Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന കമാൻഡ് കംപാലിൻ ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
compalign - രണ്ട് ഒന്നിലധികം വിന്യാസങ്ങൾ താരതമ്യം ചെയ്യുക
സിനോപ്സിസ്
compalign [-ഓപ്ഷനുകൾ]
വിവരണം
compalign വിശ്വസനീയമായ വിന്യാസത്തിനും ടെസ്റ്റിനും ഇടയിലുള്ള ഫ്രാക്ഷണൽ "ഐഡന്റിറ്റി" കണക്കാക്കുന്നു
വിന്യാസം. രണ്ട് ഫയലുകളിലും കൃത്യമായി ഒരേ ക്രമങ്ങൾ അടങ്ങിയിരിക്കണം
ഓർഡർ.
ഒന്നിലധികം സീക്വൻസ് അലൈൻമെന്റുകളുടെ ഐഡന്റിറ്റിയെ ശരാശരി ഐഡന്റിറ്റി ഓവർ ആയി നിർവചിച്ചിരിക്കുന്നു
എല്ലാ N(N-1)/2 ജോഡിവൈസ് അലൈൻമെന്റുകളും.
രണ്ട് സെറ്റ് ജോഡിവൈസ് അലൈൻമെന്റുകളുടെ ഫ്രാക്ഷണൽ ഐഡന്റിറ്റി ഇനിപ്പറയുന്ന രീതിയിൽ നിർവചിച്ചിരിക്കുന്നു
(അലെയിൻ ചെയ്ത അറിയപ്പെടുന്ന സീക്വൻസുകൾ k1, k2, വിന്യസിച്ച ടെസ്റ്റ് സീക്വൻസുകൾ t1, t2 എന്നിവയ്ക്ക്):
പൊരുത്തപ്പെടുന്ന നിരകൾ / മൊത്തം നിരകൾ
ആകെ കോളങ്ങൾ = ആകെയുള്ള നിരകളുടെ എണ്ണം
k1 അല്ലെങ്കിൽ k2-ൽ സാധുതയുള്ള (nongap) ചിഹ്നം;
പൊരുത്തപ്പെടുന്ന നിരകൾ = നിരകളുടെ എണ്ണം
ഇനിപ്പറയുന്നത് ശരിയാണ്:
k1, k2 എന്നിവയ്ക്ക് ഒരു നിശ്ചിത കോളത്തിൽ സാധുവായ ചിഹ്നങ്ങളുണ്ട്; t1 ഉം t2 ഉം
t1/t2 ന്റെ കോളത്തിൽ സമാന ചിഹ്നങ്ങൾ വിന്യസിച്ചിരിക്കുന്നു
വിന്യാസം;
k1 ന് k2 ലെ വിടവിലേക്ക് വിന്യസിച്ചിരിക്കുന്ന ഒരു ചിഹ്നമുണ്ട്; t1 ലെ ആ ചിഹ്നം
ഒരു വിടവിലേക്ക് വിന്യസിച്ചിരിക്കുന്നു;
k2 ന് k1 ലെ വിടവിലേക്ക് വിന്യസിച്ചിരിക്കുന്ന ഒരു ചിഹ്നമുണ്ട്; t2 ലെ ആ ചിഹ്നം
ഒരു വിടവിലേക്കും വിന്യസിച്ചു.
സാധ്യമായ എല്ലാ ജോഡികളുടെയും സ്കോറുകൾ കണക്കാക്കിയതിനാൽ, അൽഗോരിതം ക്രമത്തിലാണ് (N^2)L
L നീളമുള്ള N ശ്രേണികൾ; വലിയ സീക്വൻസ് സെറ്റുകൾക്ക് കുറച്ച് സമയമെടുക്കും.
ഓപ്ഷനുകൾ
ലഭ്യമായ ഓപ്ഷനുകൾ:
-h ഹ്രസ്വ സഹായവും ഉപയോഗ വിവരങ്ങളും പ്രിന്റ് ചെയ്യുക.
-c അടയാളപ്പെടുത്തിയ #=CS സമവായ ഘടനയ്ക്ക് കീഴിൽ മാത്രം താരതമ്യം ചെയ്യുക.
--വിവരങ്ങൾ
രണ്ട് വിന്യാസങ്ങളും ഫോർമാറ്റിലാണെന്ന് വ്യക്തമാക്കുക (എംഎസ്എഫ്, ഉദാഹരണത്തിന്).
--നിശബ്ദമായി
വെർബോസ് ഹെഡർ അടിച്ചമർത്തുക (റിഗ്രഷൻ ടെസ്റ്റിംഗിൽ ഉപയോഗിക്കുന്നു).
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് compalign ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
