fsl - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

fsl - FMRI, MRI, DTI ബ്രെയിൻ ഇമേജിംഗ് എന്നിവയ്ക്കുള്ള വിശകലന ഉപകരണങ്ങൾ

വിവരണം

FSL മെഡിക്കൽ ബ്രെയിൻ ഇമേജിംഗ് ഡാറ്റ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു സമഗ്ര ടൂൾകിറ്റ് ആണ്. അത്
ഡാറ്റ പ്രീപ്രോസസ്സിംഗ്, ബ്രെയിൻ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ, ഇമേജ് രജിസ്ട്രേഷൻ എന്നിവയ്ക്കുള്ള ടൂളുകൾ നൽകുന്നു
സ്ഥിതിവിവര വിശകലനങ്ങളുടെ വിശാലമായ സ്പെക്ട്രം. FSL ഉപയോഗിക്കാൻ എളുപ്പമുള്ള GUI നൽകുന്നു.

FSL ശരിയായി സജ്ജീകരിക്കുന്നതിന് നിരവധി പരിസ്ഥിതി വേരിയബിളുകൾ ആവശ്യമാണ്. ഇത് നേടുന്നതിന്,
ദയവായി കോൺഫിഗറേഷൻ സ്ക്രിപ്റ്റ് /etc/fsl/5.0/fsl.sh-ൽ നിന്ന് ലഭ്യമാക്കുക. ഇത് ചെയ്യാനുള്ള ഒരു വഴി
സ്വയമേവ അടങ്ങുന്ന ഒരു ലൈൻ ചേർക്കുക എന്നതാണ്

. /etc/fsl/5.0/fsl.sh

ഒരു ഉപയോക്തൃ ഹോം ഡയറക്ടറിയിലെ .bashrc ഫയലിലേക്ക് (അല്ലെങ്കിൽ മറ്റ് ഷെല്ലുകൾക്കുള്ള അനുബന്ധ ഫയൽ
ബാഷിനെക്കാൾ). നിങ്ങൾ ആദ്യം അത്തരമൊരു ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കേണ്ടതുണ്ട്.

പകരമായി, ഡെബിയൻ പാക്കേജ് എല്ലാ FSL ടൂളുകൾക്കുമായി സിംലിങ്കുകൾ ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്യുന്നു / usr / bin ആ
ഉചിതമായ കോൺഫിഗറേഷൻ സ്വയമേവ ലോഡ് ചെയ്യുന്നത് ശ്രദ്ധിക്കുക. സിംലിങ്ക് പേരുകൾ എന്നിവയാണ്
അനുബന്ധമായി പ്രിഫിക്സ് ചെയ്തു FSL ഫയലിന്റെ പേരിലുള്ള വൈരുദ്ധ്യങ്ങൾ തടയുന്നതിനും അനുവദിക്കുന്നതിനുമുള്ള പതിപ്പ്
ഒരേ സിസ്റ്റത്തിൽ ഒന്നിലധികം പതിപ്പുകൾ. ഉദാഹരണത്തിന്, ദി സ്ലൈസർ കമാൻഡ് ആണ്
ആയി ലഭ്യമാണ് fsl5.0-സ്ലൈസർ. ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് ദയവായി ശ്രദ്ധിക്കുക FSL ഈ സിംലിങ്കുകൾ വഴിയുള്ള ഉപകരണങ്ങൾ
അല്ല മുകളിൽ വിവരിച്ച സജ്ജീകരണ നടപടിക്രമം നടത്താൻ അത്യാവശ്യമാണ്. എന്നിരുന്നാലും, ഈ സൗകര്യം
സവിശേഷത ഡെബിയൻ-നിർദ്ദിഷ്ടമാണ്. FSL കമാൻഡുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നതും പങ്കിടാൻ ഉദ്ദേശിക്കുന്നതുമായ സ്ക്രിപ്റ്റുകൾ
മറ്റുള്ളവയിൽ പ്രിഫിക്‌സ് ചെയ്യാത്ത കമാൻഡ് നെയിമുകളും FSL എൻവയോൺമെന്റ് വേരിയബിളും ആശ്രയിക്കണം
സജ്ജമാക്കുക.

ദി FSL ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ് ചിലപ്പോൾ ഒരു സൂചിപ്പിക്കുന്നു FSLDIR. ഡെബിയൻ സിസ്റ്റങ്ങളിൽ ഇതാണ്
/usr/share/fsl/5.0 FSL പതിപ്പ് 5.0-ന്.

FSL ഡോക്യുമെന്റേഷനും ഓൺലൈൻ സഹായവും നൽകുന്നത് fsl-5.0-doc പാക്കേജ്.

ഉപയോഗം സംബന്ധിച്ച ചോദ്യങ്ങൾ FSL അല്ലെങ്കിൽ അനുബന്ധ സിദ്ധാന്തം എന്നതിൽ പോസ്റ്റ് ചെയ്യാം FSL മെയിലിങ്ങ്
പട്ടിക (കാണുക http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).

സമാന്തരവൽക്കരണം

പ്രവർത്തിക്കുന്ന സൺ ഗ്രിഡെൻജിനിൽ (SGE) ജോലികൾ സമർപ്പിക്കാൻ FSL ക്രമീകരിക്കാം. എല്ലാം അല്ലെങ്കിലും
FSL-ൽ നടപ്പിലാക്കിയിരിക്കുന്ന പ്രവർത്തനം ഇത്തരത്തിലുള്ള സമാന്തരവൽക്കരണത്തെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു, ഏറ്റവും ആവശ്യപ്പെടുന്നത്
പ്രോസസ്സിംഗ് ടൂളുകൾ (ഉദാ. POSSUM, FDT) ചെയ്യുന്നു.

SGE_ROOT എൻവയോൺമെന്റ് വേരിയബിൾ സജ്ജീകരിച്ചിട്ടില്ലെങ്കിലും FSL-ന് SGE ഉപയോഗിക്കാൻ കഴിയണം.
എസ്ജിഇയുടെ ഡെബിയൻ പാക്കേജിന്റെ കാര്യം. ബാച്ച് പ്രോസസ്സിംഗ് പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കാൻ ലളിതമായി സജ്ജമാക്കുക

FSLPARALLEL=1

FSL പ്രവർത്തിക്കുന്ന ഷെല്ലിൽ. ഇത് സ്ഥിരമായി പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കാം

/etc/fsl/5.0/fsl.sh

അല്ലെങ്കിൽ ഓരോ കേസിന്റെ അടിസ്ഥാനത്തിൽ.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് fsl ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക