฐเบชเบฒเบ™
เบ™เบตเป‰เบˆเบฐเบ‚เบฝเบ™ assocs เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ (เบซเบผเบทเบ™เบฑเบš) เปƒเบชเปˆเป„เบŸเบฅเปŒเบ—เบตเปˆเบฅเบฐเบšเบธ, เปเบ—เบ™เบ—เบตเปˆเบˆเบฐ
เบซเบ™เป‰เบฒเบˆเป

DOWNLOAD


script เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบชเปˆเบงเบ™เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบ‚เบญเบ‡ go-perl เบŠเบธเบ”, เบกเบตเปƒเบซเป‰เบˆเบฒเบ CPAN

<http://search.cpan.org/~cmungall/go-perl/>

เบชเบฐเบ„เบฃเบดเบšเบ™เบตเป‰เบˆเบฐเบšเปเปˆเป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเป‚เบ”เบเบšเปเปˆเบกเบตเบเบฒเบ™เบ•เบดเบ”เบ•เบฑเป‰เบ‡ go-perl

MAPPING เบญเบฑเบฅเป€เบเบตเบฃเบดเบ”
GO เปเบกเปˆเบ™ DAG, เบšเปเปˆเปเบกเปˆเบ™เบ•เบปเป‰เบ™เป„เบกเป‰. เบ™เบตเป‰เบซเบกเบฒเบเบ„เบงเบฒเบกเบงเปˆเบฒเบกเบฑเบเบˆเบฐเบกเบตเบซเบผเบฒเบเบเบงเปˆเบฒเบซเบ™เบถเปˆเบ‡เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡เบˆเบฒเบเบ„เปเบฒเบชเบฑเบš GO
เป€เบ–เบดเบ‡เบฎเบฒเบ Gene_Ontology node; เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡เบญเบฒเบ”เบˆเบฐเบ•เบฑเบ”เบเบฑเบ™เบซเบผเบฒเบเบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเปƒเบ™เบšเบฒเบ‡เป†
ontology - เบŠเบถเปˆเบ‡เบซเบกเบฒเบเบ„เบงเบฒเบกเบงเปˆเบฒเบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบ„เปเบฒเบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบชเบฒเบกเบฒเบ”เบชเป‰เบฒเบ‡เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบเบฑเบšเบซเบผเบฒเบเบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเบ•เปˆเบฒเบ‡เป†!

(เบซเบกเบฒเบโ€‹เป€เบซเบ”โ€‹ เบ—เปˆเบฒเบ™เบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™เป€เบšเบดเปˆเบ‡เบ™เบตเป‰เบญเบญเบ™เป„เบฅเบ™เปŒเป€เบžเบทเปˆเบญเป€เบšเบดเปˆเบ‡เบฎเบนเบšเบžเบฒเบšเบ‚เป‰เบฒเบ‡เบฅเบธเปˆเบกเบ™เบตเป‰ - เบ–เป‰เบฒเบซเบฒเบเบงเปˆเบฒเบ—เปˆเบฒเบ™เบšเปเปˆเป„เบ”เป‰เป€เบšเบดเปˆเบ‡เบ™เบตเป‰เบขเบนเปˆเปƒเบ™
เป„เบ”เป‰ http://www.geneontology.org เป€เบงเบฑเบšเป„เบŠเบ—เปŒ, เบ—เปˆเบฒเบ™เบชเบฒเบกเบฒเบ”เป€เบšเบดเปˆเบ‡ URL เบ•เปเปˆเป„เบ›เบ™เบตเป‰:
<http://geneontology.cvs.sourceforge.net/*เป€เบŠเบฑเบเป€เบญเบปเบฒ*/geneontology/go-dev/go-perl/doc/map2slim.gif>
)

เบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡เบ—เบตเปˆเบชเบปเบกเบกเบธเบ”เบ•เบดเบ–เบฒเบ™เบงเบปเบ‡เบชเบตเบŸเป‰เบฒเบชเบฐเปเบ”เบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™เบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเปƒเบ™ GO slim, เปเบฅเบฐเบงเบปเบ‡เบชเบตเป€เบซเบผเบทเบญเบ‡เบชเบฐเปเบ”เบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™
เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เปƒเบ™ ontology เป€เบ•เบฑเบก. ontology เป€เบ•เบฑเบก subsumes slim, เบชเบฐเบ™เบฑเป‰เบ™เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบชเบตเบŸเป‰เบฒเปเบกเปˆเบ™
เปƒเบ™ ontology เป„เบ”เป‰.

เป„เบ›โ€‹เบ—เบตเปˆโ€‹เปเบœเบ™โ€‹เบ—เบตเปˆ ID เป€เบžเบทเปˆเบญโ€‹เบชเบฐโ€‹เบฅเบดเบก ID เบšเบฑเบ™โ€‹เบžเบฐโ€‹เบšเบธโ€‹เบฅเบธเบ”โ€‹เบเบฐโ€‹เบ—เบฑเบ”โ€‹เบฎเบฑเบ”โ€‹เบ—เบฑเบ‡โ€‹เบซเบกเบปเบ”โ€‹
===== =============== ==================
5 2+3 2,3,1
6 3 เบžเบฝเบ‡เปเบ•เปˆ 3,1
7 4 เบžเบฝเบ‡เปเบ•เปˆ 4,3,1
8 3 เบžเบฝเบ‡เปเบ•เปˆ 3,1
9 4 เบžเบฝเบ‡เปเบ•เปˆ 4,3,1
10 2+3 2,3,1

เบ–เบฑเบ™เบ—เบต 2 เบชเบฐเปเบ”เบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™ ID (s) เบ—เบตเปˆเบเปˆเบฝเบงเบ‚เป‰เบญเบ‡เบ—เบตเปˆเบชเบธเบ”เบขเบนเปˆเปƒเบ™เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เป€เบฅเบฑเบเบ™เป‰เบญเบ. เบ—เบต 3
เบ–เบฑเบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™เบšเบฑเบ™เบžเบฐเบšเบธเบฅเบธเบ”เบ—เบฑเบ‡เบซเบกเบปเบ”เปƒเบ™เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”.

