Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന കമാൻഡ് ഗേവൽ ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
gaeval - ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റ് അടിസ്ഥാനമാക്കി ജീൻ മോഡലുകൾക്കുള്ള കവറേജും ഇന്റർഗ്രിറ്റി സ്കോറുകളും കണക്കാക്കുക
വിന്യാസങ്ങൾ
സിനോപ്സിസ്
ഗേവൽ [ഓപ്ഷനുകൾ] alignments.gff3 genes.gff3 [moregenes.gff3 ...]
വിവരണം
അടിസ്ഥാന ഓപ്ഷനുകൾ:
-h|--സഹായം
ഈ സഹായ സന്ദേശം പ്രിന്റ് ചെയ്ത് പുറത്തുകടക്കുക
-v|--പതിപ്പ്
പതിപ്പ് നമ്പർ പ്രിന്റ് ചെയ്ത് പുറത്തുകടക്കുക
സമഗ്രത സ്കോർ കണക്കാക്കുന്നതിനുള്ള ഭാരം (1.0 വരെ ചേർക്കണം):
-a|--ആൽഫ: ഇരട്ട
ഇൻട്രോണുകൾ സ്ഥിരീകരിച്ചു, അല്ലെങ്കിൽ സിംഗിൾ-എക്സോൺ ജീനുകൾക്ക് % പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന CDS ദൈർഘ്യം; സ്ഥിരസ്ഥിതി 0.6 ആണ്
-b|--ബീറ്റ: ഇരട്ട
എക്സോൺ കവറേജ്; സ്ഥിരസ്ഥിതി 0.3 ആണ്
-g|--ഗാമ: ഇരട്ട
% പ്രതീക്ഷിക്കുന്നത് 5' UTR ദൈർഘ്യം; സ്ഥിരസ്ഥിതി 0.05 ആണ്
-e|--എപ്സിലോൺ: ഇരട്ട
% പ്രതീക്ഷിക്കുന്നത് 3' UTR ദൈർഘ്യം; സ്ഥിരസ്ഥിതി 0.05 ആണ്
സമഗ്രത സ്കോർ കണക്കാക്കുന്നതിനുള്ള പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന ഫീച്ചർ ദൈർഘ്യം:
-c|--exp-cds: INT
പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന സിഡിഎസ് ദൈർഘ്യം (ബിപിയിൽ); സ്ഥിരസ്ഥിതി 400 ആണ്
-5|--exp-5putr: INT
പ്രതീക്ഷിക്കുന്നത് 5' UTR നീളം; സ്ഥിരസ്ഥിതി 200 ആണ്
-3|--exp-3putr: INT
പ്രതീക്ഷിക്കുന്നത് 3' UTR നീളം; സ്ഥിരസ്ഥിതി 100 ആണ്
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് gaeval ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
