ഇംഗ്ലീഷ്ഫ്രഞ്ച്സ്പാനിഷ്

സെർവറുകൾ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക | Ubuntu > | Fedora > |


OnWorks ഫെവിക്കോൺ

idfetch - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

ഉബുണ്ടു ഓൺലൈൻ, ഫെഡോറ ഓൺലൈൻ, വിൻഡോസ് ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിവയിലൂടെ OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ idfetch പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക

Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന കമാൻഡ് idfetch ആണിത്.

പട്ടിക:

NAME


idfetch - NCBI ID1 സെർവറിൽ നിന്ന് ബയോളജിക്കൽ ഡാറ്റ വീണ്ടെടുക്കുക

സിനോപ്സിസ്


idfetch [-] [-F str] [-G ഫയലിന്റെ പേര്] [-Q ഫയലിന്റെ പേര്] [-c N] [-d str] [-e N] [-f str] [-g N]
[-i N] [-l ഫയലിന്റെ പേര്] [-n] [-o ഫയലിന്റെ പേര്] [-q str] [-s str] [-t N]

വിവരണം


idfetch എൻ‌സി‌ബി‌ഐയുടെ ഐ‌ഡി 1 സെർ‌വറിന്റെ ഒരു ക്ലയന്റാണ്, അതിൽ വ്യാഖ്യാനിച്ചതിന്റെ ഒരു വലിയ ഡാറ്റാബേസ് അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു
ജൈവ ക്രമങ്ങൾ.

ഓപ്ഷനുകൾ


ഓപ്ഷനുകളുടെ ഒരു സംഗ്രഹം ചുവടെ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്.

- ഉപയോഗ സന്ദേശം അച്ചടിക്കുക

-F str നിർദ്ദിഷ്ട ഫീച്ചർ തരങ്ങൾ ചേർക്കുക (കോമ-ഡിലിമിറ്റഡ്); അനുവദനീയമായ മൂല്യങ്ങൾ CDD, SNP,
SNP_graph, MGC, HPRD, STS, tRNA, microRNA.

-G ഫയലിന്റെ പേര്
ജിഐകളുടെ ലിസ്റ്റ്, (പതിപ്പ് ചെയ്‌ത) ആക്‌സഷനുകൾ, ഡംപ് ചെയ്യാനുള്ള ഫാസ്റ്റ സെക്ഐഡികൾ എന്നിവയുള്ള ഫയൽ

-Q ഫയലിന്റെ പേര്
എൻട്രസ് അന്വേഷണം വഴി ജിഐ ലിസ്റ്റ് സൃഷ്ടിക്കുക ഫയലിന്റെ പേര്; ആവശ്യപ്പെടുന്നു -dn or -dp.

-c N പരമാവധി സങ്കീർണ്ണത:
0 മുഴുവൻ ബ്ലോബ് നേടുക (ഡിഫോൾട്ട്)
1 താൽപ്പര്യമുള്ള bioseq നേടുക
2 താൽപ്പര്യമുള്ള ബയോസെക് അടങ്ങിയ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ ബയോസെക്-സെറ്റ് നേടുക
3 താൽപ്പര്യമുള്ള ബയോസെക് അടങ്ങിയ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ ന്യൂക്-പ്രോട്ട് നേടുക
4 താൽപ്പര്യമുള്ള ബയോസെക് അടങ്ങിയ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ പബ്-സെറ്റ് നേടുക

-d str ഉപയോഗിക്കാനുള്ള ഡാറ്റാബേസ് (കൂടെ -q, ഒന്നുകിൽ ആകാം n ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾക്ക് അല്ലെങ്കിൽ p പ്രോട്ടീനുകൾക്ക്).

-e N എന്റിറ്റി നമ്പർ (വീണ്ടെടുക്കൽ നമ്പർ) ഡംപ് ചെയ്യാൻ

-f str പരന്ന SeqId. സാധ്യമായ ഫോർമാറ്റുകൾ:
ടൈപ്പ് ചെയ്യുക([പേര്[,[പ്രവേശനം[,[റിലീസ്[,പതിപ്പ്]]]) '5(HUMHBB)' ആയി
ടൈപ്പ് ചെയ്യുക=പ്രവേശനം
ടൈപ്പ് ചെയ്യുക:അക്കം
(ടൈപ്പ് ചെയ്യുക ASN.1 Seq-id ഉപവിഭാഗത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്ന ഒരു സംഖ്യയാണ്.)

-g N ഡംപ് ചെയ്യാനുള്ള സിംഗിൾ എന്റിറ്റിക്കുള്ള ജിഐ ഐഡി

-i N തിരയലിന്റെ തരം:
0 സെക്-എൻട്രി നേടുക (ഡിഫോൾട്ട്)
1 GI നില നേടുക (stderr-ലേക്ക് ഔട്ട്പുട്ട്)
2 SeqIds നേടുക
3 ജിഐ ചരിത്രം നേടുക (ക്രമത്തിലുള്ള മാറ്റം മാത്രം)
4 പുനരവലോകന ചരിത്രം നേടുക (ASN.1 ലേക്ക് എന്തെങ്കിലും മാറ്റം)

-l ഫയലിന്റെ പേര്
ലോഗ് ഫയൽ

-n ജിഐകളുടെ ലിസ്റ്റ് മാത്രം ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യുക (കൂടെ -q ഒപ്പം -Q).

-o ഫയലിന്റെ പേര്
ഔട്ട്പുട്ടിനുള്ള ഫയലിന്റെ പേര് (ഡിഫോൾട്ട് = stdout)

-q str എൻട്രസ് ചോദ്യം വഴി ജി ലിസ്റ്റ് സൃഷ്ടിക്കുക. ആവശ്യമാണ് -dn or -dp.

-s str ഫാസ്റ്റ ശൈലിയിലുള്ള SeqId ഉദ്ധരണികളിൽ ഉൾപ്പെടുത്തിയിരിക്കുന്നു. ഫോർമാറ്റുകൾ:
lcl|int or str
bbs|int
bbm|int
gb|ആഗസ്റ്റ്|സ്ഥലം
emb|ആഗസ്റ്റ്|സ്ഥലം
പിർ|ആഗസ്റ്റ്|പേര്
sp|ആഗസ്റ്റ്|പേര്
പാട്|രാജ്യം|പേറ്റന്റ്|സെക്
ജി|int
dbj|ആഗസ്റ്റ്|സ്ഥലം
prf|ആഗസ്റ്റ്|പേര്
pdb|എൻട്രി|ചങ്ങല

-t N Put ട്ട്‌പുട്ട് തരം:
1 ടെക്സ്റ്റ് ASN.1 (ഡിഫോൾട്ട്)
2 ബൈനറി ASN.1
3 GenBank (സെക്-എൻട്രി മാത്രം)
4 GenPept (സെക്-എൻട്രി മാത്രം)
5 ഫാസ്റ്റ (ചരിത്രത്തിനായുള്ള പട്ടിക)
6 ഗുണമേന്മയുള്ള സ്കോറുകൾ (സെക്-എൻട്രി മാത്രം)
7 എൻട്രസ് ഡോക്‌സംസ്
8 ഫാസ്റ്റ റിവേഴ്സ് കോംപ്ലിമെന്റ്

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് idfetch ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക


Ad


Ad