ഉബുണ്ടു ഓൺലൈൻ, ഫെഡോറ ഓൺലൈൻ, വിൻഡോസ് ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന gt-inlineseq_add എന്ന കമാൻഡാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
gt-inlineseq_add - GFF3 ഇൻപുട്ടിലേക്ക് ബാഹ്യ ഉറവിടത്തിൽ നിന്ന് ഇൻലൈൻ സീക്വൻസുകൾ ചേർക്കുന്നു.
സിനോപ്സിസ്
gt inlineseq_add [ഓപ്ഷനുകൾ] [GFF3_file ...]
വിവരണം
-seqfile [ഫയലിന്റെ പേര്]
സീക്വൻസുകൾ എടുക്കേണ്ട സീക്വൻസ് ഫയൽ സജ്ജമാക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: നിർവചിക്കാത്തത്)
-encseq [ഫയലിന്റെ പേര്]
സീക്വൻസുകൾ എടുക്കേണ്ട എൻകോഡ് ചെയ്ത സീക്വൻസ് ഇൻഡക്സ് നെയിം സജ്ജമാക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി:
നിർവചിക്കാത്തത്)
-seqfiles
ഉപയോഗിക്കുന്ന ഫീച്ചറുകൾ എക്സ്ട്രാക്റ്റുചെയ്യുന്നതിനുള്ള സീക്വൻസ് ഫയലുകൾ സജ്ജമാക്കുക -- ലിസ്റ്റ് അവസാനിപ്പിക്കാൻ
സീക്വൻസ് ഫയലുകളുടെ
-മാച്ച്ഡെസ്ക് [അതെ|ഇല്ല]
ആവശ്യമുള്ള സീക്വൻസ് ഐഡികൾക്കായി ഇൻപുട്ട് ഫയലുകളിൽ നിന്ന് സീക്വൻസ് വിവരണങ്ങൾ തിരയുക (ഇൻ
GFF3), ആദ്യ പൊരുത്തം റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-matchdescstart [അതെ|ഇല്ല]
ആവശ്യമുള്ള സീക്വൻസിനായുള്ള ഇൻപുട്ട് ഫയലുകളിൽ നിന്നുള്ള സീക്വൻസ് വിവരണങ്ങളുമായി കൃത്യമായി പൊരുത്തപ്പെടുത്തുക
ഐഡികൾ (GFF3-ൽ) തുടക്കം മുതൽ ആദ്യത്തെ വൈറ്റ്സ്പെയ്സ് വരെ (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-usedesc [അതെ|ഇല്ല]
സീക്വൻസ് ഐഡികൾ (GFF3-ൽ) യഥാർത്ഥ ശ്രേണിയിലേക്ക് മാപ്പ് ചെയ്യാൻ സീക്വൻസ് വിവരണങ്ങൾ ഉപയോഗിക്കുക
എൻട്രികൾ. ഒരു വിവരണത്തിൽ ഒരു ശ്രേണി ശ്രേണി അടങ്ങിയിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ (ഉദാ, III:1000001..2000000),
ആദ്യ ഭാഗം സീക്വൻസ് ഐഡിയായി ഉപയോഗിക്കുന്നു (III) കൂടാതെ ഓഫ്സെറ്റായി ആദ്യ ശ്രേണി സ്ഥാനം
(1000001) (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
- മേഖലാ മാപ്പിംഗ് [സ്ട്രിംഗ്]
സീക്വൻസ്-റീജിയൻ അടങ്ങുന്ന ഫയൽ സീക്വൻസ് ഫയൽ മാപ്പിംഗിലേക്ക് സജ്ജമാക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: നിർവചിക്കാത്തത്)
-o [ഫയലിന്റെ പേര്]
നിർദ്ദിഷ്ട ഫയലിലേക്ക് ഔട്ട്പുട്ട് റീഡയറക്ട് ചെയ്യുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: നിർവചിക്കാത്തത്)
-ജിസിപ്പ് [അതെ|ഇല്ല]
gzip കംപ്രസ് ചെയ്ത ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ എഴുതുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-bzip2 [അതെ|ഇല്ല]
bzip2 കംപ്രസ് ചെയ്ത ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ എഴുതുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-ശക്തിയാണ് [അതെ|ഇല്ല]
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിലേക്ക് എഴുതാൻ നിർബന്ധിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-ഹെൽപ്പ്
സഹായം പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക
-പതിപ്പ്
പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക
റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു ബഗുകൾ
ബഗുകൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുക[ഇമെയിൽ പരിരക്ഷിച്ചിരിക്കുന്നു]>.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് gt-inlineseq_add ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക