maskAlignedReads - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

maskAlignedReads.py - Mask aligned reads in regions file

ລາຍລະອຽດ

ການນໍາໃຊ້: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]

inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn

ໃຊ້ in.cmp.h5 ເພື່ອປິດບັງພື້ນທີ່ທີ່ສອດຄ້ອງກັນຂອງໄຟລ໌ໃນ in.rgn.h5, ຂຽນອອກໄປຫາອັນໃໝ່.
rgn.fofn.

ຕຳ ແໜ່ງ ການໂຕ້ຖຽງ:
ໃນCmpFile
ໄຟລ໌ cmp.h5 ປ້ອນຂໍ້ມູນ.

inRgnFofn
fofn ຂອງໄຟລ໌ຕາຕະລາງພາກພື້ນ input.

outRgnFofn
fofn ຂອງໄຟລ໌ຕາຕະລາງພາກພື້ນຜົນຜະລິດ.

ທາງເລືອກ ການໂຕ້ຖຽງ:
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ

-v, - ການປ່ຽນແປງ
ສະ​ແດງ​ຕົວ​ເລກ​ສະ​ບັບ​ຂອງ​ໂຄງ​ການ​ແລະ​ອອກ​

-l ບັນທຶກບັນຊີ, --logFile ບັນທຶກບັນຊີ
ລະບຸໄຟລ໌ທີ່ຈະເຂົ້າສູ່ລະບົບ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນເປັນ stderr. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ມີ)

-d, --debug
ເພີ່ມ verbosity ຂອງການບັນທຶກ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ຖືກຕ້ອງ)

-i, -- ຂໍ້​ມູນ
ສະແດງຂໍ້ມູນບັນທຶກຂໍ້ມູນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ຖືກຕ້ອງ)

ໃຊ້ maskAlignedReads ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net