Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന hmm-assembler.pl കമാൻഡ് ഇതാണ്.
പട്ടിക:
NAME
hmm-assembler.pl - SNAP മൊഡ്യൂൾ hmm-assembler.pl
സിനോപ്സിസ്
hmm-assembler.pl [-ഓപ്ഷനുകൾ [-കൂടുതൽ ഓപ്ഷനുകൾ]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
ഓപ്ഷനുകൾ
ദി പിന്തുടരുന്ന ഒറ്റ-കഥാപാത്രം ഓപ്ഷനുകൾ ആകുന്നു സ്വീകരിച്ചു:
വാദങ്ങൾക്കൊപ്പം: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
ബൂളിയൻ (വാദങ്ങളില്ലാതെ): -r -o -x -p -t -1
ഓപ്ഷനുകൾ ഒരുമിച്ച് ലയിപ്പിച്ചേക്കാം. -- ഓപ്ഷനുകളുടെ പ്രോസസ്സിംഗ് നിർത്തുന്നു. സ്ഥലം ആവശ്യമില്ല
ഓപ്ഷനുകൾക്കും അവയുടെ വാദങ്ങൾക്കും ഇടയിൽ.
ഓപ്ഷനുകൾ:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] 3'UTR മോഡൽ ഉൾപ്പെടുന്നു, ആവശ്യമാണ് -a
-a [] PolyA മോഡൽ ഉൾപ്പെടുന്നു, ആവശ്യമാണ് -3
-5 [] 5'UTR moel ഉൾപ്പെടുത്തുക, ആവശ്യമാണ് -p
-p ജനറിക് പ്രൊമോട്ടർ മോഡൽ ഉൾപ്പെടുത്തുക, ആവശ്യമാണ് -5
-r പൊതുവായ ആവർത്തന മോഡൽ ഉൾപ്പെടുന്നു
-o റിവേഴ്സ് ORF മോഡൽ ഉൾപ്പെടുത്തുക
-x വ്യക്തമായ ദൈർഘ്യമുള്ള ഇൻട്രോൺ മോഡൽ ഉപയോഗിക്കുക
-t C.elegans trans-splicing ഉൾപ്പെടുന്നു, ആവശ്യമാണ് -p, -5
-Z ക്ലേഡ്-നിർദ്ദിഷ്ട മൂല്യങ്ങൾ സജ്ജമാക്കുന്നു (പുഴു, ഈച്ച, ചെടി)
-1 ഒറ്റ ജീൻ മോഡൽ
-c
GC-AG സ്പ്ലൈസ് ഡോണർ മോഡൽ ഉൾപ്പെടുത്തുക
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് hmm-assembler.pl ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക