ນີ້ແມ່ນແອັບ Windows ທີ່ມີຊື່ວ່າ gsasnp2 ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ gsasnp2-linux-cmd-ubuntu.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ gsasnp2 ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ emulator ອອນ ໄລ ນ ໌ OS OnWorks ຈາກ ເວັບ ໄຊ ທ ໌ ນີ້, ແຕ່ ດີກ ວ່າ Windows ອອນ ໄລ ນ ໌ emulator.
- 5. ຈາກ OnWorks Windows OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກແລະຕິດຕັ້ງມັນ.
- 7. ດາວໂຫລດ Wine ຈາກບ່ອນເກັບມ້ຽນຊອບແວການແຈກຢາຍ Linux ຂອງທ່ານ. ເມື່ອຕິດຕັ້ງແລ້ວ, ທ່ານສາມາດຄລິກສອງຄັ້ງ app ເພື່ອດໍາເນີນການໃຫ້ເຂົາເຈົ້າກັບ Wine. ນອກນັ້ນທ່ານຍັງສາມາດລອງ PlayOnLinux, ການໂຕ້ຕອບທີ່ແປກປະຫຼາດໃນໄລຍະ Wine ທີ່ຈະຊ່ວຍໃຫ້ທ່ານຕິດຕັ້ງໂປລແກລມ Windows ແລະເກມທີ່ນິຍົມ.
ເຫຼົ້າແວງເປັນວິທີການແລ່ນຊອບແວ Windows ໃນ Linux, ແຕ່ບໍ່ມີ Windows ທີ່ຕ້ອງການ. ເຫຼົ້າແວງແມ່ນຊັ້ນຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງ Windows ແຫຼ່ງເປີດທີ່ສາມາດເອີ້ນໃຊ້ໂຄງການ Windows ໂດຍກົງໃນ desktop Linux ໃດກໍໄດ້. ໂດຍພື້ນຖານແລ້ວ, Wine ກໍາລັງພະຍາຍາມປະຕິບັດໃຫມ່ຢ່າງພຽງພໍຂອງ Windows ຕັ້ງແຕ່ເລີ່ມຕົ້ນເພື່ອໃຫ້ມັນສາມາດດໍາເນີນການຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ Windows ທັງຫມົດໄດ້ໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ Windows.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
gsasnp2
ລາຍລະອຽດ
* GSA-SNP2 ເປັນຜູ້ສືບທອດຂອງ GSA-SNP (Nam et al. 2010, NAR web server issue). GSA-SNP2 ຍອມຮັບຂໍ້ມູນສະຫຼຸບ GWAS ຂອງມະນຸດ (ຕົວເລກ rs, p-values) ຫຼື gene-wise p-values ແລະຜົນໄດ້ຮັບ genesets pathway 'ອຸດົມສົມບູນ' ກັບ genes ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ phenotype ທີ່ໃຫ້. ມັນຍັງສະຫນອງເຄືອຂ່າຍປະຕິສໍາພັນທາດໂປຼຕີນຈາກທ້ອງຖິ່ນແລະທົ່ວໂລກໃນເສັ້ນທາງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ.
* ບົດຄວາມ: SYoon, HCTNguyen, YJYoo, JKim, BBaik, SKim, JKim, SKim, DNam, "ການເສີມສ້າງເສັ້ນທາງທີ່ມີປະສິດທິພາບແລະການວິເຄາະເຄືອຂ່າຍຂອງຂໍ້ມູນສະຫຼຸບ GWAS ໂດຍໃຊ້ GSA-SNP2", ການຄົ້ນຄວ້າອາຊິດນິວເຄຼຍ, Vol. 46(10), e60(2018).
* PubMed ID: 29562348
* DOI: 10.1093/nar/gky175
-> ກະລຸນາຍ້າຍຫຼືເຮັດສໍາເນົາຂອງໂຟນເດີ 'Data' ເຂົ້າໄປໃນໂຟນເດີການທົດສອບຢ່າງເຂັ້ມແຂງຂອງທ່ານ (IE LINUX, MAC ຫຼືປ່ອງຢ້ຽມທີ່ລະບຸໂຟເດີ) ເພື່ອອະນຸຍາດໃຫ້ໂຄງການເພື່ອຊອກຫາຂໍ້ມູນທີ່ກໍານົດໄວ້ລ່ວງຫນ້າ.
* ຫມາຍເຫດອັບເດດ:
-> ກັນຍາ-1-2020: ເພີ່ມການອັບເດດສໍາລັບ Ubuntu-20.04. ທ່ານຈະຕ້ອງຕິດຕັ້ງຫໍສະຫມຸດ Boost (sudo apt-get install libboost-all-dev)
-> Mar-7-2018: ປັບປຸງເງື່ອນໄຂ header ໃນໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ
ຄຸນລັກສະນະ
- 1/ 'ການຄວບຄຸມຄວາມຜິດພາດປະເພດທີ່ເຫມາະສົມທີ່ຂ້າພະເຈົ້າ' ບັນລຸໄດ້ໂດຍສອງຂະບວນການດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້: A) ຄະແນນ Gene ແມ່ນ 'ປັບໄດ້' ຈໍານວນຂອງ SNPs ມອບຫມາຍໃຫ້ແຕ່ລະ gene ນໍາໃຊ້ monotone cubic spline trend curve. B) genes ທີ່ຢູ່ໃກ້ຄຽງທີ່ມີຄວາມສໍາພັນລະຫວ່າງ gene ສູງພາຍໃນແຕ່ລະເສັ້ນທາງໄດ້ຖືກໂຍກຍ້າຍ
- 2/ 'ພະລັງງານສູງແລະການຄິດໄລ່ທີ່ໄວ' ອີງຕາມຕົວແບບທີ່ກໍານົດໄວ້ Random
- 3/ 'ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການຟຣີທີ່ສໍາຄັນ'
- 4/ 'ເຄືອຂ່າຍການໂຕ້ຕອບຂອງທາດໂປຼຕີນ' ໃນບັນດາພັນທຸກໍາຂອງສະມາຊິກໄດ້ຖືກເບິ່ງເຫັນສໍາລັບເສັ້ນທາງທີ່ສໍາຄັນ. ຟັງຊັນນີ້ເຮັດໃຫ້ຜູ້ໃຊ້ສາມາດຈັດລໍາດັບຄວາມສໍາຄັນຂອງເຄືອຂ່າຍຍ່ອຍຫຼັກພາຍໃນແລະທົ່ວເສັ້ນທາງທີ່ສໍາຄັນ. ເຄືອຂ່າຍ STRING ແລະ HIPPIE ໄດ້ຖືກສະໜອງໃຫ້ໃນປັດຈຸບັນ
- 5/ 'ງ່າຍທີ່ຈະນໍາໃຊ້': ມັນພຽງແຕ່ຕ້ອງການຂໍ້ມູນສະຫຼຸບ GWAS (ຫຼື gene p-values) ແລະໃຊ້ເວລາພຽງແຕ່ຫນຶ່ງຫຼືສອງນາທີເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຮັບຜົນໄດ້ຮັບ. ເຄື່ອງມືເສັ້ນທາງທີ່ເຮັດດ້ວຍຕົວເອງທີ່ມີປະສິດທິພາບອື່ນໆກໍ່ຕ້ອງການການປ້ອນຂໍ້ມູນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ SNP ເຊັ່ນກັນ ແລະໃຊ້ເວລາດົນກວ່າ. ຜູ້ໃຊ້ຍັງສາມາດອັບໂຫລດເສັ້ນທາງຂອງຕົນ gene-sets ແລະເຄືອຂ່າຍການພົວພັນທາດໂປຼຕີນ.
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Win32 (MS Windows), ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C++, PHP, JavaScript
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/gsasnp2/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
