Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന em_conse കമാൻഡ് ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
ദോഷങ്ങൾ - ഒന്നിലധികം വിന്യാസത്തിൽ നിന്ന് ഒരു സമവായ ക്രമം സൃഷ്ടിക്കുക
സിനോപ്സിസ്
കോണ് - ക്രമം seqset [- ഡാറ്റാ ഫയൽ മാട്രിക്സ്] [- ബഹുസ്വരത ഫ്ലോട്ട്] [- ഐഡന്റിറ്റി പൂർണ്ണസംഖ്യ]
[-സെറ്റ്കേസ് ഫ്ലോട്ട്] - outseq seqout [-ചേന സ്ട്രിംഗ്]
കോണ് -ഹെൽപ്പ്
വിവരണം
കോണ് EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ സോഫ്റ്റ്‌വെയർ
സ്യൂട്ട്"). ഇത് "അലൈൻമെന്റ്: കൺസെൻസസ്" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിന്റെ (കളുടെ) ഭാഗമാണ്.
ഓപ്ഷനുകൾ
ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
- ക്രമം seqset
ഒരു സീക്വൻസ് അലൈൻമെന്റ് അടങ്ങുന്ന ഫയൽ.
- ഡാറ്റാ ഫയൽ മാട്രിക്സ്
സീക്വൻസുകൾ താരതമ്യം ചെയ്യുമ്പോൾ ഉപയോഗിക്കുന്ന സ്കോറിംഗ് മാട്രിക്സ് ഫയലാണിത്. സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി അത്
ഫയൽ 'EBLOSUM62' (പ്രോട്ടീനുകൾക്ക്) അല്ലെങ്കിൽ 'EDNAFULL' ഫയൽ (ന്യൂക്ലിക് സീക്വൻസുകൾക്ക്). ഇവ
EMBOSS ഇൻസ്റ്റാളേഷന്റെ 'ഡാറ്റ' ഡയറക്‌ടറിയിൽ ഫയലുകൾ കാണപ്പെടുന്നു.
അധികമായ വിഭാഗം
- ബഹുസ്വരത ഫ്ലോട്ട്
സമവായമില്ലാത്ത പോസിറ്റീവ് പൊരുത്തങ്ങളുടെ എണ്ണത്തിന് ഒരു കട്ട് ഓഫ് സജ്ജീകരിക്കുക.
ഡിഫോൾട്ട് ബഹുത്വത്തെ എല്ലാ സീക്വൻസുകളുടെയും മൊത്തം ഭാരത്തിന്റെ പകുതിയായി കണക്കാക്കുന്നു
വിന്യാസം. സ്ഥിര മൂല്യം: @($(sequence.totweight) / 2)
- ഐഡന്റിറ്റി പൂർണ്ണസംഖ്യ
അതിനായി ഒരു സൈറ്റിൽ ആവശ്യമായ ഐഡന്റിറ്റികളുടെ എണ്ണം സജ്ജീകരിക്കാനുള്ള സൗകര്യം നൽകുന്നു
ആ സ്ഥാനത്ത് ഒരു സമവായം ഉണ്ടാക്കുക. അതിനാൽ, ഇത് സംഖ്യയായി സജ്ജമാക്കിയാൽ
ഐഡന്റിറ്റികളുടെ നിരകൾ മാത്രമേ സമവായത്തിന് സംഭാവന ചെയ്യുന്നുള്ളൂ.
-സെറ്റ്കേസ് ഫ്ലോട്ട്
സമവായം വലിയക്ഷരത്തിന് മുകളിലുള്ള പോസിറ്റീവ് പൊരുത്തങ്ങളുടെ പരിധി സജ്ജമാക്കുന്നു
അതിനു താഴെയാണ് സമവായം ചെറിയ അക്ഷരത്തിലുള്ളത്. സ്ഥിര മൂല്യം: @(
$(sequence.totweight) / 2)
ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
- outseq seqout
-ചേന സ്ട്രിംഗ്
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് em_conse ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