เบซเบกเบฒเบเป€เบซเบ”เป‚เบ”เบเบชเบฐเป€เบžเบฒเบฐเบเบฒเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ ID 9 เป€เบ–เบดเบ‡เปเบกเปˆเบ™เบงเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เบกเบตเบชเบญเบ‡เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡เป„เบ›เบซเบฒเบฎเบฒเบ
เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบœเปˆเบฒเบ™ 3 เปเบฅเบฐ 4, 3 เบ–เบทเบเบเบปเบเป€เบฅเบตเบเป€เบ™เบทเปˆเบญเบ‡เบˆเบฒเบเบงเปˆเบฒเบกเบฑเบ™เบ–เบทเบเบเปˆเบญเบเบ”เป‰เบงเบ 4.

เปƒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบเบปเบ‡เบเบฑเบ™เบ‚เป‰เบฒเบก, เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ 10 เป„เบ›เบซเบฒเบ—เบฑเบ‡ 2 เปเบฅเบฐ 3 เป€เบžเบฒเบฐเบงเปˆเบฒเป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบ—เบฑเบ‡เบชเบญเบ‡ ID เป€เบฅเบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ—เปเบฒเบญเบดเบ”เปƒเบ™.
เบชเบญเบ‡เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡เบ—เบตเปˆเบ–เบทเบเบ•เป‰เบญเบ‡เป„เบ›เบซเบฒเบฎเบฒเบ, เปเบฅเบฐเบ—เบฑเบ‡เบชเบญเบ‡เบšเปเปˆเบเปˆเบญเบเบญเบตเบ.

เบชเบนเบ”เบเบฒเบ™เบ„เบดเบ”เป„เบฅเปˆเบ—เบตเปˆเปƒเบŠเป‰เปเบกเปˆเบ™:

เป€เบžเบทเปˆเบญเบชเป‰เบฒเบ‡เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบญเบฑเบ™เปƒเบ”เบ™เบถเปˆเบ‡เปƒเบ™ ontology เป€เบ•เบฑเบก: เบŠเบญเบเบซเบฒเป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡เบ—เบตเปˆเบ–เบทเบเบ•เป‰เบญเบ‡เบ—เบฑเบ‡เบซเบกเบปเบ”เป„เบ›เบซเบฒเบ‚เปเป‰เบฎเบฒเบเปƒเบ™
ontology เป€เบ•เบฑเบก

เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเปเบ•เปˆเบฅเบฐเป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡, เป€เบญเบปเบฒเป„เบฅเบเบฐเบ—เปเบฒเบญเบดเบ”เบ—เบตเปˆเบžเบปเบšเปƒเบ™เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ—เบฒเบ‡

เบเบปเบเป€เบฅเบตเบเบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบšเบฒเบ‡เป†เบ—เบตเปˆเบŠเปเป‰เบฒเบŠเป‰เบญเบ™เบขเบนเปˆเปƒเบ™เบŠเบธเบ”เบ™เบตเป‰ เป€เบŠเบฑเปˆเบ™: เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบšเบฒเบ‡เป†เบ—เบตเปˆเบเปˆเบญเบเบ”เป‰เบงเบเบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบšเบฒเบ‡เป†เบญเบทเปˆเบ™เป†.
เปƒเบ™เบŠเบธเบ”

เบ„เบธ เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”
เบ–เป‰เบฒเบ—เปˆเบฒเบ™เปเบฅเปˆเบ™เบชเบฐเบ„เบฃเบดเบšเบ”เป‰เบงเบเบ•เบปเบงเป€เบฅเบทเบญเบ -b, เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” bucket เบˆเบฐเบ–เบทเบเป€เบžเบตเปˆเบก. เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบ„เปเบฒเบชเบฑเบš P in
เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”, เบ–เป‰เบฒ P เบกเบตเบขเปˆเบฒเบ‡เบซเบ™เป‰เบญเบเบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบฅเบนเบ C, bucket term P' เบˆเบฐเบ–เบทเบเบชเป‰เบฒเบ‡เบ‚เบทเป‰เบ™เบžเบฒเบเปƒเบ•เป‰ P. เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™.
เบ„เบณ เบชเบฑเบšเบ—เบตเปˆเบˆเบฑเบšเป„เบ”เป‰เบ—เบฑเบ‡ เปเบปเบ” เบชเบณ เบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ เบ„เบณ เบชเบฑเบšเปƒเบ” เปœเบถเปˆเบ‡ เปƒเบ™ ontology เป€เบ•เบฑเบกเบ—เบตเปˆเปเบกเปˆเบ™เบฅเบนเบเบซเบฅเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡ P, เปเบ•เปˆ.
เบšเปเปˆเปเบกเปˆเบ™เบฅเบนเบเบซเบฅเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบ P เปƒเบ™ ontology เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”.

เบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡, generic.0208 slim เบกเบตเบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” เปเบฅเบฐเป‚เบ„เบ‡เบชเป‰เบฒเบ‡เบ•เปเปˆเป„เบ›เบ™เบตเป‰:

% เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” DNA ; GO:0003677
% เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” chromatin ; GO:0003682
% เบเบดเบ”โ€‹เบˆเบฐโ€‹เบเปเบฒโ€‹เบ›เบฑเบ”โ€‹เป„เบˆ transcription ; GO:0003700, GO:0000130

เบซเบผเบฑเบ‡เบˆเบฒเบเป€เบžเบตเปˆเบกเบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” bucket, เบกเบฑเบ™เบˆเบฐเป€เบšเบดเปˆเบ‡เบ„เบทเบงเปˆเบฒเบ™เบตเป‰:

% เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” DNA ; GO:0003677
% เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” chromatin ; GO:0003682
% เบเบดเบ”โ€‹เบˆเบฐโ€‹เบเปเบฒโ€‹เบ›เบฑเบ”โ€‹เป„เบˆ transcription ; GO: 0003700 ; เบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเบ„เป‰เบฒเบเบ„เบท:GO:0000130
@bucket:Z-OTHER-เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” DNA ; slim_temp_id:12

เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบˆเบฒเบ ontology เป€เบ•เบฑเบกเบ—เบตเปˆเปเบกเปˆเบ™เป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบญเบทเปˆเบ™เป†เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” DNA, เป€เบŠเบฑเปˆเบ™เบ”เบฝเบง -.
เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ” DNA เบ—เบตเปˆเบ–เบทเบเบœเบนเบเบกเบฑเบ”เปเบฅเบฐเบฅเบนเบเบซเบฅเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบกเบฑเบ™เบˆเบฐเป€เบฎเบฑเบ”เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบเบฑเบšเป„เบฅเบเบฐ bucket.

bucket term เบกเบต ID เปเบšเบšเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เป€เบ›เบฑเบ™ transient เปเบฅเบฐเบกเบตเบžเบฝเบ‡เปเบ•เปˆเป€เบžเบทเปˆเบญเบญเปเบฒเบ™เบงเบเบ„เบงเบฒเบกเบชเบฐเบ”เบงเบ
เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆ. เบกเบฑเบ™เบšเปเปˆเบ„เบงเบ™เบ–เบทเบเบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เบžเบฒเบเบ™เบญเบ.

เบ„เบณเบชเบฑเบš bucket เบกเบตเบ„เบณเบ™เบณเปœเป‰เบฒ Z-OTHER; Z เปเบกเปˆเบ™เบเบฒเบ™ hack เป€เบžเบทเปˆเบญเป€เบฎเบฑเบ”เปƒเบซเป‰เปเบ™เปˆเปƒเบˆเบงเปˆเบฒเบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเปเบกเปˆเบ™
เบฅเบฐเบšเบธเป„เบงเป‰เบชเบฐเป€เปเบตเปƒเบ™เบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบฅเบณเบ”เบฑเบšเบ•เบปเบงเปœเบฑเบ‡เบชเบท.

เบชเบนเบ”เบเบฒเบ™เบ„เบดเบ”เป„เบฅเปˆเบ–เบทเบเบ”เบฑเบ”เปเบเป‰เป€เบฅเบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ–เป‰เบฒเปƒเบŠเป‰เบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” bucket. เป„เบฅเบเบฐ bucket เบกเบต
เบ„เบงเบฒเบกเบชเบณเบžเบฑเบ™เบญเบฑเบ™เป€เบ›เบฑเบ™เบˆเบดเบ‡เบเบฑเบšเบญเป‰เบฒเบเป€เบญเบทเป‰เบญเบเบ™เป‰เบญเบ‡เบ—เบฑเบ‡เปเบปเบ”เบšเปเปˆเปเบกเปˆเบ™เบขเบนเปˆเปƒเบ™เปเบšเบšเบšเบฒเบ‡เป†.

Do I เบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™ เบ–เบฑเบ‡ เป€เบ‡เบทเปˆเบญเบ™เป„เบ‚?

เปƒเบ™เบ›เบฑเบ”เบˆเบธเบšเบฑเบ™เป„เบŸเบฅเปŒเบ—เบตเปˆเบญเปˆเบญเบ™เป€เบžเบเบชเปˆเบงเบ™เบซเบผเบฒเบเปเบกเปˆเบ™ 'เบชเบปเบกเบšเบนเบ™' เบ—เบฑเบ‡เบซเบกเบปเบ”, เบ™เบฑเป‰เบ™เปเบกเปˆเบ™เบšเปเปˆเบกเบตเบŠเปˆเบญเบ‡เบซเบงเปˆเบฒเบ‡.
เบ™เบตเป‰เบซเบกเบฒเบเบ„เบงเบฒเบกเบงเปˆเบฒเบ—เบฒเบ‡เป€เบฅเบทเบญเบ -b เบˆเบฐเบšเปเปˆเบชเป‰เบฒเบ‡เบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบ—เบตเปˆเปเบ•เบเบ•เปˆเบฒเบ‡เบเบฑเบ™เบ—เบตเปˆเบชเบฑเบ‡เป€เบเบ”เป€เบซเบฑเบ™. เบเบปเบโ€‹เบ•เบปเบงโ€‹เบขเปˆเบฒเบ‡,
เป€เบˆเบปเป‰เบฒเบญเบฒเบ”เบˆเบฐเป€เบซเบฑเบ™เบ„เบณเบชเบฑเบš bucket เบญเบทเปˆเบ™เบ—เบตเปˆเบชเป‰เบฒเบ‡เบ‚เบทเป‰เบ™เบกเบฒ, เป‚เบ”เบเบšเปเปˆเบกเบตเบซเบเบฑเบ‡เปเบฒเบเป€เบ–เบดเบ‡เบกเบฑเบ™: เป€เบžเบฒเบฐเบงเปˆเบฒเบ—เบฑเบ‡เปเบปเบ”
เป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ”เปƒเบ™ GO เปเบกเปˆเบ™เป€เบ›เบฑเบ™เบ•เบปเบงเปเบ—เบ™เบขเบนเปˆเปƒเบ™เป„เบŸเบฅเปŒเบ—เบตเปˆเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”.

เบ•เบปเบงเป€เบฅเบทเบญเบ bucket เปเบกเปˆเบ™เบกเบตเบ„เบงเบฒเบกเบˆเปเบฒเป€เบ›เบฑเบ™เปเบ—เป‰เป†เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบšเบฒเบ‡เป„เบŸเบฅเปŒเบšเบฒเบ‡เป†เบ—เบตเปˆเป€เบเบฑเบšเป„เบงเป‰เป€เบเบปเปˆเบฒ,
เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เปเบกเปˆเบ™ static เปเบฅเบฐเบ–เบทเบเบชเป‰เบฒเบ‡เบ‚เบทเป‰เบ™เปƒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบ—เบตเปˆเบ‚เป‰เบญเบ™เบ‚เป‰เบฒเบ‡; เบžเบงเบเป€เบ‚เบปเบฒเป€เบˆเบปเป‰เบฒเบกเบตเปเบ™เบงเป‚เบ™เป‰เบกเบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบชเบฐเบชเบปเบก "เบŠเปˆเบญเบ‡เบซเบงเปˆเบฒเบ‡"
เป€เบกเบทเปˆเบญเป€เบงเบฅเบฒเบœเปˆเบฒเบ™เป„เบ› (เป€เบŠเบฑเปˆเบ™: GO เบˆเบฐเป€เบžเบตเปˆเบกเบเบฒเบ™เบœเบนเบเบกเบฑเบ”เบฅเบนเบเปƒเปเปˆ, เปเบ•เปˆเป„เบŸเบฅเปŒเบšเบฒเบ‡เป€เบšเบปเบฒเบ„เบปเบ‡เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบšเปเปˆเบ‚เบถเป‰เบ™เบเบฑเบš.
เบงเบฑเบ™เบ—เบต, เบ”เบฑเปˆเบ‡เบ™เบฑเป‰เบ™เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™ gene เปƒเบ”เป†เบ—เบตเปˆเบฅเบฐเบšเบธเป„เบงเป‰เปƒเบ™เบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเปƒเบซเบกเปˆเบ™เบตเป‰เบˆเบฐเปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบเบฑเบš OTHER-binding เปƒเบ™
เบšเบฒเบ‡)

GRAPH เบ„เบงเบฒเบกเบœเบดเบ”เบžเบฒเบ”
เบเบฐเบฅเบธเบ™เบฒเบฎเบฑเบšเบŠเบฒเบšเบงเปˆเบฒเป„เบŸเบฅเปŒ ontology เป€เบฅเบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบญเบฒเบ”เบˆเบฐเบฅเป‰เบฒเบชเบฐเป„เบซเบกเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบ›เบฑเบ”เบˆเบธเบšเบฑเบ™
ontology.

เปƒเบ™เบ›เบฑเบ”เบˆเบธเบšเบฑเบ™ map2slim เบšเปเปˆเป„เบ”เป‰เบฅเบฒเบเบ‡เบฒเบ™เบเบฒเบŸเบ—เบตเปˆเบšเปเปˆเบเบปเบ‡เบเบฑเบ™เบฅเบฐเบซเบงเปˆเบฒเบ‡เบเบฃเบฒเบŸเบšเบฒเบ‡เป† เปเบฅเบฐเบเบฃเบฒเบŸเปƒเบ™
เป„เบŸเบฅเปŒ ontology เป€เบ•เบฑเบก; เบกเบฑเบ™เปƒเบŠเป‰เป€เบงเบฅเบฒ ontology เป€เบ•เบฑเบกเบ—เบตเปˆเบงเปˆเบฒเป€เบ›เบฑเบ™เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบ—เบตเปˆเปเบ—เป‰เบˆเบดเบ‡. เบขเปˆเบฒเบ‡เปƒเบ”เบเปเบ•เบฒเบก, เป„เบ”เป‰
ontology เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบˆเบฐเบ–เบทเบเบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เป€เบžเบทเปˆเบญเบˆเบฑเบ”เบฎเบนเบšเปเบšเบšเบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบ–เป‰เบฒเบ—เปˆเบฒเบ™เป€เบฅเบทเบญเบ -t -c เป€เบ›เบฑเบ™เบ—เบฒเบ‡เป€เบฅเบทเบญเบ.

OUTPUT
เปƒเบ™เบฎเบนเบšเปเบšเบšเบ›เบปเบเบเบฐเบ•เบด, เป„เบŸเบฅเปŒเบเบฒเบ™เป€เบŠเบทเปˆเบญเบกเป‚เบเบ‡ gene-เบฎเบนเบšเปเบšเบšเบกเบฒเบ”เบ•เบฐเบ–เบฒเบ™เบˆเบฐเบ–เบทเบเบ‚เบฝเบ™. เบ–เบฑเบ™ GO ID
(5) เบˆเบฐเบกเบต GO slim IDs. เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบเบปเบ‡เบเบฑเบšเบ–เบฑเบ™เบ—เบต 2 เปƒเบ™เบ•เบฒเบ•เบฐเบฅเบฒเบ‡
เบ‚เป‰เบฒเบ‡เป€เบ—เบดเบ‡. เปƒเบซเป‰เบชเบฑเบ‡เป€เบเบ”เบงเปˆเบฒเป„เบŸเบฅเปŒเบœเบปเบ™เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบญเบฒเบ”เบกเบตเป€เบชเบฑเป‰เบ™เป€เบžเบตเปˆเบกเป€เบ•เบตเบกเบ—เบตเปˆเป„เบŸเบฅเปŒเบ›เป‰เบญเบ™เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™. เบ™เบตเป‰โ€‹เปเบกเปˆเบ™
เป€เบ™เบทเปˆเบญเบ‡เบˆเบฒเบเบงเปˆเบฒเบšเบฒเบ‡ ID GO เป€เบ•เบฑเบกเบกเบตเบซเบผเบฒเบเบเบงเปˆเบฒเบซเบ™เบถเปˆเบ‡ ID เบ—เบตเปˆเบกเบตเบ„เบงเบฒเบกเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบ—เบตเปˆเบเปˆเบฝเบงเบ‚เป‰เบญเบ‡.

เบ™เบฑเบš MODE

map2slim เบชเบฒเบกเบฒเบ”เบ”เปเบฒเป€เบ™เบตเบ™เบเบฒเบ™เบ”เป‰เบงเบเบ•เบปเบงเป€เบฅเบทเบญเบ -c, เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เบˆเบฐเป€เบฎเบฑเบ”เปƒเบซเป‰เบเบฒเบ™เบ™เบฑเบšเบ‚เบญเบ‡ gene เบ—เบตเปˆเปเบ•เบเบ•เปˆเบฒเบ‡เบเบฑเบ™
เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™เบ—เบตเปˆเบกเบตเปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเปƒเบชเปˆเปเบ•เปˆเบฅเบฐเป„เบฅเบเบฐเบšเบฒเบ‡เป†. เบ–เบฑเบ™เบกเบตเบ”เบฑเปˆเบ‡เบ™เบตเป‰

GO Term
เบ–เบฑเบ™เบ—เปเบฒเบญเบดเบ”เปเบกเปˆเบ™ GO ID เบ•เบดเบ”เบ•เบฒเบกเบ”เป‰เบงเบเบŠเบทเปˆเบ„เปเบฒเบชเบฑเบš (เบŠเบทเปˆเบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเปเบกเปˆเบ™เบชเบฐเบซเบ™เบญเบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบ›เบฑเบ™
เบกเบฑเบ™เป„เบ”เป‰เบ–เบทเบเบžเบปเบšเป€เบซเบฑเบ™เบขเบนเปˆเปƒเบ™เบ—เบฑเบ‡ GO เป€เบ•เบฑเบกเปเบฅเบฐ ontologies slim - เป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เบ›เบปเบเบเบฐเบ•เบดเปเบฅเป‰เบงเบˆเบฐเบ„เบทเบเบฑเบ™
เปเบ•เปˆเบšเบฒเบ‡เบ„เบฑเป‰เบ‡เป„เบŸเบฅเปŒเบšเบฒเบ‡เป†เบˆเบฐเบŠเบฑเบเบŠเป‰เบฒเบเบฒเบ™เบ›เปˆเบฝเบ™เปเบ›เบ‡เปƒเบ™เป„เบŸเบฅเปŒ GO)

เบเบฒเบ™เบ™เบฑเบšเบ‚เบญเบ‡เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™ gene เบ—เบตเปˆเบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบ„เปเบฒเบ—เบตเปˆเบกเบตเบ„เบงเบฒเบกเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบ—เบตเปˆเบเปˆเบฝเบงเบ‚เป‰เบญเบ‡เบ—เบตเปˆเบชเบธเบ”
เบˆเปเบฒโ€‹เบ™เบงเบ™โ€‹เบ‚เบญเบ‡โ€‹เบœเบฐโ€‹เบฅเบดเบ”โ€‹เบ•เบฐโ€‹เบžเบฑเบ™ gene เบ—เบตเปˆโ€‹เปเบ•เบโ€‹เบ•เปˆเบฒเบ‡โ€‹เบเบฑเบ™โ€‹เบชเปเบฒโ€‹เบฅเบฑเบšโ€‹เบเบฒเบ™โ€‹เบ™เบตเป‰โ€‹เปเบกเปˆเบ™โ€‹เบ—เบตเปˆโ€‹เบเปˆเบฝเบงโ€‹เบ‚เป‰เบญเบ‡โ€‹เบ—เบตเปˆโ€‹เบชเบธเบ” / เบเบฐโ€‹เบ—เบฑเบ”โ€‹เบฎเบฑเบ”โ€‹เป‚เบ”เบโ€‹เบเบปเบ‡โ€‹
ID. เป‚เบ”เบเบชเปˆเบงเบ™เปƒเบซเบเปˆเบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเบซเบกเบฒเบเบ„เบงเบฒเบกเบงเปˆเบฒเบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเปเบกเปˆเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เบเบฑเบšเบ„เปเบฒเบ™เบตเป‰,
เบซเบผเบท เบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเปเบกเปˆเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เบ‚เบทเป‰เบ™เบเบฑเบšเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ—เบตเปˆเบกเบตเบฅเบฑเบเบชเบฐเบ™เบฐเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบ™เบตเป‰ เปเบฅเบฐเบšเปเปˆเบกเบตเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ—เบตเปˆเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”
เป„เบฅเบเบฐเบ—เบตเปˆเบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเบงเบฒเบ‡เปเบœเบ™เป„เบงเป‰.

เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบœเบนเป‰เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบชเปˆเบงเบ™เปƒเบซเบเปˆ, เบเบฒเบ™เบ™เบฑเบšเบ™เบตเป‰เบˆเบฐเป€เบ—เบปเปˆเบฒเบเบฑเบšเบˆเปเบฒเบ™เบงเบ™เบ‚เบญเบ‡เบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเป‚เบ”เบเบเบปเบ‡
เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเป€เบ›เบฑเบ™เป„เบฅเบเบฐเบ—เบตเปˆเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบ™เบตเป‰. เบขเปˆเบฒเบ‡เปƒเบ”เบเปเบ•เบฒเบก, เบšเบฒเบ‡เป„เบŸเบฅเปŒเบ—เบตเปˆเบญเปˆเบญเบ™เป€เบžเบเป€เบเบปเปˆเบฒเปเบกเปˆเบ™ "spotty" เปƒเบ™เบ™เบฑเป‰เบ™เบžเบงเบเบกเบฑเบ™
เบเบญเบกเบฎเบฑเบš "เบŠเปˆเบญเบ‡เบซเบงเปˆเบฒเบ‡". เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบเบปเบเบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡, เบ–เป‰เบฒเบซเบฒเบเบงเปˆเบฒเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”เบกเบตเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ—เบฑเบ‡เบซเบกเบปเบ”เบ‚เบญเบ‡ "เบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบžเบฒเบš" เบเบฑเบš
เบ‚เปเป‰เบเบปเบเป€เบงเบฑเป‰เบ™เบ‚เบญเบ‡ "เบžเบถเบ”เบ•เบดเบเปเบฒ" เบซเบผเบฑเบ‡เบˆเบฒเบเบ™เบฑเป‰เบ™เบ—เบธเบเบ„เปเบฒเบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ•เปเปˆเบเบฑเบš "เบžเบถเบ”เบ•เบดเบเปเบฒ" เบซเบผเบทเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบ‚เบญเบ‡เบกเบฑเบ™เบˆเบฐเป€เบ›เบฑเบ™
เบ™เบฑเบšเบขเบนเปˆเบ—เบตเปˆเบ™เบตเป‰

เป€เบšเบดเปˆเบ‡เบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡เบ‚เป‰เบฒเบ‡เบฅเบธเปˆเบกเบ™เบตเป‰

เบˆเบณเบ™เบงเบ™เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™เบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเบ—เบตเปˆเบชเบปเบกเบกเบธเบ”เบงเปˆเบฒเบกเบตเบ„เบงเบฒเบกเบเปˆเบฝเบงเบžเบฑเบ™เบเบฑเบšเป„เบฅเบเบฐเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”
เปเบฅเบฐเบˆเปเบฒเบ™เบงเบ™เบ‚เบญเบ‡เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™ gene เบ—เบตเปˆเปเบ•เบเบ•เปˆเบฒเบ‡เบเบฑเบ™, เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เป„เบ”เป‰เบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเป€เบ–เบดเบ‡เบฅเบนเบเบซเบฅเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เป€เบฅเบทเปˆเบญเบ‡เบ™เบตเป‰
เป„เบญเบ”เบตเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ” (เบซเบผเบทเปเบฒเบเป€เบซเบ”เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบชเปˆเบฅเบฐเบซเบฑเบ”เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”).

เบ—เบธเบ‡เบเบปเบเป€เบฅเบตเบ
เป„เบ› ontology

เป€เบญเบปเบฒเบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡; เบ–เป‰เบฒเบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเปƒเบŠเป‰ -t เปเบฅเบฐ -c เปเบšเบšเบ™เบตเป‰:

map2slim -t -c GO_slims/goslim_generic.obo ontology/gene_ontology.obo gene-associations/gene_association.fb

เบซเบผเบฑเบ‡เบˆเบฒเบเบ™เบฑเป‰เบ™, เบšเบฒเบ‡เบชเปˆเบงเบ™เบ‚เบญเบ‡เบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบญเบฒเบ”เบˆเบฐเป€เบšเบดเปˆเบ‡เบ„เบทเบงเปˆเบฒเบ™เบตเป‰:

GO:0008150 biological_process (biological_process) 34 10025 biological_process
GO:0007610 เบžเบถเบ”เบ•เบดเบเบณ (behavior) 632 632 biological_process
GO:0000004 เบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเบ—เบตเปˆเบšเปเปˆเบฎเบนเป‰เบˆเบฑเบ (เบšเปเปˆเบฎเบนเป‰เบˆเบฑเบเบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบžเบฒเบš) 832 832 biological_process
GO:0007154 เบเบฒเบ™เบชเบทเปˆเบชเบฒเบ™เบœเปˆเบฒเบ™เบกเบทเบ–เบท (cell communication) 333 1701 biological_process
GO:0008037 เบเบฒเบ™เบˆเบณเปเบ™เบเป€เบŠเบ™ (เบเบฒเบ™เบฎเบฑเบšเบฎเบนเป‰เป€เบŠเบฅ) 19 19 เบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบžเบฒเบš
19 เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™เป„เบ”เป‰เบ–เบทเบเบชเป‰เบฒเบ‡เปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเป„เบ›เบ—เบตเปˆ GO:0008037 เบซเบผเบทเบซเบ™เบถเปˆเบ‡เปƒเบ™เบฅเบนเบเบ‚เบญเบ‡เบกเบฑเบ™. (GO:0008037 เปเบกเปˆเบ™เบ‚เปเป‰เบ•เปเปˆเปƒเบšเปƒเบ™เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”, เบ”เบฑเปˆเบ‡เบ™เบฑเป‰เบ™เบเบฒเบ™เบ™เบฑเบšเบ—เบฑเบ‡เบชเบญเบ‡เปเบกเปˆเบ™เบ„เบทเบเบฑเบ™).

เปƒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบเบปเบ‡เบเบฑเบ™เบ‚เป‰เบฒเบก, GO: 0008150 เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบžเบฝเบ‡เปเบ•เปˆ 34 เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™, เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบ„เบงเบฒเบกเบเปˆเบฝเบงเบ‚เป‰เบญเบ‡เบ—เบตเปˆเบชเบธเบ”.
เป„เบฅเบเบฐ. เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบเป‰เบญเบ™เบงเปˆเบฒเบ„เปเบฒเบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบชเปˆเบงเบ™เปƒเบซเบเปˆเบˆเบฐเปเบœเบ™เบ—เบตเปˆเบเบฑเบšเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบšเบฒเบ‡เบ„เบปเบ™เบ‚เบญเบ‡ GO:0008150 เปƒเบ™เปเบšเบšเบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”,
เป€เบŠเบฑเปˆเบ™ GO:0007610 (เบžเบถเบ”เบ•เบดเบเปเบฒ). เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เบฐเบžเบฑเบ™ 34 gene เป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เป„เบ”เป‰เบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เบเบฑเบš
GO:0008150, เบซเบผเบทเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบเบšเบฒเบ‡เบ„เบปเบ™เบ‚เบญเบ‡เบ„เปเบฒเบชเบฑเบšเบ™เบตเป‰เบ—เบตเปˆเบšเปเปˆเบขเบนเปˆเปƒเบ™เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”. เบ™เบตเป‰เบชเบฒเบกเบฒเบ”เบŠเบตเป‰เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™
'เบŠเปˆเบญเบ‡เบซเบงเปˆเบฒเบ‡' เปƒเบ™เบเบฐเบ—เบฑเบ”เบฎเบฑเบ”. เปƒเบซเป‰เบชเบฑเบ‡เป€เบเบ”เบงเปˆเบฒเบเบฒเบ™เปเบฅเปˆเบ™ map2slim เบ”เป‰เบงเบเบ•เบปเบงเป€เบฅเบทเบญเบ -b เบˆเบฐ 'เบชเบฝเบš' เบŠเปˆเบญเบ‡เบซเบงเปˆเบฒเบ‡เป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰
เบเบฑเบšเบ‚เปเป‰เบเปเบฒเบ™เบปเบ” filler เบ›เบญเบก.

เปƒเบŠเป‰ map2slimp เบญเบญเบ™เป„เบฅเบ™เปŒเป‚เบ”เบเปƒเบŠเป‰เบšเปเบฅเบดเบเบฒเบ™ onworks.net


เป€เบŠเบตเบšเป€เบงเบต เปเบฅเบฐเบชเบฐเบ–เบฒเบ™เบตเป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบŸเบฃเบต

เบ”เบฒเบงเป‚เบซเบผเบ”เปเบญเบฑเบš Windows เปเบฅเบฐ Linux

  • 1
    AstrOrzPlayer
    AstrOrzPlayer
    AstrOrz Player เป€เบ›เบฑเบ™เบœเบนเป‰เบ™เบชเบทเปˆเบกเบงเบ™เบŠเบปเบ™เบŸเบฃเบต
    เบŠเบญเบšโ€‹เปเบงโ€‹, เบชเปˆเบงเบ™โ€‹เบซเบ™เบถเปˆเบ‡โ€‹เบญเบตเบ‡โ€‹เปƒเบชเปˆ WMP เปเบฅเบฐ VLCโ€‹. เป„เบ”เป‰
    เบœเบนเป‰เบ™เปเบกเปˆเบ™เบขเบนเปˆเปƒเบ™เบฎเบนเบšเปเบšเบš minimalist, เบกเบต
    เบซเบผเบฒเบโ€‹เบโ€‹เปˆโ€‹เบงเบฒโ€‹เบชเบดเบšโ€‹เบชเบตโ€‹เบซเบปเบงโ€‹เบ‚เปเป‰โ€‹, เปเบฅเบฐโ€‹เบเบฑเบ‡โ€‹เบชเบฒโ€‹เบกเบฒเบ”โ€‹
    b
    เบ”เบฒเบงเป‚เบซเบฅเบ” AstrOrzPlayer
  • 2
    movistartv
    movistartv
    Kodi Movistar+ TV es un ADDON para XBMC/
    Kodi que permite disponer de un
    decodificador de los servicios IPTV de
    Movistar integrado en uno de los
    เบชเบนเบ™โ€‹เบเบฒเบ‡โ€‹เบชเบทเปˆโ€‹เบกเบงเบ™โ€‹เบŠเบปเบ™โ€‹เบกเบฒ ...
    เบ”เบฒเบงเป‚เบซเบฅเบ” movistartv
  • 3
    เบฅเบฐเบซเบฑเบ” :: เบ—เปˆเบญเบ™เป„เบกเป‰
    เบฅเบฐเบซเบฑเบ” :: เบ—เปˆเบญเบ™เป„เบกเป‰
    เบฅเบฐเบซเบฑเบ”::Blocks เป€เบ›เบฑเบ™เปเบซเบผเปˆเบ‡เป€เบ›เบตเบ”เบŸเบฃเบต,
    เบ‚เป‰เบฒเบกเป€เบงเบ—เบต C, C++ เปเบฅเบฐ Fortran IDE
    เบชเป‰เบฒเบ‡เบ‚เบถเป‰เบ™เป€เบžเบทเปˆเบญเบ•เบญเบšเบชเบฐเบซเบ™เบญเบ‡เบ„เบงเบฒเบกเบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบ—เบตเปˆเบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบซเบผเบฒเบเบ—เบตเปˆเบชเบธเบ”
    เบ‚เบญเบ‡โ€‹เบœเบนเป‰โ€‹เบŠเบปเบกโ€‹เปƒเบŠเป‰โ€‹เบ‚เบญเบ‡โ€‹เบ•เบปเบ™โ€‹. เบกเบฑเบ™เป„เบ”เป‰เบ–เบทเบเบญเบญเบเปเบšเบšเปƒเบซเป‰เบซเบผเบฒเบ
    เบ‚เบฐเบซเบเบฒเบ...
    เบ”เบฒเบงเป‚เบซเบฅเบ”เบฅเบฐเบซเบฑเบ”::Blocks
  • 4
    เบ—เปˆเบฒเบกเบเบฒเบ‡
    เบ—เปˆเบฒเบกเบเบฒเบ‡
    เบ—เปˆเบฒเบกเบเบฒเบ‡ เบซเบผเบท Advanced Minecraft Interface
    เปเบฅเบฐโ€‹เบ‚เปเป‰โ€‹เบกเบนเบ™ / เบเบฒเบ™โ€‹เบ•เบดเบ”โ€‹เบ•เบฒเบกโ€‹เป‚เบ„เบ‡โ€‹เบชเป‰เบฒเบ‡โ€‹เป€เบ›เบฑเบ™โ€‹เป€เบ„เบทเปˆเบญเบ‡โ€‹เบกเบทโ€‹เป€เบžเบทเปˆเบญโ€‹
    เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบžเบฒเบšเบฅเบงเบกเบ‚เบญเบ‡ Minecraft
    เป‚เบฅเบ, เป‚เบ”เบเบšเปเปˆเบกเบตเบเบฒเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เบกเบฑเบ™เบขเปˆเบฒเบ‡เปเบ—เป‰เบˆเบดเบ‡. เบกเบฑเบ™
    เบชเบฒโ€‹เบกเบฒเบ” ...
    เบ”เบฒเบงโ€‹เบ™โ€‹เปŒโ€‹เป‚เบซเบฅเบ”โ€‹เปƒเบ™โ€‹เบ—เปˆเบฒเบกโ€‹เบเบฒเบ‡โ€‹
  • 5
    MSYS2
    MSYS2
    MSYS2 เป€เบ›เบฑเบ™โ€‹เบเบฒเบ™โ€‹เป€เบเบฑเบšโ€‹เบเปเบฒโ€‹เบ‚เบญเบ‡โ€‹เป€เบ„เบทเปˆเบญเบ‡โ€‹เบกเบทโ€‹เปเบฅเบฐโ€‹
    เบซเป‰เบญเบ‡เบชเบฐเบซเบกเบธเบ”เบชเบฐเบซเบ™เบญเบ‡เบ—เปˆเบฒเบ™เบ”เป‰เบงเบ
    เบชเบฐโ€‹เบžเบฒเบšโ€‹เปเบงเบ”โ€‹เบฅเป‰เบญเบกโ€‹เบ—เบตเปˆโ€‹เบ‡เปˆเบฒเบโ€‹เบ—เบตเปˆโ€‹เบˆเบฐโ€‹เบ™เปเบฒโ€‹เปƒเบŠเป‰โ€‹เบชเปเบฒโ€‹เบฅเบฑเบšโ€‹เบเบฒเบ™โ€‹เบเปเปˆโ€‹เบชเป‰เบฒเบ‡โ€‹,
    เบเบฒเบ™เบ•เบดเบ”เบ•เบฑเป‰เบ‡เปเบฅเบฐเปเบฅเปˆเบ™ Windows เบžเบทเป‰เบ™เป€เบกเบทเบญเบ‡
    เบŠเบญเบšโ€‹เปเบงโ€‹. เบกเบฑเบ™ con...
    เบ”เบฒเบงเป‚เบซเบฅเบ” MSYS2
  • 6
    libjpeg-turbo
    libjpeg-turbo
    libjpeg-turbo เป€เบ›เบฑเบ™เบ•เบปเบงเปเบ›เบ‡เบชเบฑเบ™เบเบฒเบ™เบฎเบนเบšเบžเบฒเบš JPEG
    เบ—เบตเปˆเปƒเบŠเป‰เบ„เปเบฒเปเบ™เบฐเบ™เปเบฒ SIMD (MMX, SSE2,
    NEON, AltiVec) เป€เบžเบทเปˆเบญเป€เบฅเบฑเปˆเบ‡เบžเบทเป‰เบ™เบ–เบฒเบ™
    เป€เบ›เบตเบ”เบเบฒเบ™เบšเบตเบšเบญเบฑเบ” JPEG เปเบฅเบฐ decompression
    x86,x8...
    เบ”เบฒเบงเป‚เบซเบฅเบ” libjpeg-turbo
  • เป€เบžเบตเปˆเบกเป€เบ•เบตเบก ยป

