Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന DBshow എന്ന കമാൻഡാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
DBshow - ഒരു Dazzler ഡാറ്റാബേസിൽ സംഭരിച്ചിരിക്കുന്ന റീഡുകൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുക
സിനോപ്സിസ്
ഡിബിഷോ [-unqUQ] [-wint(80)] [-mട്രാക്ക്]+ പാത:db|ഡാം [ വായിക്കുന്നു:FILE | വായിക്കുന്നു:പരിധി ...]
വിവരണം
ഡാറ്റാബേസിൽ ആവശ്യപ്പെട്ട വായനകൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നു പാത.db അല്ലെങ്കിൽ പാത.അണക്കെട്ട്. സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി കമാൻഡ്
ട്രിം ചെയ്ത ഡാറ്റാബേസിന് ബാധകമാണ്, എന്നാൽ എങ്കിൽ -u സജ്ജീകരിച്ച ശേഷം മുഴുവൻ ഡിബിയും ഉപയോഗിക്കും. ഇല്ലെങ്കിൽ വായിക്കുക
ആർഗ്യുമെന്റുകൾ നൽകിയ ശേഷം ഡാറ്റാബേസിൽ അല്ലെങ്കിൽ ഡാറ്റാബേസ് ബ്ലോക്കിലെ ഓരോ റീഡും പ്രദർശിപ്പിക്കും.
അല്ലെങ്കിൽ ഇൻപുട്ട് ഫയലോ വിതരണം ചെയ്ത പൂർണ്ണസംഖ്യ ശ്രേണികളുടെ പട്ടികയോ ഓർഡിനൽ സ്ഥാനങ്ങൾ നൽകുന്നു
db-യുടെ സജീവമായി ലോഡ് ചെയ്ത ഭാഗത്ത്. ഒരു ഫയലിന്റെ കാര്യത്തിൽ, അതിൽ ലളിതമായി അടങ്ങിയിരിക്കണം
ഒരു വായന സൂചിക, ഓരോ വരിയിലും ഒന്ന്. മറ്റൊരു സാഹചര്യത്തിൽ, ഒരു റീഡ് റേഞ്ച് ഒന്നുകിൽ ഒറ്റ പൂർണ്ണസംഖ്യയാണ്
ചിഹ്നം $, ഈ സാഹചര്യത്തിൽ റീഡ് ശ്രേണിയിൽ ആ വായന (അവസാനം വായിച്ചത്) അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു
$) ആണെങ്കിൽ ഡാറ്റാബേസ് ഒരു ഡാഷ് കൊണ്ട് വേർതിരിച്ച രണ്ട് പോസിറ്റീവ് പൂർണ്ണസംഖ്യകൾ നൽകാം
പൂർണ്ണസംഖ്യകളുടെ ഒരു ശ്രേണി സൂചിപ്പിക്കുക, ഇവിടെ വീണ്ടും $ എന്നത് അവസാനമായി വായിച്ചതിന്റെ സൂചികയെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു
സജീവമായി ലോഡുചെയ്ത db. ഉദാഹരണത്തിന്, 1 3-5 $ ഡിസ്പ്ലേകൾ 1, 3, 4, 5 എന്നിവയും അവസാനമായി വായിച്ചതും
സജീവമായ db. മറ്റൊരു ഉദാഹരണമെന്ന നിലയിൽ, സജീവമായ db-യിൽ 1-$ ഓരോ വായനയും പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നു (the
സ്ഥിരസ്ഥിതി).
സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി റീഡ് സീക്വൻസുകളുടെ ഒരു .fasta ഫയൽ പ്രദർശിപ്പിക്കും. എങ്കിൽ -q ഓപ്ഷൻ സജ്ജമാക്കി,
തുടർന്ന് ക്യുവി സ്ട്രീമുകളും ഫാസ്റ്റ ഫോർമാറ്റിന്റെ നിലവാരമില്ലാത്ത പരിഷ്ക്കരണത്തിൽ പ്രദർശിപ്പിക്കും.
എങ്കില് -n ഓപ്ഷൻ സജ്ജീകരിച്ചു, തുടർന്ന് ഡിഎൻഎ ക്രമം അല്ല പ്രദർശിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു. എങ്കിൽ -Q ഓപ്ഷൻ സജ്ജീകരിച്ചിരിക്കുന്നു
അപ്പോൾ ഒരു .quiva ഫയൽ പ്രദർശിപ്പിക്കും, ഈ സാഹചര്യത്തിൽ the -n ഒപ്പം -m ഓപ്ഷനുകൾ സജ്ജമാക്കിയേക്കില്ല (കൂടാതെ
The -q ഒപ്പം -w ഓപ്ഷനുകൾക്ക് യാതൊരു ഫലവുമില്ല).
ഒന്നോ അതിലധികമോ മാസ്കുകൾ സജ്ജീകരിച്ചിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ -m ഓപ്ഷൻ പിന്നെ ട്രാക്ക് ഇടവേളകളും ആണ്
ഒരു അധിക ഹെഡർ ലൈനിൽ പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും ഒരു ഇടവേളയ്ക്കുള്ളിലെ ബേസുകൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു
മറ്റെല്ലാ അടിസ്ഥാനങ്ങൾക്കും ഉപയോഗിച്ചതിന് വിപരീതമായ കേസ്. സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി ഔട്ട്പുട്ട് സീക്വൻസുകളാണ്
ചെറിയ അക്ഷരത്തിലും ഓരോ വരിയിലും 80 അക്ഷരങ്ങൾ. ദി -U വലിയക്ഷരം ഉപയോഗിക്കണമെന്ന് ഓപ്ഷൻ വ്യക്തമാക്കുന്നു,
ഓരോ വരിയിലോ ഉള്ള പ്രതീകങ്ങൾ, അല്ലെങ്കിൽ വരിയുടെ വീതി എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് ഏത് പോസിറ്റീവ് മൂല്യത്തിലും സജ്ജീകരിക്കാനാകും -w
ഓപ്ഷൻ.
ഔട്ട്പുട്ട് ആയ .fasta അല്ലെങ്കിൽ .quiva ഫയലുകൾ ഒരു DB ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ കഴിയും fasta2DB(1) ഉം
quiva2DB(1) (എങ്കിൽ -q ഒപ്പം -n ഓപ്ഷനുകൾ സജ്ജമാക്കിയിട്ടില്ല, ഇല്ല -m ഓപ്ഷനുകൾ സജ്ജീകരിച്ചിരിക്കുന്നു), ഒരെണ്ണം നൽകുന്നു
ടെസ്റ്റിംഗ് ആവശ്യങ്ങൾക്കായി റീഡുകളുടെ ഒരു ഉപവിഭാഗത്തിന്റെ DB ഉണ്ടാക്കുന്നതിനുള്ള ലളിതമായ മാർഗ്ഗം.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് DBshow ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
