ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ micro_razers ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
micro_razers
ສະຫຼຸບສັງລວມ
micro_razers [ຕົວເລືອກ]
ລາຍລະອຽດ
MicroRazerS ໃຊ້ຍຸດທະສາດການສ້າງແຜນທີ່ໂດຍອີງໃສ່ຄໍານໍາຫນ້າເພື່ອເຮັດແຜນທີ່ RNA ຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ອາດຈະອ່ານໄດ້
ປະກອບມີ 3' ລຳດັບອະແດັບເຕີ.
(c) ລິຂະສິດ 2009 ໂດຍ Anne-Katrin Emde.
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້.
- ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບ
ຕົວເລືອກຫຼັກ::
-o, -- ຜົນຜະລິດ ເອກະສານ
ປ່ຽນຊື່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: .ຜົນໄດ້ຮັບ.
-rr, --ອັດຕາການຮັບຮູ້ NUMBER
ກໍານົດອັດຕາການຮັບຮູ້ສ່ວນຮ້ອຍໃນໄລຍະ [80..100]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 100.
-sL, -- ຄວາມຍາວຂອງແກ່ນ NUMBER
ຄວາມຍາວຂອງແກ່ນໃນຂອບເຂດ [10..inf]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 16.
-ສ, -- seed ຜິດພາດ
ອະນຸຍາດໃຫ້ສໍາລັບຄວາມຜິດພາດຫນຶ່ງໃນແກ່ນ
-f, --ຕໍ່
ແຜນທີ່ອ່ານພຽງແຕ່ເພື່ອສົ່ງຕໍ່ strands.
-r, -- ປີ້ນ
ແຜນທີ່ອ່ານພຽງແຕ່ເພື່ອປີ້ນກັບ strands.
-mN, --match-N
'N' ກົງກັບຕົວອັກສອນອື່ນໆທັງໝົດ
-m, -- hits ສູງສຸດ NUMBER
ຜົນຜະລິດພຽງແຕ່ NUM ຂອງ hits ທີ່ດີທີ່ສຸດໃນໄລຍະ [1..inf]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 100.
- ປ, --purge-ambiguous
ລ້າງການອ່ານທີ່ມີຫຼາຍກວ່າ max- hits ທີ່ດີທີ່ສຸດທີ່ກົງກັນ
- ມ, -- ຄວາມຈໍາຕໍ່າ
ຫຼຸດຜ່ອນການໃຊ້ຫນ່ວຍຄວາມຈໍາໃນຄ່າໃຊ້ຈ່າຍຂອງ runtime
-v, -- verbose
ໂໝດ verbose
-vv, --vverbose
ໂຫມດ verbose ຫຼາຍ
ຕົວເລືອກຮູບແບບຜົນຜະລິດ::
-ຂອງ, --ຮູບແບບຜົນຜະລິດ NUMBER
ກໍານົດຮູບແບບຜົນຜະລິດ. 0 = ຮູບແບບ MicroRazerS, 1 = SAM. ໃນຂອບເຂດ [0..1].
-a, --ການຈັດວາງ
ຖິ້ມການຈັດລໍາດັບສໍາລັບແຕ່ລະການແຂ່ງຂັນ
-gn, --genome-naming NUMBER
ເລືອກວິທີການຕັ້ງຊື່ genomes. 0 = ໃຊ້ Fasta id, 1 = enumerate ເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍ 1. ໃນ
ຊ່ວງ [0..1]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.
-rn, --ອ່ານຊື່ NUMBER
ເລືອກວິທີການອ່ານຊື່. 0 = ໃຊ້ Fasta id, 1 = enumerate ເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍ 1. ໃນ
ຊ່ວງ [0..1]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.
- ດັ່ງນັ້ນ, --sort-order NUMBER
ເລືອກວິທີການຈັດຮຽງທີ່ກົງກັນ. 0 = ຈໍານວນອ່ານ, 1 = ຕໍາແຫນ່ງ genome. ຢູ່ໃນຂອບເຂດ
[0..1]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.
-pf, --ຮູບແບບຕໍາແຫນ່ງ NUMBER
ເລືອກເລກຕໍາແຫນ່ງເລີ່ມຕົ້ນ / ສິ້ນສຸດ (ເບິ່ງພາກສ່ວນປະສານງານຂ້າງລຸ່ມນີ້). 0 = ຊ່ອງຫວ່າງ,
1 = ພື້ນທີ່ຕໍາແຫນ່ງ. ໃນຂອບເຂດ [0..1]. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.
ເວີຊັ່ນ
micro_razers ເວີຊັ່ນ: 1.0.1 ອັບເດດຫຼ້າສຸດເດືອນ ກໍລະກົດ 2009
ໃຊ້ micro_razers ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
