ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ Subread ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ເປັນ subread-2.0.1-source.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ Subread ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
Subread ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
Ad
ລາຍລະອຽດ
ຊຸດຊອບແວ Subread ແມ່ນຊຸດເຄື່ອງມືສໍາລັບການປະມວນຜົນຂໍ້ມູນລໍາດັບຕໍ່ໄປ. ມັນປະກອບມີ Subread aligner, Subjunc exon-exon junction detector ແລະ featureCounts ອ່ານໂຄງການສະຫຼຸບ.ຕົວຈັດຮຽງຍ່ອຍສາມາດຖືກໃຊ້ເພື່ອຈັດຮຽງທັງການອ່ານ gDNA-seq ແລະ RNA-seq. ຕົວຈັດຮຽງ Subjunc ໄດ້ຖືກລະບຸໄວ້ເພື່ອກວດຫາຈຸດເຊື່ອມຕໍ່ exon-exon. ສໍາລັບການສ້າງແຜນທີ່ຂອງ RNA-seq ອ່ານ, Subread ປະຕິບັດການຈັດຕໍາແຫນ່ງທ້ອງຖິ່ນແລະ Subjunc ປະຕິບັດການຈັດຕໍາແຫນ່ງທົ່ວໂລກ. Subread ແລະ Subjunc ໄດ້ຖືກຈັດພີມມາຢູ່ໃນເອກະສານດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້: Yang Liao, Gordon K Smyth ແລະ Wei Shi. "ຕົວຈັດຮຽງຍ່ອຍ: ແຜນທີ່ການອ່ານໄວ, ຖືກຕ້ອງ ແລະສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ໂດຍການລົງຄະແນນສຽງ, ການຄົ້ນຄວ້າກົດນິວຄລີອິກ, 2013, 41(10): e108
ຄຸນລັກສະນະ
- ອ່ານຕົວຈັດຮຽງ
- ການຈັດລໍາດັບລຸ້ນຕໍ່ໄປ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/subread/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
