gmod_fasta2gff3.plp - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

$O - ഫാസ്റ്റയെ ലളിതമായ GFF3 ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യുക

സിനോപ്സിസ്

% $O [ഓപ്ഷനുകൾ]

കമാൻഡ്-ലൈൻ ഓപ്ഷനുകൾ

--fasta_dir ഡയറക്ടറിയിൽ ഫാസ്റ്റ ഫയലുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു
(സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./fasta)
--gfffilename സൃഷ്ടിക്കേണ്ട GFF3 ഫയലിന്റെ പേര്
(സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./out.gff)
--ഓരോ ഫീച്ചറിനും അസൈൻ ചെയ്യാൻ SO ടൈപ്പ് ചെയ്യുക
(ഡിഫോൾട്ട്: EST)
--ഉറവിട കോളത്തിൽ ദൃശ്യമാകുന്ന സോഴ്സ് ടെക്സ്റ്റ്
(സ്ഥിരസ്ഥിതി:.)
--attributes കോളം 9-ൽ ദൃശ്യമാകുന്ന അധിക ടാഗ്=മൂല്യം ജോഡികൾ
--nosequence ##FASTA വിഭാഗം അടിച്ചമർത്തുക (അതായത്, ചെയ്യരുത്
DNA ക്രമങ്ങൾ അച്ചടിക്കുക)

വിവരണം

ഈ സ്ക്രിപ്റ്റ് ഫാസ്റ്റ ഫയലുകളുടെ ഒരു ശേഖരം എടുത്ത് അവയെ ലളിതമായ GFF3 ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു
ചാഡോയിലേക്ക് ലോഡ് ചെയ്യാൻ അനുയോജ്യം.

AUTHORS

സ്കോട്ട് കെയ്ൻ[ഇമെയിൽ പരിരക്ഷിച്ചിരിക്കുന്നു]>

പകർപ്പവകാശം (സി) 2006

ഈ ലൈബ്രറി ഒരു സ്വതന്ത്ര സോഫ്റ്റ്‌വെയർ ആണ്; നിങ്ങൾക്ക് ഇത് പുനർവിതരണം ചെയ്യാനും കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ പരിഷ്ക്കരിക്കാനും കഴിയും
പേൾ തന്നെ.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് gmod_fasta2gff3.plp ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക