Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന Glam2scan കമാൻഡ് ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
glam2scan - ഒരു ഡാറ്റാബേസിൽ GLAM2 മോട്ടിഫ് കണ്ടെത്തുന്നു
സിനോപ്സിസ്
ഗ്ലാം2സ്കാൻ [ഓപ്ഷനുകൾ] അക്ഷരമാല my_motif.glam2 my_seqs.fa
അല്ലാതെ മറ്റൊരു അക്ഷരമാല p or n അക്ഷരമാല ഫയലിന്റെ പേരായി വ്യാഖ്യാനിക്കപ്പെടുന്നു.
വിവരണം
ഗ്ലാം2സ്കാൻ ഒരു സീക്വൻസ് ഡാറ്റാബേസിൽ, കണ്ടുപിടിച്ച ഒരു മോട്ടിഫിലേക്ക് പൊരുത്തങ്ങൾ കണ്ടെത്തുന്നു ഗ്ലാം2. ഓരോന്നും
മത്സരത്തിന് ഒരു സ്കോർ ലഭിക്കുന്നു, അത് മോട്ടിഫുമായി എത്രത്തോളം യോജിക്കുന്നുവെന്ന് സൂചിപ്പിക്കുന്നു.
ഓപ്ഷനുകൾ (ഡിഫോൾട്ട് ക്രമീകരണങ്ങൾ)
-h
എല്ലാ ഓപ്ഷനുകളും അവയുടെ സ്ഥിരസ്ഥിതി ക്രമീകരണങ്ങളും കാണിക്കുക.
-o
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ (stdout).
-n
റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യാനുള്ള വിന്യാസങ്ങളുടെ എണ്ണം (25).
-2
രണ്ട് സ്ട്രോണ്ടുകളും പരിശോധിക്കുക - ഫോർവേഡ്, റിവേഴ്സ് കോംപ്ലിമെന്റ്.
-D
കപടസംഖ്യ ഇല്ലാതാക്കൽ (0.1).
-E
ഇല്ലാതാക്കരുത് കപടസംഖ്യ (2.0).
-I
സ്യൂഡോകൗണ്ട് ഇൻസേർഷൻ (0.02).
-J
നോ-ഇൻസെർഷൻ സ്യൂഡോകൗണ്ട് (1.0).
-d
Dirichlet മിശ്രിതം ഫയൽ.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് Glam2scan ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
