Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ MAC OS เดเตบเดฒเตเตป เดเดฎเตเดฒเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดจเตเดจเดฟเดเตเดเดจเตเดฏเตเดณเตเดณ เดเดเตเดเดณเตเดเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดธเตเดเดจเตเดฏ เดเตบเดฒเตเตป เดตเตผเดเตเดเตโเดธเตเดฑเตเดฑเตเดทเดจเตเดเดณเดฟเดฒเตเดจเตเดจเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต OnWorks เดธเตเดเดจเตเดฏ เดนเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดฆเดพเดคเดพเดตเดฟเตฝ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดพเดตเตเดจเตเดจ เดเดฎเดพเตปเดกเต jackhmmer เดเดฃเดฟเดคเต.
เดชเดเตเดเดฟเด:
NAME
jackhmmer - เดเดฐเต เดชเตเดฐเตเดเตเดเตเตป เดกเดพเดฑเตเดฑเดพเดฌเตเดธเดฟเดจเตเดคเดฟเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดเตเดเต เดธเตเตผเดเตเดเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต(เดเตพ).
เดธเดฟเดจเตเดชเตเดธเดฟเดธเต
เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ [เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ]
เดตเดฟเดตเดฐเดฃเด
เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ เดเดฐเต เด เดจเตเดตเตเดทเดฃ เดเตเดฐเดฎเดตเตเด เดเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดเตเดเต เดคเดฟเดฐเดฏเตเดจเตเดจเต เดฒเดเตเดทเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเตเดคเดฟเดฐเดพเดฏเดฟ
เดเตเดฐเดฎเด(เดเตพ) เดเตป . เดเดฆเตเดฏเดคเตเดคเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเด a-เดจเต เดธเดฎเดพเดจเดฎเดพเดฃเต phmmer เดคเดฟเดฐเดฏเตเด. เดตเตเดฃเตเดเดฟ
เด เดเตเดคเตเดค เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเด, เดเดฒเตเดฒเดพ เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดฎเตเดคเตเดคเตเดณเตเดณ เดเตเดฆเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด
เดคเตเดชเตเดคเดฟเดเดฐเดฎเดพเดฏ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตฝ เดชเดฐเดฟเดงเดฟ เด เดธเดเดฌเดฟเตพ เดเตเดฏเตเดคเต, เด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดเดฐเต เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
(เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดธเดฎเดพเดจเดฎเดพเดฃเต hmmbuild เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ), เดเตเดเดพเดคเต เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดคเดฟเดฐเดฏเตฝ เดเตเดฏเตเดคเต
(เดเดฐเต เดชเตเดฒเต hmm เดคเดฟเดฐเดฏเตฝ เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเดฟเดจเตเดชเตเดชเด).
เดเตเดฆเตเดฏเด '-' (เดเดฐเต เดกเดพเดทเต เดชเตเดฐเดคเตเดเด) เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดพเด, เด เดธเดพเดนเดเดฐเตเดฏเดคเตเดคเดฟเตฝ เด เดจเตเดตเตเดทเดฃ เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ
เดเดฏเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเต เดเดฐเต เดซเดฏเดฒเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดชเดเดฐเด เดชเตเดชเตเดชเต. เดฆเดฟ a เดฏเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเดฟเดฒเตเดฒ
เดธเตเดเตเดฐเตเด, เดเดพเดฐเดฃเด เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ เดกเดพเดฑเตเดฑเดพเดฌเตเดธเดฟเตฝ เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดชเดพเดธเตเดเตพ เดจเดเดคเตเดคเตเดฃเตเดเดคเตเดฃเตเดเต.
เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดฎเดจเตเดทเตเดฏเตผเดเตเดเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเตเดจเตเดจ เดคเดฐเดคเตเดคเดฟเดฒเดพเดฃเต เดฐเตเดชเดเตฝเดชเตเดชเดจ เดเตเดฏเตโเดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต, เดชเดเตเดทเต เดชเดฒเดชเตเดชเตเดดเตเด เด เดคเต เดตเดณเดฐเต เดตเดฒเตเดคเดพเดฃเต
เดเดคเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เด เดชเตเดฐเดพเดฏเตเดเดฟเดเดฎเดพเดฃเต, เด เดคเต เดชเดพเดดเตโเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเดคเต เดเดฐเต เดตเตเดฆเดจเดฏเดพเดฃเต. เดฆเดฟ --tblout เดเดชเตเดชเด --เดกเตเดเดฌเตเดฒเตเดเตเดเต เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ
เดธเดเดเตเดทเดฟเดชเตเดคเดตเตเด เดเดณเตเดชเตเดชเดคเตเดคเดฟเตฝ เดชเดพเดดเตโเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเดตเตเดจเตเดจเดคเตเดฎเดพเดฏ เดฒเดณเดฟเดคเดฎเดพเดฏ เดชเดเตเดเดฟเด เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเตเดเดณเดฟเตฝ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด. เดฆเดฟ -o เดเดชเตเดทเตป
เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต /dev/null-เตฝ เดตเดฒเดฟเดเตเดเตเดฑเดฟเดฏเตเดจเตเดจเดคเตเตพเดชเตเดชเตเดเต เดฑเตเดกเดฏเดฑเดเตโเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเตป เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ
-h เดธเดนเดพเดฏเด; เดเดฎเดพเตปเดกเต เดฒเตเตป เดเดชเดฏเตเดเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเตเดฏเตเด เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดฏ เดเดฒเตเดฒเดพ เดเดชเตเดทเดจเตเดเดณเตเดเตเดฏเตเด เดเดฐเต เดนเตเดฐเดธเตเดต เดเตผเดฎเตเดฎเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตฝ เดชเตเดฐเดฟเดจเตเดฑเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด.
-N เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดเดณเตเดเต เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เดเดฃเตเดฃเด เดเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด . เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 5 เดเดฃเต. N=1 เดเดฃเตเดเตเดเดฟเตฝ, เดซเดฒเด
a เดเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดคเตเดฒเตเดฏเดฎเดพเดฃเต phmmer เดคเดฟเดฐเดฏเตฝ.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดเดเตเดเตเดชเต
เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ, เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฎเตเดณเตเดณ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต stdout-เตฝ เดฎเดจเตเดทเตเดฏเตผเดเตเดเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเตเดจเตเดจ เดคเดฐเดคเตเดคเดฟเตฝ เดฆเตเดถเตเดฏเดฎเดพเดเตเด.
เดเตเดฑเดเตเดเต เดชเดพเดดเตโเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเดตเตเดจเตเดจ เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต. เด เดเดชเตโเดทเดจเตเดเตพ เด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดฑเตเดกเดฏเดฑเดเตโเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเดจเต เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเดพเดจเต เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฎเตเดณเตเดณ เดเตเดเตเดเตโเดชเตเดฏเดฟเดจเตเดฑเต เดซเดฏเดฒเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเต, เดซเดฏเดฒเตเดเดณเดฟเดฒเตเดเตเดเตเดณเตเดณ เด เดงเดฟเด เดคเดฐเด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต.
-o เดฎเดจเตเดทเตเดฏเตผเดเตเดเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเตเดจเตเดจ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดเดฐเต เดซเดฏเดฒเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดจเดฏเดฟเดเตเดเตเด .
-A เด เดจเตเดคเดฟเดฎ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเต เดถเตเดทเด, เดเดฒเตเดฒเดพ เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเตเดฏเตเด เดตเตเดฏเดพเดเตเดฏเดพเดจเดฟเดเตเด เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด
เดคเตเดชเตโเดคเดฟเดเดฐเดฎเดพเดฏ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตฝ เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดเตพ (เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเดตเตเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเต). in
เดธเตเดฑเตเดฑเตเดเตเดเตเดนเตเด เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต.
--tblout
เด เดตเดธเดพเดจ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเต เดถเตเดทเด, เดเตเดชเตเดชเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดฐเต เดเดพเดฌเตเดฒเตผ เดธเดเดเตเดฐเดนเด เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด เด
เดเดณเตเดชเตเดชเดคเตเดคเดฟเตฝ เดชเดพเดดเตโเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเดตเตเดจเตเดจ, เดเตเดณเด, เดตเตเดฑเตเดฑเตโเดธเตโเดชเตเดฏเตโเดธเต-เดกเตเดฒเดฟเดฎเดฟเดฑเตเดฑเดกเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต.
--เดกเตเดเดฌเตเดฒเตเดเตเดเต
เด เดตเดธเดพเดจ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเต เดถเตเดทเด, เดเตเดชเตเดชเต เดกเตเดฎเตเดฏเตเตป เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดฐเต เดเดพเดฌเตเดฒเตผ เดธเดเดเตเดฐเดนเด เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด เด
เดเดณเตเดชเตเดชเดคเตเดคเดฟเตฝ เดชเดพเดดเตโเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเดตเตเดจเตเดจ, เดเตเดณเด, เดตเตเดฑเตเดฑเตโเดธเตโเดชเตเดฏเตโเดธเต-เดกเตเดฒเดฟเดฎเดฟเดฑเตเดฑเดกเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต.
--chkhmm
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเตเดฏเตเด เดเดฐเดเดญเดคเตเดคเดฟเตฝ, HMM เดเดจเตเดจ เดเตเดฆเตเดฏเด เดเตเดเตเดเตโเดชเตเดฏเดฟเดจเตเดฑเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด, เด เดคเต เดชเตเดฐเตเดณเตเดณ เดเดฐเต เดซเดฏเดฒเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเด
- .เดนเตเด เดเดตเดฟเดเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดธเดเดเตเดฏเดฏเดพเดฃเต (1..N เดฎเตเดคเตฝ).
--เดเตเดเดฒเดฟ
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเตเดฏเตเด เด เดตเดธเดพเดจเด, เดคเตเดชเตเดคเดฟเดเดฐเดฎเดพเดฏ เดเดฒเตเดฒเดพ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเดณเตเดเตเดฏเตเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด เดชเดฐเดฟเดถเตเดงเดฟเดเตเดเตเด
เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตฝ เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดเตพ (เดเดฆเดพ: เด เดเตเดคเตเดค เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเตเดณเตเดณ เดเตเดฆเตเดฏเด HMM เดเดฏเดฟ เดฎเดพเดฑเตเด),
เดเดจเตเดจ เดชเตเดฐเดฟเดฒเตเดณเตเดณ เดซเดฏเดฒเดฟเดฒเตเดเตเดเต เด เดคเต เดธเดเดฐเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต <เดเตเดเตเดเต เดชเตเดฏเดฟเดจเตเดฑเต เดซเดฏเดฒเต เดเดชเดธเตผเดเตเดเด>- .เดธเตเดฑเตเดฑเต เดธเตเดฑเตเดฑเตเดเตเดเตเดนเตเด เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเดฟเตฝ,
เดเดตเดฟเดเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดธเดเดเตเดฏเดฏเดพเดฃเต (1..N เดฎเตเดคเตฝ).
--ac เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเตเดเตพเดเตเดเต เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดฏ เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ เดชเตเดฐเตเดเตพเดเตเดเต เดชเดเดฐเด เดชเตเดฐเดตเตเดถเดจเดเตเดเตพ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
เดเตเดเดพเดคเต/เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ.
--เดจเตเด เดฒเดฟ
เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดตเดฟเดญเดพเดเด เดเดดเดฟเดตเดพเดเตเดเตเด. เดเดคเต เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเดฃเตเดฏเดฎเดพเดฏเดฟ เดเตเดฑเดฏเตเดเตเดเตเด
เดตเตเดณเดฟเดฏเด.
--notextw
เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ เดเดฐเต เดตเดฐเดฟเดฏเตเดเตเดฏเตเด เดฆเตเตผเดเตเดฏเด เด เตบเดฒเดฟเดฎเดฟเดฑเตเดฑเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดชเดฐเดฟเดงเดฟ 120 เดเดฃเต
เดเดฐเต เดตเดฐเดฟเดฏเดฟเดฒเตเด เดชเตเดฐเดคเตเดเดเตเดเตพ, เดเดคเต เดเตเตผเดฎเดฟเดจเดฒเตเดเดณเดฟเดฒเตเด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดตเตเดคเตเดคเดฟเดฏเดพเดฏเดฟ เดชเตเดฐเดฆเตผเดถเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเดพเตป เดธเดนเดพเดฏเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเดกเดฟเดฑเตเดฑเตผเดฎเดพเดฐเดฟเตฝ, เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดตเดฟเดตเดฐเดฃ เดตเดฐเดฟเดเตพ เดตเตเดเตเดเดฟเดเตเดเตเดฐเตเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเตเด.
--textw
เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเดจเตเดฑเต เดฒเตเตป เดฆเตเตผเดเตเดฏ เดชเดฐเดฟเดงเดฟ เดเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด เดเดฐเต เดตเดฐเดฟเดฏเดฟเดฒเตเด เดชเตเดฐเดคเตเดเดเตเดเตพ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟเดฏเดพเดฃเต
120.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดธเดฟเดเดเดฟเตพ เด เดจเตเดเตเดฐเดฎเด เดธเตเดเตเดฑเดฟเดเดเต (เดเดฆเตเดฏเด เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเด)
เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ, เดเดฆเตเดฏ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเด เดเดฐเตเดฑเตเดฑ เดเตเดฆเตเดฏเดคเตเดคเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเด เดเดฐเต เดคเดฟเดฐเดฏเตฝ เดฎเตเดกเตฝ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเตเดฐเดฎเด. เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดเดฐเต เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃ 20x20 เดธเดฌเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเตเดฏเตเดทเตป เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดพเดฃเต เด เดฎเตเดกเตฝ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต
เดธเดพเดงเตเดฏเดคเดเตพ, เดเตเดเดพเดคเต เดชเตเดธเดฟเดทเตป-เดเตปเดกเดฟเดชเตเตปเดกเดจเตเดฑเต เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดชเตเดชเดฃเดฟเดจเตเด เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเดฟเดจเตเดฎเตเดณเตเดณ เดฐเดฃเตเดเต เด เดงเดฟเด เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ
เดธเดพเดงเตเดฏเดคเดเตพ เดจเตเดเตเดเตเด. เด เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดธเดฟเดเดเดฟเตพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดธเตเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดฎเดพเดฑเตเดฑเดฃเด.
--เดชเตเดชเตเดชเตป
เดธเดฟเดเดเดฟเตพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเตเดตเดฑเดฟ เดฎเตเดกเดฒเดฟเดจเต เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดชเตเดชเตบ เดชเตเดฐเตเดฌเดฌเดฟเดฒเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด . เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ
เดเดฃเต. >= 0 เดเด < 0.5 เดเด เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด.
--เดชเตเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเตเตปเดกเต
เดธเดฟเดเดเดฟเตพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเตเดตเดฑเดฟ เดฎเตเดกเดฒเดฟเดจเต เดเตเดฏเดพเดชเตเดชเต เดเดเตเดธเตเดฑเตเดฑเตปเดฑเต เดชเตเดฐเตเดฌเดฌเดฟเดฒเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด . เดฆเดฟ
เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.4 เดเดฃเต. >= 0 เดเด < 1.0 เดเด เดเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด.
--mx
เดชเตเดฐเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดฌเดฟเตฝเดฑเตเดฑเต-เดเตป เดธเดฌเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเตเดฏเตเดทเตป เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดธเดพเดงเตเดฏเดคเดเตพ เดจเตเดเตเด
. เดจเดฟเดฐเดตเดงเดฟ เดธเตเดฑเตเดฑเดพเตปเดกเตเตผเดกเต เดฎเตเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเตเดเตพ เด เดจเตเดคเตผเดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดคเดฎเดพเดฃเต, เด เดตเดฏเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดตเดพเดฏเดฟเดเตเดเตเดฃเตเดเดคเดฟเดฒเตเดฒ
เดซเดฏเดฒเตเดเตพ. เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต เดจเดพเดฎเด PAM30, PAM70, PAM120, PAM240, BLOSUM45 เดเดเดพเด,
BLOSUM50, BLOSUM62, BLOSUM80, เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ BLOSUM90. เด เดคเดฟเดฒเตเดจเตเดจเต เดฎเดพเดคเตเดฐเด --mx เดเดชเตเดชเด --mxfile
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดพเด.
--mxfile
เดซเดฏเดฒเดฟเดฒเต เดธเดฌเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเตเดฏเตเดทเตป เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดธเดพเดงเตเดฏเดคเดเตพ เดจเตเดเตเด
. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ เดธเตเดเตเตผ เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต BLOSUM62 เดเดฃเต (เด เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต HMMER-เดจเต เดเดจเตเดคเดฐเดฟเดเดฎเดพเดฃเต
เดเตเดเดพเดคเต เดเดฐเต เดซเดฏเดฒเดพเดฏเดฟ เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดเดฃเดฎเตเดจเตเดจเดฟเดฒเตเดฒ). เดเดฐเต เดธเดฌเตเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเตเดฏเตเดทเตป เดฎเดพเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเดฟเดจเตเดฑเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต
BLAST, FASTA เดเดจเตเดจเดฟเดตเดฏเตเด เดฎเดฑเตเดฑเต เดเตเดฐเดฎเดตเตเด เด เดเดเตเดเดฐเดฟเดเตเด เดธเตเดฑเตเดฑเดพเตปเดกเตเตผเดกเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเดพเดฃเต
เดตเดฟเดถเดเดฒเดจ เดธเตเดซเตเดฑเตเดฑเตเดตเตเดฏเตผ.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเตเดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดธเต
เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดซเดฏเดฒเตเดเดณเดฟเตฝ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเตพ (เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต,
--tblout, เดเดชเตเดชเด --เดกเตเดเดฌเตเดฒเตเดเตเดเต). เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเตเด, เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเด เดกเตเดฎเตเดฏเตเตป เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเด เดฑเดพเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต
เดธเตเดฅเดฟเดคเดฟเดตเดฟเดตเดฐเดเตเดเดฃเดเตเดเต เดชเตเดฐเดพเดงเดพเดจเตเดฏเด (เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเด), เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต เดเดจเตเดจเดฟเดต เดชเตเดฐเดเดพเดฐเด เดเดฐเต เดตเดฟเดญเดพเดเดตเตเด เดเดจเตเดจเต เดตเดฟเดณเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดฐเดฃเตเดเต เดตเดฟเดญเดพเดเดเตเดเดณเดพเดฏเดฟ เดเดจเดฑเตเดฑเตเดฑเตเดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต.
เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเตเด เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตเตป เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเตเด. เดเดฐเต เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ, เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ, เดเดฒเตเดฒเดพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเด เดเดฐเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดนเดฟเดฑเตเดฑเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเด <= 10 เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดคเดฟเดเตเดเตเดฃเตเดเต. เดเดฐเต-เดกเตเดฎเตเดฏเตโเตป เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ, เดเดฐเต เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเดฟเดจเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดฏ เดเดฐเต-
เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ, เดเดฒเตเดฒเดพ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเดณเตเด เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเด เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ เดคเตเดชเตเดคเดฟเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเดจเตเดจเต
เด เดฑเดฟเดฏเดฟเดเตเดเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟเดฏเดพเดฏเดฟ, เดเดต <= 10-เดจเตเดฑเต เดธเตเดชเดพเดงเดฟเด เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเดณเตเดณเตเดณ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเดณเดพเดฃเต. เดเดจเดฟเดชเตเดชเดฑเดฏเตเดจเตเดจเดต
เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เด-เดตเดพเดฒเตเดฏเต เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ เดฎเดพเดฑเตเดฑเดพเดจเต เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดพเดจเต เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดเตเดเดณเต เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดชเดเดฐเด เดเดฎเตเดฎเดฐเดชเตเดชเดเดฟเดเตพ.
-E เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเด <= เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด เดเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 10.0 เดเดฃเต.
-T เด-เดตเดพเดฒเตเดฏเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเดฟเดจเต เดชเดเดฐเด เดเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเดจเต เดเดฐเต เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
(เดเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด -E เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต). >= เดเดจเตเดจ เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด . เดตเดดเดฟ
เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เด เดเดชเตโเดทเตป เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฒเตเดฒ.
-Z เดกเดพเดฑเตเดฑเดพเดฌเตเดธเดฟเดจเตเดฑเต เดเดเต เดตเดฒเตเดชเตเดชเด เดชเตเดฐเดเตเดฏเดพเดชเดฟเดเตเดเตเด เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดเดตเดถเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ
เดเดฃเดเตเดเตเดเตเดเตเดเดฒเต. เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃเดฏเดพเดฏเดฟ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ เดกเดพเดฑเตเดฑเดพเดฌเตเดธเดฟเดจเตเดฑเต เดตเดฒเตเดชเตเดชเดตเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดฌเดจเตเดงเดชเตเดชเตเดเตเดเดพเดฃเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต
เดจเดฟเดเตเดเตพ เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅเดคเตเดคเดฟเตฝ เดคเดฟเดฐเดเตเดเดคเต (เดเดฆเดพ. เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด target_seqdb). เดเดฟเดฒเดคเดฟเตฝ
เดเตเดธเตเดเตพ (เดเดฆเดพเดนเดฐเดฃเดคเตเดคเดฟเดจเต, เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดกเดพเดฑเตเดฑเดพเดฌเตเดธเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดเดฏเดฟ เดตเดฟเดญเดเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเตเดฃเตเดเตเดเตเดเดฟเตฝ
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดคเดฟเดฐเดฏเดฒเดฟเดจเตเดฑเต เดธเดฎเดพเดจเตเดคเดฐเดตเตฝเดเตเดเดฐเดฃเดคเตเดคเดฟเดจเตเดณเตเดณ เดซเดฏเดฒเตเดเตพ), เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เดตเดฒเตเดชเตเดชเด เดเดจเตเดคเดพเดฃเตเดจเตเดจเต เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเต เดจเดจเตเดจเดพเดฏเดฟ เด เดฑเดฟเดฏเดพเดฎเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเด
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดคเดฟเดฐเดฏเตฝ เดธเตเดฅเดฒเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเต.
--domE
เดธเตเดชเดพเดงเดฟเดเดฎเดพเดฏ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเดณเตเดณเตเดณ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเตพ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด <= เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ, เดเตเดเดพเดคเต
เดเดฐเต เดชเตเดฐเดงเดพเดจเดชเตเดชเตเดเตเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดนเดฟเดฑเตเดฑเดฟเดฒเตเด เดเตเดชเตเดชเต เดธเตโเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเดฟเดฒเตเดเตเดเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 10.0 เดเดฃเต.
--domT
เดเดฐเต เด-เดตเดพเดฒเตเดฏเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเดฟเดจเต เดชเดเดฐเด เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดเดฐเต เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตโเดเตเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
(เดเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด --domT เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต). >= เดเดจเตเดจ เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดเดณเตเดณ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเตพ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด in
เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเด เดเดเตเดเตโเดชเตเดเตเดเต, เดเดฐเต เดชเตเดฐเดงเดพเดจ เดเตเดฐเดฎเดคเตเดคเดฟเดฒเตเด เดเตเดชเตเดชเต เดธเตโเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเดฟเดจเต เดชเตเดฑเดฎเต
เด เดเดฟเดเตเดเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เด เดเดชเตโเดทเตป เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฒเตเดฒ.
--domZ
เดชเตเดฐเดงเดพเดจเดชเตเดชเตเดเตเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดชเตเดฐเดเตเดฏเดพเดชเดฟเดเตเดเตเด เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ, เดเดตเดถเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ
เด เดงเดฟเด เดกเตเดฎเตเดฏเตเตป เดชเตเดฐเดพเดงเดพเดจเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดธเตเดชเดพเดงเดฟเดเดฎเดพเดฏ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏ เดเดฃเดเตเดเตเดเตเดเตเดเตฝ. เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃ
เดธเตเดชเดพเดงเดฟเดเดฎเดพเดฏ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเดตเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดฌเดจเตเดงเดชเตเดชเตเดเตเดเต เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดชเดฐเดฟเดงเดฟ.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตฝ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดธเต
เดฎเตพเดเตเดเดฟเดชเตเดชเดฟเตพ เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเดฟเดฒเตเด เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเดฟเดฒเตเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฟเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฃเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตฝ เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดเตพ
เด เดเตเดคเตเดค เดคเดฟเดฐเดฏเตฝ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดคเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ, เดเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเดฟเดจเต เดเดฐเต เดชเตเตผ- เดเดฃเตเดเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด.
เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเด <= 0.001 (เดเดพเดฃเตเด -E เดเดชเตเดทเตป) เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฃเด, เดเตเดเดพเดคเต เดเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เด เดงเดฟเด เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเตพ
เดเตเดชเตเดชเต เดธเตเดเตเดฑเดฟเดเดเดฟเดจเต เดชเตเดฑเดฎเต เดเดฐเต เดธเตเดชเดพเดงเดฟเดเดฎเดพเดฏ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเด <= 0.001 เดเดฃเตเดเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด (เดเดพเดฃเตเด --domE
เดเดชเตเดทเตป). เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเดณเตเด เดเตปเดเตเดฒเตเดทเตป เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเดณเตเด เดคเดฎเตเดฎเดฟเดฒเตเดณเตเดณ เดตเตเดฏเดคเตเดฏเดพเดธเด เด เดคเดพเดฃเต
เดเตปเดเตเดฒเตเดทเตป เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฃเด เด เดเตเดคเตเดค เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเตฝ (เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ
เด เดจเตเดคเดฟเดฎ เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดฎเตพเดเตเดเดฟเดชเตเดชเดฟเตพ เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดเดเตเดเดฟเตฝ -A เดเดชเตเดทเตป เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต), เด เดคเตเดธเดฎเดฏเด เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเตเดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเดฟเตฝ เดจเดฟเดเตเดเตพ เดเดพเดฃเตเดจเตเดจเดคเต เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเด. เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดเตพ เดชเตเดคเตเดตเต เดเตเดเตเดคเตฝ เด เดฏเดเตเดเดคเดฟเดจเดพเตฝ เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเต เดเดดเดฟเดฏเตเด
เดถเดฌเตโเดฆเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดฎเตเดเตพเดญเดพเดเดคเตเดคเต เดคเดพเตฝเดชเตเดชเดฐเตเดฏเดฎเตเดฃเตผเดคเตเดคเตเดจเตเดจ เดฌเตเตผเดกเตผเดฒเตเตป เดนเดฟเดฑเตเดฑเตเดเตพ เดเดพเดฃเตเด.
--incE
เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเด <= เดเดณเตเดณ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด เดคเตเดเตผเดจเตเดจเตเดณเตเดณ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเต เด เดจเตเดคเดฟเดฎ เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเดฒเต
เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดคเดคเต -A. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.001 เดเดฃเต.
--incT
เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเต เดชเดเดฐเด เดเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฒเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดเดฐเต เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
เดชเดฐเดฟเดงเดฟ (เดเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด --incE เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต). เดเดฐเต เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดเดณเตเดณ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด
>= . เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ เด เดเดชเตโเดทเตป เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฒเตเดฒ.
--incdomE
เดธเตเดชเดพเดงเดฟเดเดฎเดพเดฏ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ <= เดเดณเตเดณ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด เดคเตเดเตผเดจเตเดจเตเดณเตเดณ เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเต เด เดตเดธเดพเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเต
เด เดฒเตเตปเดฎเตเดจเตเดฑเต เดเดเตเดเตเดชเตเดเตเดเต เดตเดดเดฟ -A, เดเดฐเต เดเดพเดฐเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดฒเตเด เดเตเดชเตเดชเต เดธเตโเดเตเดฑเดฟเดเดเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเดฟเดจเต เดชเตเดฑเดฎเต
เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดนเดฟเดฑเตเดฑเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.001 เดเดฃเต.
--incdomT
เดเดฐเต เด-เดตเดพเดฒเตเดฏเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเดฟเดจเต เดชเดเดฐเด เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดเดฐเต เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตโเดเตเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
(เดเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด --incT เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต). >= เดเดจเตเดจ เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเตผ เดเดณเตเดณ เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเดเตพ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเด . เดตเดดเดฟ
เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เด เดเดชเตโเดทเตป เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเดฟเดฒเตเดฒ.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต ACCELERATION เดนเตเดฏเตเดฑเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดเตเดธเต
HMMER3 เดคเดฟเดฐเดฏเดฒเตเดเตพ เดฎเตเดจเตเดจเต-เดเดเตเด เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดชเตเดชเตเดชเตเดฒเตเดจเดฟเตฝ เดคเตเดตเดฐเดฟเดคเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเดจเตเดจเต: MSV เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ,
เดตเดฟเดฑเตเดฑเตเตผเดฌเดฟ เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเตเด เดซเตเตผเดตเตเดกเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเตเด. เดเดฆเตเดฏเดคเตเดคเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดตเตเดเดคเดฏเตเดฑเดฟเดฏเดคเตเด เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดตเตเดเดคเดฏเตเดณเตเดณเดคเตเดฎเดพเดฃเต
เดเดเดฆเตเดถเด; เด เดตเดธเดพเดจเดคเตเดคเตเดคเต เดชเตเตผเดฃเตเดฃ เดซเตเตผเดตเตเดกเต เดธเตเดเตเดฑเดฟเดเดเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดฃเต, เดตเตเดเดค เดเตเดฑเดเตเดเดคเตเด เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดเตเดคเตเดฏเดตเตเดฎเดพเดฃเต.
