fastaq-to_tiling_bam - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

fastaq_to_tiling_bam - ഇൻപുട്ടിലുടനീളം ഒരേപോലെ വ്യാപിച്ചിരിക്കുന്ന റീഡുകളുടെ ഒരു BAM ഫയൽ ഉണ്ടാക്കുക
സൂചന

വിവരണം

ഉപയോഗം: fastaq_to_tiling_bam [ഓപ്ഷനുകൾ]


ഒരു സീക്വൻസ് ഫയൽ എടുക്കുന്നു. പൂർണ്ണമായ (ജോടിയാക്കാത്ത) ടൈലിംഗ് റീഡുകൾ അടങ്ങിയ ഒരു BAM ഫയൽ നിർമ്മിക്കുന്നു
മുഴുവൻ ജീനോം

പൊസിഷണൽ വാദങ്ങൾ:
infile ഇൻപുട്ട് ഫാസ്റ്റ/ക്യു ഫയലിന്റെ പേര്

വായന_ദൈർഘ്യം
വായനയുടെ ദൈർഘ്യം

വായിക്കുക_ഘട്ടം
ഓരോ വായനയുടെയും ആരംഭം തമ്മിലുള്ള ദൂരം

റീഡ്_പ്രിഫിക്സ്
വായിച്ച പേരുകളുടെ ഉപസർഗ്ഗം

ഔട്ട്ഫിൽ
ഔട്ട്പുട്ട് BAM ഫയലിന്റെ പേര്

ഓപ്ഷണൽ വാദങ്ങൾ:
-h, --സഹായിക്കൂ
ഈ സഹായ സന്ദേശം കാണിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക

--ക്വൽ_ചാർ QUAL_CHAR
ഗുണമേന്മയുള്ള സ്‌കോറിനായി ഉപയോഗിക്കേണ്ട പ്രതീകം [I]

--read_group READ_GROUP
നൽകിയിരിക്കുന്ന റീഡ് ഗ്രൂപ്പ് ഐഡി എല്ലാ റീഡുകളിലേക്കും ചേർക്കുക [42]

പ്രധാനപ്പെട്ടത്: samtools നിങ്ങളുടെ പാതയിലാണെന്ന് അനുമാനിക്കുന്നു

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനായി fastaq-to_tiling_bam ഉപയോഗിക്കുക