Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന കമാൻഡ് ബാംടൂളാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
bamtools - BAM (ജീനോം അലൈൻമെന്റ്) ഫയലുകൾ കൈകാര്യം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ടൂൾകിറ്റ്
സിനോപ്സിസ്
ബാംടൂളുകൾ [--സഹായം] കമാൻഡ് [ARGS]
വിവരണം
BAM ഫയലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഗവേഷണ വിശകലനവും ഡാറ്റ മാനേജ്മെന്റും BamTools സുഗമമാക്കുന്നു. അത് നേരിടുന്നു
നിലവിലെ സീക്വൻസിംഗ് സാങ്കേതികവിദ്യകൾ നിർമ്മിക്കുന്ന വലിയ അളവിലുള്ള ഡാറ്റ സാധാരണമാണ്
ടെക്സ്റ്റ് അധിഷ്‌ഠിത പാഴ്‌സറുകൾക്ക് എളുപ്പത്തിൽ കൈകാര്യം ചെയ്യാനാവാത്ത കംപ്രസ് ചെയ്ത, ബൈനറി ഫോർമാറ്റുകളിൽ സംഭരിച്ചിരിക്കുന്നു
ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ് ഗവേഷണത്തിൽ സാധാരണയായി ഉപയോഗിക്കുന്നു.
ഓപ്ഷനുകൾ
മാറ്റുക
BAM-നും മറ്റ് നിരവധി ഫോർമാറ്റുകൾക്കുമിടയിൽ പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു
BAM ഫയലിലെ(കളിൽ) വിന്യാസങ്ങളുടെ എണ്ണം പ്രിന്റ് ചെയ്യുക
കവറേജ്
ഇൻപുട്ട് BAM ഫയലിൽ നിന്ന് കവറേജ് സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ പ്രിന്റ് ചെയ്യുന്നു
ഉപയോക്തൃ-നിർദ്ദിഷ്ട മാനദണ്ഡമനുസരിച്ച് ഫിൽട്ടർ BAM ഫയൽ(കൾ) ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക
തലക്കെട്ട് BAM തലക്കെട്ട് വിവരങ്ങൾ പ്രിന്റ് ചെയ്യുന്നു
സൂചിക BAM ഫയലിനായി സൂചിക സൃഷ്ടിക്കുന്നു
ഒന്നിലധികം BAM ഫയലുകൾ ഒറ്റ ഫയലിലേക്ക് ലയിപ്പിക്കുക
നിലവിലുള്ള BAM ഫയലിൽ നിന്ന് ക്രമരഹിതമായ വിന്യാസങ്ങൾ തിരഞ്ഞെടുക്കുക
ഉപകരണം.
തീരുമാനമെടുക്കുക
ജോടിയാക്കിയ അവസാന വായനകൾ പരിഹരിക്കുന്നു (ഇസ്പ്രോപ്പർപെയർ ഫ്ലാഗ് ആവശ്യാനുസരണം അടയാളപ്പെടുത്തുന്നു)
revert ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റ് മാർക്കുകൾ നീക്കം ചെയ്യുകയും യഥാർത്ഥ അടിസ്ഥാന ഗുണങ്ങൾ പുനഃസ്ഥാപിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു
ചില മാനദണ്ഡങ്ങൾക്കനുസരിച്ച് BAM ഫയൽ അടുക്കുന്നു
split ഉപയോക്തൃ-നിർദ്ദിഷ്ട പ്രോപ്പർട്ടിയിൽ ഒരു BAM ഫയൽ വിഭജിക്കുന്നു, ഇതിനായി ഒരു പുതിയ BAM ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കുന്നു
ഓരോ മൂല്യവും കണ്ടെത്തി
സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ ഇൻപുട്ട് BAM ഫയലിൽ നിന്ന് ചില അടിസ്ഥാന സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ അച്ചടിക്കുന്നു
ഒരു നിർദ്ദിഷ്ട കമാൻഡിനെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് 'bamtools help COMMAND' കാണുക.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ബാംടൂളുകൾ ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
