GoGPT Best VPN GoSearch

OnWorks favicon

kSNP ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ດາວໂຫຼດອອນໄລນ໌ສໍາລັບ Linux

ດາວໂຫຼດ kSNP ຟຣີເພື່ອແລ່ນໃນແອັບ Linux ອອນໄລນ໌ Linux ເພື່ອແລ່ນອອນໄລນ໌ໃນ Ubuntu ອອນໄລນ໌, Fedora ອອນໄລນ໌ ຫຼື Debian ອອນໄລນ໌

ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ kSNP ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ kSNP3.1_Linux_package.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.

ດາວ​ນ​໌​ໂຫລດ​ແລະ​ດໍາ​ເນີນ​ການ​ອອນ​ໄລ​ນ​໌ app ນີ້​ມີ​ຊື່ kSNP ເພື່ອ​ແລ່ນ​ໃນ Linux ອອນ​ໄລ​ນ​໌​ກັບ OnWorks ໄດ້​ຟຣີ​.

ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:

- 1. ດາວ​ໂຫຼດ​ຄໍາ​ຮ້ອງ​ສະ​ຫມັກ​ນີ້​ໃນ PC ຂອງ​ທ່ານ​.

- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.

- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.

- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.

- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.

- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.

kSNP ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌


Ad


ລາຍລະອຽດ

kSNP ກໍານົດ SNPs pan-genome ໃນຊຸດຂອງລໍາດັບ genome, ແລະຄາດຄະເນຕົ້ນໄມ້ phylogenetic ໂດຍອີງໃສ່ SNPs ເຫຼົ່ານັ້ນ. ການຄົ້ນພົບ SNP ແມ່ນອີງໃສ່ການວິເຄາະ k-mer, ແລະບໍ່ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີການຈັດລໍາດັບຫຼາຍອັນຫຼືການຄັດເລືອກຂອງ genome ອ້າງອີງ, ດັ່ງນັ້ນ kSNP ສາມາດເອົາ 100 ຂອງ genomes ຈຸລິນຊີເປັນວັດສະດຸປ້ອນ. A SNP locus ແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍ oligo ຂອງຄວາມຍາວ k ອ້ອມຮອບ SNP allele ກາງ. kSNP ສາມາດວິເຄາະທັງ genomes ທີ່ສົມບູນ (ສໍາເລັດຮູບ) ແລະ genomes ທີ່ບໍ່ສໍາເລັດໃນ contigs ປະກອບຫຼືວັດຖຸດິບ, unassembled ອ່ານ. genomes ສໍາເລັດຮູບແລະຍັງບໍ່ສໍາເລັດສາມາດວິເຄາະຮ່ວມກັນ, ແລະ kSNP ສາມາດດາວໂຫລດໄຟລ໌ Genbank ຂອງ genomes ສໍາເລັດຮູບໂດຍອັດຕະໂນມັດແລະລວມເອົາຂໍ້ມູນໃນໄຟລ໌ເຫຼົ່ານັ້ນເຂົ້າໃນ SNP annotation.
Gardner, SN ແລະ Hall, BG 2013. ເມື່ອການຈັດລຽງຂອງ genome ທັງໝົດຈະບໍ່ເຮັດວຽກ: ຊອບແວ kSNP v2 ສຳລັບການຄົ້ນພົບ SNP ທີ່ບໍ່ມີການຈັດຮຽງ ແລະ phylogenetics ຂອງຫຼາຍຮ້ອຍພັນພັນຈຸລິນຊີ. PLoS ONE, 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760



ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/ksnp/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.


ເຊີບເວີ ແລະສະຖານີເຮັດວຽກຟຣີ

ດາວໂຫຼດແອັບ Windows ແລະ Linux

Linux ຄຳ ສັ່ງ

Ad




×
ການ​ໂຄ​ສະ​ນາ
?ຊື້ເຄື່ອງ, ຈອງ, ຫຼືຊື້ທີ່ນີ້ — ບໍ່ມີຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ, ຊ່ວຍໃຫ້ການບໍລິການຟຣີ.