ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ CStone ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ເປັນ cstone.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ CStone ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
Cstone
ລາຍລະອຽດ
CStone ເປັນຕົວປະກອບ de novo ສໍາລັບຂໍ້ມູນ RNA-Seq ທີ່ໃຊ້ de Bruijn ເຊັ່ນກຣາຟແລະອະທິບາຍແຕ່ລະ contig ທີ່ຜະລິດດ້ວຍຫນຶ່ງໃນສາມລະດັບການຈັດປະເພດກາຟທີ່ຊີ້ບອກວ່າມັນສາມາດຮັບປະກັນໄດ້ຫຼືບໍ່. ລະດັບການຈັດປະເພດແມ່ນຂຶ້ນກັບຄວາມຊັບຊ້ອນຂອງຄອບຄົວ gene ທີ່ມາຈາກການອ່ານ. ເປັນຜົນມາຈາກຜະລິດຕະພັນ, ນີ້ຍັງໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບການແຕ່ງຫນ້າໂຄງສ້າງຂອງຄອບຄົວພັນທຸກໍາທີ່ຕິດພັນກັບລໍາດັບ. ລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມຈະມີຢູ່ໃນເອກະສານຂອງພວກເຮົາໃນໄວໆນີ້: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
ຄຸນລັກສະນະ
- ການປະກອບ de novo ຂອງຂໍ້ມູນ RNA-Seq.
- ການກໍານົດຂອງ contigs ທີ່ບໍ່ແມ່ນchimeric.
- ຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂ້າມເວທີ.
- ກະປ໋ອງທີ່ສາມາດປະຕິບັດໄດ້.
- ບໍ່ມີແພັກເກດພາຍນອກທີ່ຕ້ອງການ.
- ລະຫັດງ່າຍທີ່ຈະປະຕິບັດຕາມແລະລວມເຂົ້າກັບເຄື່ອງມືອື່ນໆ.
- ຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບຄວາມຊັບຊ້ອນຂອງຄອບຄົວພັນທຸກໍາ.
- de Bruijn ມັກ (ອ່ອນກວ່າ) ວິທີການ.
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/cstone/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