Linux เบ„เบณ เบชเบฑเปˆเบ‡

  • 1
    abi-tracker
    abi-tracker
    abi-tracker - เป€เบซเบฑเบ™เบžเบฒเบšเบเบฒเบ™เบ›เปˆเบฝเบ™เปเบ›เบ‡ ABI
    เป„เบฅเบเบฐเป€เบงเบฅเบฒเบ‚เบญเบ‡เบซเป‰เบญเบ‡เบชเบฐเปเบธเบ”เบŠเบญเบšเปเบง C/C++.
    เบฅเบฒเบเบฅเบฐเบญเบฝเบ”: เบŠเบทเปˆ: ABI Tracker
    (abi-tracker) เป€เบšเบดเปˆเบ‡เบเบฒเบ™เบ›เปˆเบฝเบ™เปเบ›เบ‡ ABI
    เป„เบฅเบเบฐเป€เบงเบฅเบฒเบ‚เบญเบ‡ C/C+...
    เปเบฅเปˆเบ™ abi-tracker
  • 2
    abicheck
    abicheck
    abicheck - check application binaries
    เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เป‚เบ—เบซเบฒเป€เบญเบเบฐเบŠเบปเบ™เบซเบผเบทเบชเบฑเบ™เบเบฒเบฅเบฑเบเบžเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒ
    เปƒเบ™เบซเป‰เบญเบ‡เบชเบฐเบซเบกเบธเบ”เปเบฅเบฐเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เป€เบŠเบทเปˆเบญเบกเบ•เปเปˆ static เบ‚เบญเบ‡
    เบšเบฒเบ‡เบซเป‰เบญเบ‡เบชเบฐเบซเบกเบธเบ”เบฅเบฐเบšเบปเบš. ...
    เปเบฅเปˆเบ™ abicheck
  • 3
    couriermlm
    couriermlm
    couriermlm - เบšเบฑเบ™เบŠเบตเบฅเบฒเบเบŠเบทเปˆเบ—เบฒเบ‡เป„เบ›เบชเบฐเบ™เบต Courier
    เบœเบนเป‰โ€‹เบˆเบฑเบ”โ€‹เบเบฒเบ™ ...
    เปเบฅเปˆเบ™ couriermlm
  • 4
    couriertcpd
    couriertcpd
    couriertcpd - เป€เบ„เบทเปˆเบญเบ‡เปเบกเปˆเบ‚เปˆเบฒเบเป€เบกเบฅ Courier
    TCP server daemon ...
    เปเบฅเปˆเบ™ couriertcpd
  • 5
    gbklatex
    gbklatex
    bg5latex - เปƒเบŠเป‰ LaTeX เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบ™ Big5
    เป„เบŸเบฅเปŒ encodedtex bg5pdflatex - เปƒเบŠเป‰
    pdfLaTeX เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบ™ Big5 encodedtex
    file bg5+latex - เปƒเบŠเป‰ LaTeX เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบ™ a
    เปƒเบซเบเปˆ5+...
    เปเบฅเปˆเบ™ gbklatex
  • 6
    gbkpdflatex
    gbkpdflatex
    bg5latex - เปƒเบŠเป‰ LaTeX เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบ™ Big5
    เป„เบŸเบฅเปŒ encodedtex bg5pdflatex - เปƒเบŠเป‰
    pdfLaTeX เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบ™ Big5 encodedtex
    file bg5+latex - เปƒเบŠเป‰ LaTeX เป‚เบ”เบเบเบปเบ‡เปƒเบ™ a
    เปƒเบซเบเปˆ5+...
    เปเบฅเปˆเบ™ gbkpdflatex
  • เป€เบžเบตเปˆเบกเป€เบ•เบตเบก ยป

Ad