ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ ViralFusionSeq [VFS] ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ vfs-2016-08-17.r2.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ ViralFusionSeq [VFS] ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
ViralFusionSeq [VFS] ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
VFS ໄດ້ຮັບການທົດສອບຢ່າງເຕັມທີ່ພາຍໃຕ້ລະບົບ Ubuntu / Debian.** ປະກາດ 1**: VFS ເໜືອກວ່າ Virus-Clip. https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download
ໃນປີ 2016, VFS ເປັນເຄື່ອງມືການເຊື່ອມໂຍງໄວຣັສພຽງແຕ່ທີ່ມີຢູ່ໃນລະບົບ NIH HPC.
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/
ViralFusionSeq (VFS) ເປັນເຄື່ອງມືການຈັດລໍາດັບການສົ່ງຜ່ານສູງທີ່ຫຼາກຫຼາຍ (HTS) ສໍາລັບການຄົ້ນພົບເຫດການການເຊື່ອມໂຍງໄວຣັສ ແລະສ້າງການຖອດຂໍ້ຄວາມຟິວຊັນຄືນໃໝ່ຢູ່ທີ່ຄວາມລະອຽດຖານດຽວ.
VFS ສົມທົບຂໍ້ມູນການ clip ອ່ອນໆ, ການວິເຄາະການອ່ານຄູ່, ແລະການປະກອບ de novo ເປົ້າຫມາຍເພື່ອຄົ້ນພົບແລະບັນທຶກເຫດການ fusion ຂອງມະນຸດໄວຣັດ.
ຮູບແບບສະຖິຕິ empirical ແບບງ່າຍດາຍແຕ່ມີປະສິດທິພາບແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອປະເມີນຄຸນນະພາບຂອງຈຸດແບ່ງສ່ວນປະສົມ.
ຕົວກໍານົດການກໍານົດຂອງຜູ້ໃຊ້ຫນ້ອຍແມ່ນຕ້ອງການ.
ລະຫັດແຫຼ່ງທີ່ມີຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ແລະຄູ່ມືການຕິດຕັ້ງ VFS ແມ່ນມີຢູ່ໃນສ່ວນ "ໄຟລ໌" ຂອງ sourceforge.
ການອ້າງອິງ: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
ຄຸນລັກສະນະ
- ສາມາດນຳໃຊ້ໄດ້ ແລະຖືກທົດສອບຢ່າງເຕັມທີ່ໂດຍໃຊ້ຂໍ້ມູນ RNA-Seq ແລະ DNA-Seq
- ໃຊ້ຂໍ້ມູນທັງ clipped-sequence (CS) ແລະ paired-end (RP) ເພື່ອຄົ້ນພົບການລວມໄວຣັສ.
- ການສ້າງລໍາດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມ fusion ຄືນໃໝ່ໂດຍໃຊ້ຂໍ້ມູນ CS ແລະ RP
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.