MSV, Viterbi เดเดจเตเดจเดฟเดตเดฏเตเดเตเดเดฟเดเดฏเดฟเตฝ เดเดฐเต เดฌเดฏเดธเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดเตเดเดตเตเดฎเตเดฃเตเดเต. เดเดฒเตเดฒเดพ เดเดเตเดเดเตเดเดณเตเด เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดฒเดเตเดทเตเดฏเดเตเดเตพ
เดเดเตเดธเดฟเดฒเดฑเตเดทเตป เดชเตเดชเตเดชเตเดฒเตเดจเดฟเตฝ เดชเดฟเดจเตเดจเตเดเต เดชเตเดธเตเดฑเตเดฑเต เดชเตเดฐเตเดธเดธเตเดธเดฟเดเดเดฟเดจเต เดตเดฟเดงเตเดฏเดฎเดพเดเตเดจเตเดจเต -- เดกเตเดฎเตเดฏเตเตป เดเดกเดจเตเดฑเดฟเดซเดฟเดเตเดเตเดทเตป
เดเดชเตเดชเด เดซเตเตผเดตเตเดกเต/เดฌเดพเดเตเดเตโเดตเตเตผเดกเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดธเตโเดเตเตผ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต.
เด เดเดฟเดธเตเดฅเดพเดจเดชเดฐเดฎเดพเดฏเดฟ HMMER-เดจเตเดฑเต เดนเตเดฏเตเดฑเดฟเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดเดฐเตเดฏเตเดฐเต เดธเตเดตเดคเดจเตเดคเตเดฐ เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ เดชเดฟ-
เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดจเตเตบเดนเตเดฎเตเดฒเตเดเดธเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดชเตเดฐเดคเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เด เดเดถเดคเตเดคเต เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดฎเตเดฒเตเดฏ เดชเดฐเดฟเดงเดฟ
เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเตเดเตพ. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ เดเตเดเตเดคเดฒเดพเดฏเดฟ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เดเดฏเตผเดจเตเดจ เด เดจเตเดชเดพเดคเด เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเด
nonhomologous เด เดจเตเดเตเดฐเดฎเด, เดตเตเดเดคเดฏเตเดเต เดเตเดฒเดตเดฟเตฝ เดธเดเดตเตเดฆเดจเดเตเดทเดฎเดค เดตเตผเดฆเตเดงเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต; เดคเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเด,
เดเตเดฑเดเตเด เดชเดฟ-เดฎเตเดฒเตเดฏ เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดเตพ เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เดเดฐเต เดเตเดฑเดฟเดฏ เด เดจเตเดชเดพเดคเด เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเดเดฏเตเด เดธเดเดตเตเดฆเดจเดเตเดทเดฎเดค เดเตเดฑเดฏเตเดเดฏเตเด เดเตเดฏเตเดฏเตเด
เดตเตเดเดค เดตเตผเดฆเตเดงเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดเดฏเตเด เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต. เดเดฐเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเดฟเดจเตเดฑเต เดชเดฟ-เดตเดพเดฒเตเดฏเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต 1.0 เดเดฏเดฟ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เด เดคเต เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเด เดเดจเตเดจเดพเดฃเต
เดเดฒเตเดฒเดพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเด, เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏเดฟ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดจเดฐเดนเดฟเดคเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต.
เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ เดฎเดพเดฑเตเดฑเตเดจเตเดจเดคเต เดชเดฐเดฟเดเดฃเดจเดฏเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเตเดเตพ เดจเตเดเตเดเดเดเตเดฏเตเดฏเตเดเดฏเต เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเตเดเดฏเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต; เดฎเดพเดฑเตเดฑเตเดจเตเดจเดคเดฟเตฝ
เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเตเดเตพ เดฌเดฟเดฑเตเดฑเต เดธเตเดเตเดฑเตเดเตพ, เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดเตเดเตพ เดเดจเตเดจเดฟเดตเดฏเต เดฎเดพเดฑเตเดฑเดฟเดฒเตเดฒ, เดเดตเดฏเตเดฒเตเดฒเดพเด
เดชเตเดธเตเดฑเตเดฑเต เดชเตเดฐเตเดธเดธเตเดธเดฟเดเดเดฟเตฝ เดฎเดพเดคเตเดฐเด เดจเดฟเตผเดฃเตเดฃเดฏเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต.
--เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟ เดธเดเดตเตเดฆเดจเดเตเดทเดฎเดค. เดฌเดฏเดธเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเตพเดชเตเดชเตเดเต เดเดฒเตเดฒเดพ เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเตเดเดณเตเด เดเดซเดพเดเตเดเดฟ เดซเตเตพ เดฑเตบ เดเตเดฏเตเดฏเตเด
เดเดฐเต เดฒเดเตเดทเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดฒเตเด เดซเตเตผเดตเตเดกเต/เดฌเดพเดเตเดเตโเดตเตเดกเต เดชเตเดธเตเดฑเตเดฑเตโเดชเตเดฐเตเดธเดธเตเดธเดฟเดเดเต. เดเดคเต เดธเดเดตเตเดฆเดจเดเตเดทเดฎเดค เดตเตผเดฆเตเดงเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเตเดฑเตเดคเดพเดฏเดฟ, เดตเตเดเดคเดฏเดฟเตฝ เดตเดฒเดฟเดฏ เดเดฟเดฒเดตเดฟเตฝ.
--F1
เดเดฆเตเดฏ เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต; MSV เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดเตเดเดคเตเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดชเดฟ-เดฎเตเดฒเตเดฏเด เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด. เดฆเดฟ
เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต 0.02 เดเดฃเต, เด เดคเดพเดฏเดคเต เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดเดฏเตผเดจเตเดจ เดธเตโเดเตเดฑเดฟเดเดเดฟเดจเตเดฑเต เดเดเดฆเตเดถเด 2% เดนเตเดฎเตเดณเตเดเดธเต เด เดฒเตเดฒ
เดฒเดเตเดทเตเดฏเดเตเดเตพ เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเตเดฎเตเดจเตเดจเต เดชเตเดฐเดคเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต.
--F2
เดฐเดฃเตเดเดพเดฎเดคเตเดคเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต; Viterbi เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดธเตเดฑเตเดฑเตเดชเตเดชเดฟเดจเดพเดฏเดฟ P-value เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด.
เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.001 เดเดฃเต.
--F3
เดฎเตเดจเตเดจเดพเดฎเดคเตเดคเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต; เดซเตเตผเดตเตเดกเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดธเตเดฑเตเดฑเตเดชเตเดชเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดชเดฟ-เดตเดพเดฒเตเดฏเต เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด. เดฆเดฟ
เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 1e-5 เดเดฃเต.
--เดจเตเดฌเดฟเดฏเดพเดธเต
เดฌเดฏเดธเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดซเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด. เดเดคเต เดเดฐเต เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดตเดฐเต เดธเดเดตเตเดฆเดจเดเตเดทเดฎเดค เดตเตผเดฆเตเดงเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต, เดชเดเตเดทเต a-เตฝ เดตเดฐเดพเด
เดตเตเดเดคเดฏเดฟเตฝ เดเดฏเตผเดจเตเดจ เดเดฟเดฒเดตเต, เดชเตเดฐเดคเตเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด เดเตเดฆเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเต เดชเดเตเดทเดชเดพเดคเดชเดฐเดฎเดพเดฏ เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดเดเดจเดฏเตเดฃเตเดเตเดเตเดเดฟเตฝ (เดเดฆเดพ
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจ เดถเตเดฐเตเดฃเดฟ เดชเตเดฐเดฆเตเดถเด, เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เด เดคเต เดตเดฒเดฟเดฏ เดชเตเดฐเดฆเตเดถเดเตเดเดณเตเดณเตเดณ เดเดฐเต เดฎเตเดเดฌเตเดฐเตป เดชเตเดฐเตเดเตเดเตเตป เดเดฃเตเดเตเดเดฟเตฝ
เดนเตเดกเตเดฐเตเดซเตเดฌเดฟเดธเดฟเดฑเตเดฑเดฟ). เดฌเดฏเดธเต เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ, เดจเดฟเดฐเดตเดงเดฟ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดเดเดจเตเดจเตเดชเตเดเดพเด
เดชเดเตเดทเดชเดพเดคเดชเดฐเดฎเดพเดฏ เดเตเดฆเตเดฏเดเตเดเดณเตเดเต, เดชเตเดฐเดคเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเดคเดฟเดฒเตเด เดฎเดจเตเดฆเดเดคเดฟเดฏเดฟเดฒเตเดณเตเดณ เดชเตเดฐเดเดเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดจเดฏเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเดฎเตเดชเตเดฏเตเดเตเดเตเดทเดฃเตฝ เดคเตเดตเตเดฐเดคเดฏเตเดณเตเดณ เดซเตเตผเดตเตเดกเต/เดฌเดพเดเตเดเตโเดตเตเตผเดกเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเดเตเดเตพ เด เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃเดฎเดพเดฏเดฟ เดเดจเดคเตเดคเดคเดพเดฃเต
เดฒเตเดกเต.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดชเตเดฐเตเดพเดซเตเตฝ เดจเดฟเตผเดฎเดพเดฃเด (เดชเดฟเดจเตเดจเตเดเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดเตพ)
เดเดชเตเดชเตเตพ เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดเตเดเดณเดฟเตฝ เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดจเดฟเดฐเดเตพ เดเดเตเดเดจเต เดจเดฟเตผเดตเดเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต เดเดจเตเดจเดคเต เด เดเดชเตโเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเตเดเตเดเดฟเด เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเตเดเตพ. เดธเตเดตเดคเดตเต, เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ เดเดฒเตเดฒเดพเดฏเตโเดชเตเดชเตเดดเตเด เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เด เดจเตเดตเตเดทเดฃ เดเตเดฐเดฎเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเตเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดซเดฒเด, เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดธเตเดฅเดพเดจเดเตเดเตพ เด เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเดคเตเดคเดพเตฝ เดจเดฟเตผเดตเดเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเตเดฐเดฎเด: เด เดคเดพเดฏเดคเต, เดเดฐเต เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดเดชเตเดชเตเดดเตเด เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดเดฑเดฟเดเดฟเดจเดฒเดฟเดจเต เดคเตเดฒเตเดฏเดฎเดพเดฃเต
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดฒเตเด เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเด.
--เดตเตเดเดค เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดจเดฟเดฐเดเดณเต เดเดฐเต เดญเดฟเดจเตเดจเดธเดเดเตเดฏ เดเดณเตเดณเดตเดฏเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเตผเดตเตเดตเดเดฟเดเตเดเตเด >= เดธเดฟเดเดซเตเดฐเดพเดเต เดเดจเตเดจ เดจเดฟเดฒเดฏเดฟเตฝ เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเดเตเดเตพ
เดตเดฟเดเดตเตเดเตพเดเตเดเต เดเดคเดฟเดฐเดพเดฃเต. (เด เดคเดฟเดจเต เดคเดพเดดเต เดเดพเดฃเตเด --เดธเดฟเดเดซเตเดฐเดพเดเต เดเดชเตเดทเตป.) เดเดคเต เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ เดเดฃเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด
เดฎเดฑเตเดฑเตเดตเดฟเดเตเดฏเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดพเดฃ เดเดชเตเดทเตป (เดเตป hmmbuild, เดชเตเดฐเดคเตเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต), เด เดคเต เดเดฃเตเดเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดพเด
เด เดญเดฟเดเดพเดฎเตเดฏเดฎเดฒเตเดฒเดพเดคเตเดค เดซเดฒเดเตเดเตพ เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ, เดเดพเดฐเดฃเด เดเดฐเต เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเดฟเดจเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดเตเดเต เดชเตเดฐเดตเตเดถเดฟเดเตเดเดพเตป เดเดดเดฟเดฏเตเด
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เด เดจเตเดตเตเดทเดฃเดคเตเดคเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดธเตโเดชเตเดฏเตโเดธเต เด เดเดฒเต, เดเตเดฑเดเตเดเต เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดจเดฟเดฐเดเตพ เด เดตเดถเตเดทเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดฟเดฒเตเดฒ
เด เดคเดฟเดจเตเดฑเต เด เดตเดถเดฟเดทเตเดเดเตเดเดณเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดชเตเดฐเตเดคเตเดคเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต.
--เดเต เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดฑเดซเดฑเตปเดธเต เดตเตเดฏเดพเดเตเดฏเดพเดจเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เด เดเตเดคเตเดค เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเดฟเตฝ เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดจเดฟเดฐเดเตพ เดจเดฟเตผเดตเดเดฟเดเตเดเตเด
เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด. เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ เดฎเตเดฎเตเดชเดคเตเดคเต เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดฑเดซเดฑเตปเดธเต เดตเตเดฏเดพเดเตเดฏเดพเดจเด เดชเตเดฐเดเดฐเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด, เดคเตเดเตผเดจเตเดจเต เด เดเตเดคเตเดค เดชเตเดฐเตเดซเตเดฒเดฟเดฒเตเดเตเดเต. เดเดคเดพเดฃเต เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ.
--เดธเดฟเดเดซเตเดฐเดพเดเต
เดเดชเตเดชเตเตพ เดเดฐเต เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดเตเดณเด เดจเดฟเตผเดตเตเดตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดเดตเดถเตเดฏเดฎเดพเดฏ เด เดตเดถเดฟเดทเตเด เดญเดฟเดจเตเดจเดธเดเดเตเดฏเดฏเตเดเต เดชเดฐเดฟเดงเดฟ เดจเดฟเตผเดตเดเดฟเดเตเดเตเด
เดเดชเดฏเตเดพเดเดฟเดเตเดเต --เดตเตเดเดค เดเดชเตเดทเตป. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.5 เดเดฃเต. เดเดฐเต เดจเดฟเดฐเดฏเดฟเดฒเตเดฏเตเด เดเดฟเดนเตเดจ เดญเดฟเดจเตเดจเดธเดเดเตเดฏ
เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดถเตเดฐเตเดฃเดฟ เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดเดฃเดเตเดเดฟเดฒเตเดเตเดคเตเดคเต, เดตเดฟเดเดตเต เด เดตเดเดฃเดฟเดเตเดเดคเดฟเดจเต เดถเตเดทเด เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดถเดเดฒเดเตเดเดณเตเดเต เด เดฑเตเดฑเดเตเดเดณเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดชเตเดฐเตเดคเตเดคเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดชเตเดฐเดคเตเดเดเตเดเตพ (เดเดจเตเดคเดฐเดฟเดเดคเตเดคเดฟเดจเต เดตเดฟเดชเดฐเตเดคเดฎเดพเดฏเดฟ
เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฒเตเดเตพ/เดเดฒเตเดฒเดพเดคเดพเดเตเดเดฒเตเดเตพ). เดเดคเต 0.0 เดเดฏเดฟ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เด เตผเดคเตเดฅเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เดเดฐเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดเตเดณเดตเตเด เดเตเดฏเตเดฏเตเด เดเดจเตเดจเดพเดฃเต
เดธเดฎเดตเดพเดฏเดฎเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด, เดเดฟเดฒ เดธเดจเตเดฆเตผเดญเดเตเดเดณเดฟเตฝ เดเดคเต เดเดชเดฏเตเดเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดเตเด. เดเดคเต 1.0 เดเดฏเดฟ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
0 เดตเดฟเดเดตเตเดเตพ (เดเดจเตเดคเดฐเดฟเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฒเตเดเตพ/เดเดฒเตเดฒเดพเดคเดพเดเตเดเดฒเตเดเตพ) เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจ เดจเดฟเดฐเดเตพ เดฎเดพเดคเตเดฐเดฎเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเด เดเดจเตเดจเดพเดฃเต เด เตผเดคเตเดฅเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต
เดธเดฎเดตเดพเดฏเดฎเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต.
--เดซเตเดฐเดพเดเตเดฐเตเดทเต
เดตเดฟเดจเตเดฏเดธเดฟเดเตเด เดเตเดฐเดฎเด เด เดฑเดฟเดฏเดพเดฎเตเดเตเดเดฟเตฝ เดฎเดพเดคเตเดฐเดฎเต เดเดเตเดเตพ เดเตเตผเดฎเดฟเดจเตฝ เดตเดฟเดเดตเตเดเตพ เดเดฒเตเดฒเดพเดคเดพเดเตเดเดฒเดพเดฏเดฟ เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเต
เดชเตเตผเดฃเตเดฃ เดฆเตเตผเดเตเดฏเดฎเตเดณเตเดณเดคเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดฃเด, เด เดคเตเดฐเต เดถเดเดฒเดฎเดพเดฃเตเดเตเดเดฟเตฝ เด เดฒเตเดฒ (เดเดฆเดพเดนเดฐเดฃเดคเตเดคเดฟเดจเต, เดเดพเดฐเดฃเด เด เดคเดฟเดจเตเดฑเต เดเดฐเต เดญเดพเดเด เดฎเดพเดคเตเดฐเด
เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฟเดเตเดเต). เดถเดเดฒเดเตเดเตพ เด เดจเตเดฎเดพเดจเดฟเดเตเดเดพเตป HMMER เดเดฐเต เดฒเดณเดฟเดคเดฎเดพเดฏ เดจเดฟเดฏเดฎเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต: เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดฆเตเตผเดเตเดฏเดฎเดพเดฃเตเดเตเดเดฟเตฝ
L เดเดฐเต เดญเดฟเดจเตเดจเดธเดเดเตเดฏเดฏเตเดเตเดเดพเตพ เดเตเดฑเดตเต เดคเตเดฒเตเดฏเดฎเต เดเดฃเต เดจเดฟเดฐเดเดณเดฟเดฒเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธ เดฆเตเตผเดเตเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดเดฐเดเตเดเดฟ,
เดคเตเดเตผเดจเตเดจเต เดเตเดฐเดฎเด เดเดฐเต เดถเดเดฒเดฎเดพเดฏเดฟ เดเตเดเดพเดฐเตเดฏเด เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.5 เดเดฃเต. เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด
--เดซเตเดฐเดพเดเตเดฐเตเดทเต0 เดเดฐเต เดถเดเดฒเดฎเดพเดฏเดฟ เดจเต (เดถเตเดจเตเดฏเดฎเดฒเตเดฒเดพเดคเตเดค) เดเตเดฐเดฎเด เดจเดฟเตผเดตเดเดฟเดเตเดเตเด; เดจเดฟเดเตเดเตพ เดเดเตเดฐเดนเดฟเดเตเดเตเดเตเดเดพเด
เดชเตเตผเดฃเตเดฃ เดฆเตเตผเดเตเดฏเดฎเตเดณเตเดณ เดถเตเดฐเดฆเตเดงเดพเดชเตเตผเดตเตเดตเด เดเตเดฏเตเดฑเตเดฑเตเดฑเต เดเตเดฏเตเดค เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเต เดฒเดญเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเตเดฃเตเดเตเดจเตเดจเต เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเดฑเดฟเดฏเดพเดฎเตเดเตเดเดฟเตฝ เดเดคเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด
เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ. เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด --เดซเตเดฐเดพเดเตเดฐเตเดทเต1 เดเดฒเตเดฒเดพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเด เดถเดเดฒเดเตเดเดณเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเตผเดตเตเดตเดเดฟเดเตเดเตเด; เดจเดฟเดเตเดเตพ เดเดฐเตเดชเดเตเดทเต
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด เดชเตเตผเดฃเตเดฃเดฎเดพเดฏเตเด เดถเดเดฒเดเตเดเตพ เด เดเดเตเดเดฟเดฏเดคเดพเดฃเตเดจเตเดจเต เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเดฑเดฟเดฏเดพเดฎเตเดเตเดเดฟเตฝ เดเดคเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเตป เดเดเตเดฐเดนเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดฎเตเดฑเตเดฑเดพเดเตเดจเตเดฎเดฟเดเต เดทเตเดเตเดเตเดเตบ เดกเดพเดฑเตเดฑเดฏเดฟเตฝ เดเตเดฑเดฟเดฏ เดตเดพเดฏเดจเดเตพ เดชเดฐเดฟเดญเดพเดทเดชเตเดชเตเดเตเดคเตเดคเดฟเดฏเดคเต เดชเตเดฒเต.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดเดชเตเดเตเดทเดฟเดเด เดญเดพเดฐเด
เดเดจเตเดจเดฟเดฒเดงเดฟเดเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ เดจเดฟเดจเตเดจเต เดเดฐเต เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดฎเตเดชเตเดดเตเดฒเตเดฒเดพเด, HMMER เดเดฐเต เด เดกเตโเดนเตเดเตเดเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดฎเตเดคเตฝ เดกเตเตบเดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเต เด เดเตเดคเตเดคเต เดฌเดจเตเดงเดชเตเดชเตเดเตเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเด เดเดฏเตผเดจเตเดจ เดญเดพเดฐเดตเตเด เดตเดฟเดฆเตเดฐเดตเตเดฎเดพเดฏเดฟ เดฌเดจเตเดงเดชเตเดชเตเดเตเดเดคเตเดฎเดพเดฃเต
เดเดจเตเดจเต. เด เดธเดฎเดฎเดพเดฏ เดซเตเดฒเตเดเตเดจเตเดฑเตเดฑเดฟเดเต เดตเดดเดฟ เดฎเตเดกเดฒเตเดเดณเต เดชเดเตเดทเดชเดพเดคเด เดเตเดฑเดฏเตเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดซเดฒเดฎเดพเดฃเดฟเดคเต
เดชเตเดฐเดพเดคเดฟเดจเดฟเดงเตเดฏเด. เดเดฆเดพเดนเดฐเดฃเดคเตเดคเดฟเดจเต, เดธเดฎเดพเดจเดฎเดพเดฏ เดฐเดฃเตเดเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต เดธเดพเดงเดพเดฐเดฃเดฏเดพเดฏเดฟ เดเดฐเตเดจเตเดจเดฟเดจเตเด เดชเดเตเดคเดฟ เดฒเดญเดฟเดเตเดเตเด
เดเดฐเต เดถเตเดฐเตเดฃเดฟเดฏเตเดเต เดญเดพเดฐเด (เด เดคเตเดเตเดฃเตเดเดพเดฃเต เดเดพเดเตเดเตเดนเดฎเตเดฎเตผ เดเดชเตเดชเตเดดเตเด เดเดถเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเดฟเดฒเตเดฒ
เดเดฐเต เดเดตเตผเดคเตเดคเดจเดคเตเดคเดฟเดจเตเดฑเตเดฏเตเด เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเตฝ เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เด เดจเตเดตเตเดทเดฃ เดเตเดฐเดฎเด เดเตพเดชเตเดชเตเดเต, เด เดคเต เดเดฃเตเดเตเดคเตเดคเดฟเดฏเดพเดฒเตเด
เดจเดฟเดเตเดเตพ เดคเดฟเดฐเดฏเตเดจเตเดจ เดกเดพเดฑเตเดฑเดพเดฌเตเดธเดฟเตฝ เดตเตเดฃเตเดเตเด). เดเดคเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดฃเดฎเตเดจเตเดจเต เด เดเดชเตโเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต.
--wpb Henikoff เดชเตเดธเดฟเดทเตป เด เดเดฟเดธเตเดฅเดพเดจเดฎเดพเดเตเดเดฟเดฏเตเดณเตเดณ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดธเตเดเตเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด [Henikoff, Henikoff,
เดเต. เดฎเตเตพ. เดฌเดฏเตเตพ. 243:574, 1994]. เดเดคเดพเดฃเต เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ.
--wgsc Gerstein/Sonnhammer/Chothia เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เด เตฝเดเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด [Gerstein et al, J. Mol.
เดฌเดฏเตเตพ. 235:1067, 1994].
--wblosum
BLOSUM เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเตฝ เดกเดพเดฑเตเดฑ เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเตป เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเด เด เดคเต เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดฟเดเดเต เดธเตเดเตเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
เดธเดฌเตเดธเดฟเดฑเตเดฑเตเดฏเตเดทเตป เดฎเตเดเตเดฐเดฟเดเตเดธเต [เดนเตเดจเดฟเดเตเดเตเดซเต เดเตปเดกเต เดนเตเดจเดฟเดเตเดเตเดซเต, เดชเตเดฐเตเดธเดฟ. เดจเดพเดฑเตเดฑเตเตฝ. เด เดเตเดเดพเดกเต. เดถเดพเดธเตเดคเตเดฐเด 89:10915, 1992].
เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพ เดเดฐเต เดเดกเดจเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเดฟเตฝ เดเดฑเตเดฑ-เดฒเดฟเดเตเดเตเดเต เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดพเดฃเต (เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.62; เดเดพเดฃเตเด
--เดตเดฟเดถเดพเดฒเด) เดเตเดเดพเดคเต เดธเดฟ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฐเต เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดฟเดจเตเดณเตเดณเดฟเดฒเตเด, เดเดฐเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเดฟเดจเตเด เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดญเดพเดฐเด เดฒเดญเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
1/c.
--เดธเตเดตเดจเตเดคเด
เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดญเดพเดฐเด เดเดฒเตเดฒ. เดเดฒเตเดฒเดพ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเตเด เดเดเตเดเตเดค เดญเดพเดฐเด เดจเดฟเดถเตเดเดฏเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต.
--เดตเดฟเดถเดพเดฒเด
เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดฎเตเดชเตเตพ เดธเดฟเดเดเดฟเตพ-เดฒเดฟเดเตเดเตเดเต เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดฟเดเดเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดเดกเดจเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต --wblosum.
เดฎเดฑเตเดฑเตเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต เดธเตเดเตเดฎเดฟเดจเตเดชเตเดชเด เด เดธเดพเดงเตเดตเดพเดฃเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.62 เดเดฃเต.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฃเต เด เดจเตเดเตเดฐเดฎเด NUMBER
เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดญเดพเดฐเด เดจเดฟเตผเดฃเตเดฃเดฏเดฟเดเตเด เดถเตเดทเด, เด เดต เดฎเตเดคเตเดคเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดณเตเดณ เดซเดฒเดชเตเดฐเดพเดชเตเดคเดฟเดฏเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดจเตเตผเดฎเดฒเตเดธเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต
เดเตเดฐเดฎเดธเดเดเตเดฏ, eff_nseq. เด เดธเดเดเตเดฏเดฏเดฟเดฒเต เดเตเดฐเดฎเดเตเดเดณเตเดเต เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เดธเดเดเตเดฏเดฏเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดพเด
เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเด, เดชเดเตเดทเต เด เดคเต เดฎเดฟเดเตเดเดตเดพเดฑเตเด เดเดชเตเดชเตเดดเตเด เด เดคเดฟเดจเตเดเตเดเดพเตพ เดเตเดฑเตเดคเดพเดฃเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเต
เดฐเตเดคเดฟ (--eent) เดตเดฟเดตเดฐ เดเดณเตเดณเดเดเตเดเด เดเตเดฑเดฏเตเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏ เดเตเดฐเดฎเดธเดเดเตเดฏ เดเตเดฑเดฏเตเดเตเดเตเดจเตเดจเต
(เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เดนเตเดฎเตเดฒเตเดเตเดเดณเดฟเตฝ เดถเดฐเดพเดถเดฐเดฟ เดชเตเดฐเดคเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเตเดเตเตผ) เดธเดฎเดตเดพเดฏ เดธเตเดฅเดพเดจเดคเตเดคเดฟเดจเต. เดฆเดฟ
เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเต เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เดฐเดฃเตเดเต เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดซเดเดเตโเดทเดจเดพเดฃเต, เด เดตเดฟเดเต เดฐเดฃเตเดเตเด
เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต --เดเดตเดฟเดเต เดเดชเตเดชเด --เดเดธเดฟเดเตเดฎ.
--eent เดเดฐเตเดจเตเดจเดฟเดจเตเด เดเดฐเต เดจเดฟเตผเดฆเตเดฆเดฟเดทเตเด เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ เดจเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดจเดฎเตเดชเตผ เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเด
เดธเตเดฅเดพเดจเด (เดเดพเดฃเตเด --เดเดตเดฟเดเต). เดเดคเดพเดฃเต เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ.
--เดเดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเต
เดเด-เดฒเดฟเดเตเดเตเดเต เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดจเดฎเตเดชเตผ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด a
เดจเดฟเตผเดฆเตเดฆเดฟเดทเตเด เดเดกเดจเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดคเตเดฐเตเดทเตเตพเดกเต (เดเดพเดฃเตเด --เดเดฆเต). เด เดเดชเตเดทเตป เดถเตเดชเดพเตผเดถ เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเดฟเดฒเตเดฒ; เด เดคเดฟเดจเตเดณเตเดณเดคเดพเดฃเต
เดชเดฐเตเดเตเดทเดฃเดเตเดเตพ เดเดคเตเดฐเดคเตเดคเตเดณเด เดฎเดฟเดเดเตเดเดคเดพเดฃเตเดจเตเดจเต เดตเดฟเดฒเดฏเดฟเดฐเตเดคเตเดคเตเดจเตเดจเต --eent เดเดฃเต.
--เดเดจเตเดคเต
เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดจเดฎเตเดชเตผ เดจเดฟเตผเดฃเตเดฃเดฏเด เดเดซเดพเดเตเดเดฟ เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เดธเดเดเตเดฏ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด
เดเตเดฐเดฎเดเตเดเตพ. เดจเดฟเดเตเดเตพ เดเดคเต เดเตเดฏเตเดฏเดพเตป เดเดเตเดฐเดนเดฟเดเตเดเตเดเตเดเดพเดตเตเดจเตเดจ เดเดฐเต เดเดพเดฐเดฃเด เดฌเดจเตเดงเตเดตเดฟเดจเต เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟเดฏเดพเดเตเดเดพเตป เดถเตเดฐเดฎเดฟเดเตเดเตเด เดเดจเตเดจเดคเดพเดฃเต
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดฎเตเดกเดฒเดฟเดจเตเดฑเต เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ/เดธเตเดฅเดพเดจเด, เดเดคเต เดนเตเดฐเดธเตเดต เดฎเตเดกเดฒเตเดเตพเดเตเดเต เดเดชเดฏเตเดเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏเตเดเตเดเดพเด.
