ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ EXCAVATOR-tool ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ EXCAVATOR-ເຄື່ອງມືເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
EXCAVATOR-ເຄື່ອງມືທີ່ຈະດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
ເອົາໃຈໃສ່!!!!!ເອົາໃຈໃສ່!ພວກເຮົາຈັດພີມມາບໍ່ດົນມານີ້ກ່ຽວກັບ BMC Genomics ຊຸດຊອບແວນະວະນິຍາຍ, ທີ່ມີຊື່ວ່າ XCAVATOR, ສໍາລັບການກໍານົດຂອງ CNVs / CNAs ຈາກການອ່ານສັ້ນແລະຍາວການທົດລອງລໍາດັບ genome ທັງຫມົດ (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR ແມ່ນມີໃຫ້ຟຣີຢູ່ http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR ເປັນຊຸດຊອບແວໃໝ່ສຳລັບການກວດພົບຕົວແປຕົວເລກສຳເນົາ (CNVs) ຈາກຂໍ້ມູນການຈັດລຳດັບທັງໝົດ exome.
EXCAVATOR ໄດ້ຖືກຈັດພີມມາກ່ຽວກັບຊີວະວິທະຍາຂອງ Genome (http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
######################
ລະວັງ!!!!! ເພື່ອໃຊ້ເຄື່ອງມື EXCAVATOR ຢ່າງຖືກຕ້ອງ, ຜູ້ໃຊ້ຕ້ອງດາວໂຫຼດໄຟລ໌ແຜນທີ່ເປັນເອກະລັກສະເພາະທີ່ລິ້ງຕໍ່ໄປນີ້:
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz (ສໍາລັບ hg19)
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
ຄຸນລັກສະນະ
- ການຈັດລໍາດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປ
- ສຳເນົາຕົວປ່ຽນຕົວເລກ
- ການຈັດລໍາດັບ Exome ທັງໝົດ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/excavatortool/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.