--เดธเตเดฑเตเดฑเต
เดเดฒเตเดฒเดพ เดฎเตเดกเดฒเตเดเตพเดเตเดเตเด เดซเดฒเดชเตเดฐเดฆเดฎเดพเดฏ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดจเดฎเตเดชเตผ เดตเตเดฏเดเตเดคเดฎเดพเดฏเดฟ เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด .
--เดเดตเดฟเดเต
เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดเตเดฑเดเตเด เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ/เดธเตเดฅเดพเดจ เดฒเดเตเดทเตเดฏเด เดเดคเดฟเดฒเตเดเตเดเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด . เดเดตเดถเตเดฏเดฎเดพเดฃเต --eent. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ
เดเตเดฐเดฎเด เด เดเตเดทเดฐเดฎเดพเดฒเดฏเต เดเดถเตเดฐเดฏเดฟเดเตเดเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต; เดชเตเดฐเตเดเตเดเตเตป เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเตพเดเตเดเต, เดเดคเต 0.59 เดฌเดฟเดฑเตเดฑเตเดเตพ/เดธเตเดฅเดพเดจเดฎเดพเดฃเต.
--เดเดธเดฟเดเตเดฎ
เดเดฐเต เดฎเตเดดเตเดตเตป เดฎเตเดกเตฝ เดตเดฟเดจเตเดฏเดพเดธเดคเตเดคเดฟเดฒเตเดเต เดธเดเดญเดพเดตเดจ เดเตเดฏเตเดค เดเดฑเตเดฑเดตเตเด เดเตเดฑเดเตเด เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เด เดคเดฟเดจเตเดฑเต เดฎเตเดดเตเดตเตป เดจเตเดณเดตเตเด. เดนเตเดฐเดธเตเดต เดฎเตเดกเดฒเตเดเตพเดเตเดเต เดเดฏเตผเดจเตเดจ เดเดชเตเดเตเดทเดฟเดเดค เดเดฃเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเตเดฑเต เดซเดฒเดฎเดพเดฃเดฟเดคเต
เดเดฐเต เดธเตเดฅเดพเดจเดคเตเดคเตเดเตเดเดพเดณเตเด เดเตปเดเตเดฐเตเดชเตเดชเดฟ --เดเดตเดฟเดเต เดเดฑเตเดฑเดฏเตเดเตเดเต เดเตเดเตเดเตเดเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 45.0 เดฌเดฟเดฑเตเดฑเตเดเดณเดพเดฃเต.
--เดเดฆเต
เดเดคเตเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดธเดฟเดเดเดฟเตพ เดฒเดฟเดเตเดเตเดเต เดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดฟเดเดเต เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดซเตเดฐเดพเดเตเดทเดฃเตฝ เดชเตเดฏเตผเดตเตเดธเต เดเดกเดจเตเดฑเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดเดเตเดเตเดเดซเต เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
The --เดเดเตเดฒเดธเตเดฑเตเดฑเต เดเดชเตเดทเตป. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.62 เดเดฃเต.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต PRIORS
เดชเตเดฐเตเดซเตเตฝ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดพเดฃเดคเตเดคเดฟเตฝ, เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ, เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดกเต เดเตเดฃเตเดเตเดเตพ เด เตผเดคเตเดฅเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเดคเต เดชเดฟเตปเดเดพเดฎเดฟเดฏเดพเดฏเดฟ เดชเดฐเดฟเดตเตผเดคเตเดคเดจเด เดเตเดฏเตเดฏเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต
Dirichlet priors เดเดจเตเดจ เดฎเดฟเดถเตเดฐเดฟเดคเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดชเตเดฐเตเดฌเดฌเดฟเดฒเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดฎเดฟเดถเตเดฐเดฟเดคเด Dirichlet
เดชเตเดฐเตเดเตเดเตเตป เดฎเตเดกเดฒเตเดเตพเดเตเดเตเด เดจเตเดฏเตเดเตเดฒเดฟเดเต เดเดธเดฟเดกเต (เดเตผเดเตปเด, เดกเดฟเดเตปเด) เดฎเตเดกเดฒเตเดเตพเดเตเดเตเดฎเตเดณเตเดณ เดฎเตเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ เดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดฟเดเตเดเตเดฃเตเดเต
เดเตป. เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดชเตเดฐเดฟเดฏเดฑเตเดเตพ เด เดธเดพเดงเตเดตเดพเดเตเดเดพเตป เดเดจเดฟเดชเตเดชเดฑเดฏเตเดจเตเดจ เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดเตเดเดณเต เด เดจเตเดตเดฆเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต.
--pnone เดฎเตเตปเดเดฐเตเดคเดฒเตเดเดณเตเดจเตเดจเตเด เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเดฐเตเดคเต. เดชเตเดฐเตเดฌเดฌเดฟเดฒเดฟเดฑเตเดฑเดฟ เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ เดฒเดณเดฟเดคเดฎเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเดฐเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเดชเตเดชเตเดเตเด
เดเดชเตเดเตเดทเดฟเด เดเตเดฐเดฎเด เดตเตเดฏเตเดฑเตเดฑเดฟเดเดเดฟเดจเต เดถเตเดทเด เดเดตเตเดคเตเดคเดฟเดเตพ.
--เดธเตเดฅเดฒเด เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต เดฎเดฟเดถเตเดฐเดฟเดคเดฎเดพเดฏ Dirichlet prior-เดจเตเดฑเต เดธเตเดฅเดพเดจเดคเตเดคเต เดเดฐเต Laplace +1 prior เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด.
เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต E-VALUE เดเดพเดฒเดฟเดฌเตเดฐเตเดทเตป
MSV เดซเดฟเตฝเดเตเดเดฑเดฟเดจเดพเดฏเดฟ เดชเตเดฐเดคเตเดเตเดทเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเตเดเตเตผ เดตเดฟเดคเดฐเดฃเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเดฑเตเดเตพ เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดธเตโเดเตเดฑเตเดเตพ, เดตเดฟเดฑเตเดฑเตเตผเดฌเดฟ เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เดธเตโเดเตเดฑเตเดเตพ, เดซเตเตผเดตเตเดกเต เดธเตโเดเตเดฑเตเดเตพ เดเดจเตเดจเดฟเดตเดฏเตโเดเตเดเต เดฎเตเดจเตเดจเต เดนเตเดฐเดธเตเดต เดฑเดพเตปเดกเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดเดตเดถเตเดฏเดฎเดพเดฃเต
เด เดจเตเดเดฐเดฃเดเตเดเตพ.
--เดเดเดเตฝ
เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ mu เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเตฝ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดฆเตเตผเดเตเดฏเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
MSV เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 200 เดเดฃเต.
--เดเดเดเตป
เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ mu เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเดฒเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
MSV เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 200 เดเดฃเต.
--EvL
เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ mu เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเตฝ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดฆเตเตผเดเตเดฏเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดตเดฟเดฑเตเดฑเตเตผเดฌเดฟ เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 200 เดเดฃเต.
--EvN
เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ mu เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเดฒเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
Viterbi เดซเดฟเตฝเดเตเดเตผ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 200 เดเดฃเต.
--EfL
เดเต เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเตฝ เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดฆเตเตผเดเตเดฏเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดซเตเตผเดตเตเดกเต เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 100 เดเดฃเต.
--เดเดเดซเตเดเตป
เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดชเดพเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเดฒเต เดธเตเดเตเดตเตปเดธเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดซเตเตผเดตเตเดกเต เด-เดฎเตเดฒเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ tau. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 200 เดเดฃเต.
--เดเดซเตเดฑเตเดฑเต
เดฒเตเดเตเดเตเดทเตป เดเดฃเดเตเดเดพเดเตเดเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเดฟเตฝ เดเตเดฐเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเต เดเตเดฏเดฟเตฝ เดฎเดพเดธเต เดซเตเดฐเดพเดเตเดทเตป เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดซเตเตผเดตเตเดกเต เดฎเตเดฒเตเดฏเดจเดฟเตผเดฃเตเดฃเดฏเดคเตเดคเดฟเดจเตเดณเตเดณ เดชเดฐเดพเดฎเตเดฑเตเดฑเตผ tau. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ 0.04 เดเดฃเต.
เดฎเดฑเตเดฑเตเดณเตเดณเดต เดเดชเตเดทเดจเตเดเตพ
--nonull2
เดชเดเตเดทเดชเดพเดคเดชเดฐเดฎเดพเดฏ เดฐเดเดจเดฏเตเดเตเดเดพเดฏเดฟ null2 เดธเตเดเตเตผ เดคเดฟเดฐเตเดคเตเดคเดฒเตเดเตพ เดเดซเดพเดเตเดเตเด.
-Z เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดคเดฟเดฐเดฏเดฒเตเดเดณเดฟเดฒเต เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดเดฃเตเดจเตเดจเต เดเดฑเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเด , เดเดตเดถเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ
เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดฏเดฅเดพเตผเดคเตเดฅ เดเดฃเตเดฃเดคเตเดคเตเดเตเดเดพเตพ, เดเดฐเต เดถเตเดฐเตเดฃเดฟเดฏเดฟเดฒเตเด เด-เดฎเตเดฒเตเดฏ เดเดฃเดเตเดเตเดเตเดเตเดเดฒเตเดเตพ
เดเดฃเตเดเต.
--domZ
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดคเดฟเดฐเดฏเดฒเตเดเดณเดฟเดฒเต เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดเดฃเตเดจเตเดจเต เดเดฑเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเด , เดเดตเดถเตเดฏเดเตเดเตพเดเตเดเดพเดฏเดฟ
เดเดพเตผเดเตเดฑเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเดคเตเดคเดฟเดจเต เดชเดเดฐเด เดเดฐเต เดกเตเดฎเตเดฏเตโเดจเตเด เดธเตเดชเดพเดงเดฟเดเดฎเดพเดฏ เด-เดฎเตเดฒเตเดฏ เดเดฃเดเตเดเตเดเตเดเตเดเดฒเตเดเตพ
เด เดคเต เดฑเดฟเดชเตเดชเตเตผเดเตเดเดฟเดเดเต เดชเดฐเดฟเดงเดฟเดเตพ เดเดเดจเตเดจเต.
--เดตเดฟเดคเตเดคเต
เดฑเดพเตปเดกเด เดจเดฎเตเดชเตผ เดเดจเดฑเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต เดธเตเดกเต เดเตเดฏเตเดฏเตเด , เดเดฐเต เดชเตเตผเดฃเตเดฃเดธเดเดเตเดฏ >= 0. เดเดเตเดเดฟเตฝ >0 เดเดฃเต, เดเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด
เดธเตเดฅเดพเดฏเดฟเดฏเดพเดฏ เด เดจเตเดเดฐเดฃเดเตเดเตพ เดชเตเดจเตผเดจเดฟเตผเดฎเตเดฎเดฟเดเตเดเดพเดตเตเดจเตเดจเดคเดพเดฃเต; เด เดคเต เดเดฎเดพเตปเดกเต เด เดคเต เดคเดจเตเดจเต เดจเตฝเดเตเด
เดซเดฒเด. เดเดเตเดเดฟเตฝ 0 เดเดฃเต, เดฑเดพเตปเดกเด เดจเดฎเตเดชเตผ เดเดจเดฑเตเดฑเตเดฑเตผ เดเดเดชเดเตเดทเตเดฏเดฎเดพเดฏเดฟ เดธเตเดกเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเต, เดเดชเตเดชเด
เดเดฐเต เดเดฎเดพเตปเดกเดฟเดจเตเดฑเต เดฑเตบ เดฎเตเดคเตฝ เดฑเตบ เดตเดฐเต เดธเตเดฑเตเดฑเตเดเตเดเดพเดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดเต เดธเดฟเดฎเตเดฒเตเดทเดจเตเดเตพ เดตเตเดฏเดคเตเดฏเดพเดธเดชเตเดชเตเดเตเด. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ
เดตเดฟเดคเตเดคเต 42 เดเดฃเต.
--qformat
เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดเดจเตเดจเต เดชเตเดฐเดเตเดฏเดพเดชเดฟเดเตเดเตเด query_seqfile เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเดฟเดฒเดพเดฃเต . เดธเตเดตเตเดเดฐเดฟเดเตเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดซเดฏเตฝ
FASTA, EMBL, GenBank, DDBJ, UniProt, Stockholm, SELEX เดเดจเตเดจเดฟเดต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเตเดเดณเดฟเตฝ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ
เดซเดฏเดฒเดฟเดจเตเดฑเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดธเตเดตเดฏเด เดเดฃเตเดเตเดคเตเดคเตเด เดเดจเตเดจเดคเดพเดฃเต.
--tformat
เดเตปเดชเตเดเตเดเต เดเดจเตเดจเต เดชเตเดฐเดเตเดฏเดพเดชเดฟเดเตเดเตเด target_seqdb เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเดฟเดฒเดพเดฃเต . เดธเตเดตเตเดเดฐเดฟเดเตเด เดธเตเดเตเดตเตปเดธเต เดซเดฏเตฝ
FASTA, EMBL, GenBank, DDBJ, UniProt, Stockholm, SELEX เดเดจเตเดจเดฟเดต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเตเดเดณเดฟเตฝ เดเตพเดชเตเดชเตเดเตเดจเตเดจเต. เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ
เดซเดฏเดฒเดฟเดจเตเดฑเต เดซเตเตผเดฎเดพเดฑเตเดฑเต เดธเตเดตเดฏเด เดเดฃเตเดเตเดคเตเดคเตเด เดเดจเตเดจเดคเดพเดฃเต.
--เดธเดฟเดชเดฟเดฏเต
เดธเดฎเดพเดจเตเดคเดฐ เดคเตเดดเดฟเดฒเดพเดณเดฟ เดคเตเดฐเตเดกเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเด . เดธเตเดฅเดฟเดฐเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟเดฏเดพเดฏเดฟ, HMMER เดเดคเต เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดฎเตเดทเตเดจเดฟเตฝ เด เดคเต เดเดฃเตเดเตเดคเตเดคเตเดจเตเดจ เดธเดฟเดชเดฟเดฏเต เดเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดฃเตเดฃเด - เด เดคเดพเดฏเดคเต, เด เดคเต เดชเดฐเดฎเดพเดตเดงเดฟเดฏเดพเดเตเดเดพเตป เดถเตเดฐเดฎเดฟเดเตเดเตเดจเตเดจเต
เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดฏ เดชเตเดฐเตเดธเดธเตผ เดเตเดฑเตเดเดณเตเดเต เดเดชเดฏเตเดเด. เดเตเดฐเดฎเตเดเดฐเดฃเด เดเดฃเตเดฃเดคเตเดคเตเดเตเดเดพเตพ เดเดฏเตผเดจเตเดจเดคเต
เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดฏ เดเตเดฑเตเดเตพเดเตเดเต เดเดจเตเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดฎเตเดฒเตเดฏเดฎเตเดฃเตเดเตเดเตเดเดฟเตฝ เด เดคเต เดตเดณเดฐเต เดเตเดฑเดตเดพเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเตเด, เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเดคเต เดเดจเตเดคเตเดเตเดเดฟเดฒเตเด เดธเดเตเดเดฎเดพเดเตเดเดพเตป เดคเดพเตฝเดชเตเดชเดฐเตเดฏเดฎเตเดฃเตเดเดพเดเดพเด
เดเตเดฑเดตเต. เดเดฐเต เดชเดฐเดฟเดธเตเดฅเดฟเดคเดฟ เดตเตเดฐเดฟเดฏเดฌเดฟเตพ เดธเดเตเดเตเดเดฐเดฟเดเตเดเต เดจเดฟเดเตเดเตพเดเตเดเต เด เดจเดฎเตเดชเตผ เดจเดฟเดฏเดจเตเดคเตเดฐเดฟเดเตเดเดพเดจเตเด เดเดดเดฟเดฏเตเด,
HMMER_NCPU.
HMMER POSIX เดคเตเดฐเตเดกเตเดเตพ เดชเดฟเดจเตเดคเตเดฃเดฏเตเดเต เดธเดฎเดพเดนเดฐเดฟเดเตเดเดคเดพเดฃเตเดเตเดเดฟเตฝ เดฎเดพเดคเตเดฐเดฎเต เด เดเดชเตเดทเตป เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดเต.
เดเดคเดพเดฃเต เดกเดฟเดซเตเตพเดเตเดเต, เดเดจเตเดจเดพเตฝ เดจเดฟเดเตเดเดณเตเดเต เดธเตเดฑเตเดฑเดฟเดจเดพเดฏเตเดณเตเดณ เดเดเดชเตเตฝ เดธเดฎเดฏเดคเตเดคเต เดเดคเต เดเดซเดพเดเตเดเดฟเดฏเดฟเดฐเดฟเดเตเดเดพเด
เด เดฒเตเดฒเตเดเตเดเดฟเตฝ เดเดฟเดฒ เดเดพเดฐเดฃเดเตเดเดณเดพเตฝ เดฏเดจเตเดคเตเดฐเด.
-- เดธเตเดฑเตเดฑเดพเตพ
MPI เดฎเดพเดธเตเดฑเตเดฑเตผ/เดตเตผเดเตเดเตผ เดชเดคเดฟเดชเตเดชเต เดกเตเดฌเดเตเดเต เดเตเดฏเตเดฏเตเดจเตเดจเดคเดฟเดจเดพเดฏเดฟ: เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดทเดฎเดฎเดพเดเตเดเดพเตป เดเดฐเดเดญเดฟเดเตเดเดคเดฟเดจเต เดถเตเดทเด เดคเดพเตฝเดเตเดเดพเดฒเดฟเดเดฎเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเตผเดคเตเดคเตเด
เดฑเดฃเตเดฃเดฟเดเดเต เดฎเดพเดธเตเดฑเตเดฑเดฑเดฟเดฒเตเดเตเดเตเด เดตเตผเดเตเดเตผ(เดเตพ) เดชเตเดฐเดเตเดฐเดฟเดฏเดเดณเดฟเดฒเตเดเตเดเตเด เดกเตเดฌเดเตเดเดฑเตเดเตพ เด เดฑเตเดฑเดพเดเตเดเตเดเตเดฏเตเดฏเดพเตป เดกเดตเดฒเดชเตเดชเตผ. เด เดฏเดเตเดเตเด
เดคเดพเตฝเดเตเดเดพเดฒเดฟเดเดฎเดพเดฏเดฟ เดจเดฟเตผเดคเตเดคเดพเตป SIGCONT เดธเดฟเดเตเดจเตฝ. (เดเดฟเดกเดฟเดฌเดฟเดเตเดเต เดเตเดดเดฟเตฝ: (เดเดฟเดกเดฟเดฌเดฟ) เดธเดฟเดเตเดจเตฝ เด เดเตเดคเตเดคเดคเต) (เดฎเดพเดคเตเดฐเด
เดเดเดชเตเตฝ เดธเดฎเดฏเดคเตเดคเต เดเดชเตเดทเดฃเตฝ MPI เดชเดฟเดจเตเดคเตเดฃ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดทเดฎเดฎเดพเดเตเดเดฟเดฏเดฟเดเตเดเตเดฃเตเดเตเดเตเดเดฟเตฝ เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดฃเต.)
--mpi เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต, MPI เดฎเดพเดธเตเดฑเตเดฑเตผ/เดตเตผเดเตเดเตผ เดฎเตเดกเดฟเตฝ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดฟเดชเตเดชเดฟเดเตเดเตเด เดเดเดชเดฟเดฐเตเตบ. (เดเดชเตเดทเดฃเตฝ MPI เดเดฃเตเดเตเดเดฟเตฝ เดฎเดพเดคเตเดฐเด เดฒเดญเตเดฏเดฎเดพเดฃเต
เดเดเดชเตเตฝ เดธเดฎเดฏเดคเตเดคเต เดชเดฟเดจเตเดคเตเดฃ เดชเตเดฐเดตเตผเดคเตเดคเดจเดเตเดทเดฎเดฎเดพเดเตเดเดฟ.)
onworks.net เดธเตเดตเดจเดเตเดเตพ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเต jackhmmer เดเตบเดฒเตเดจเดพเดฏเดฟ เดเดชเดฏเตเดเดฟเดเตเดเตเด