പ്രൊഫ - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

പ്രൊഫ - ദ്വിതീയ ഘടനയും ലായക പ്രവേശനക്ഷമത പ്രവചനവും

സിനോപ്സിസ്

പ്രൊഫ [ഇൻപുട്ട്ഫിൽ+] [ഓപ്‌ഷനുകൾ]

വിവരണം

ദ്വിതീയ ഘടന പ്രതീക്ഷിക്കുന്നത് ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്കുകളുടെ റേറ്റിംഗ് സംവിധാനമാണ്
ഹെലിക്‌സ്, സ്‌ട്രാൻഡ്, ലൂപ്പ് എന്നീ മൂന്ന് സംസ്ഥാനങ്ങൾക്ക് ശരാശരി കൃത്യത> 72% (റോസ്റ്റ് & സാൻഡർ, PNAS,
1993, 90, 7558-7562; Rost & Sander, JMB, 1993 , 232, 584-599; ഒപ്പം റോസ്റ്റ് & സാണ്ടർ,
പ്രോട്ടീനുകൾ, 1994 , 19, 55-72; കൃത്യതയുടെ വിലയിരുത്തൽ). ഒരേ ഡാറ്റാ സെറ്റിൽ വിലയിരുത്തി,
ഉപയോഗിക്കുന്ന രീതികളേക്കാൾ പത്ത് ശതമാനം പോയിന്റ് ഉയർന്ന ത്രീ-സ്റ്റേറ്റ് കൃത്യതയിലാണ് PROFsec റേറ്റുചെയ്തിരിക്കുന്നത്
ഒരൊറ്റ സീക്വൻസ് വിവരങ്ങൾ മാത്രം, കൂടാതെ ആറ് ശതമാനത്തിലധികം പോയിന്റിൽ,
ഉദാ, സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കുകൾ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള വിന്യാസ വിവരങ്ങൾ ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു രീതി (ലെവിൻ, പാസ്കറെല്ല, ആർഗോസ് &
ഗാർണിയർ, പ്രൊട്ട. എൻജിനീയർ, 6, 849-54, 1993). PHDsec പ്രവചനങ്ങൾക്ക് മൂന്ന് പ്രധാന സവിശേഷതകളുണ്ട്:

1. ഒന്നിലധികം ക്രമ വിന്യാസങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള പരിണാമ വിവരങ്ങളിലൂടെ മെച്ചപ്പെട്ട കൃത്യത
2. സമതുലിതമായ പരിശീലന പ്രക്രിയയിലൂടെ മെച്ചപ്പെട്ട ബീറ്റാ-സ്ട്രാൻഡ് പ്രവചനം
3. ഒരു മൾട്ടി-ലെവൽ സിസ്റ്റം ഉപയോഗിച്ച് ദ്വിതീയ ഘടന സെഗ്‌മെന്റുകളുടെ കൂടുതൽ കൃത്യമായ പ്രവചനം

ഒരു പരസ്പര ബന്ധത്തിലുള്ള ഒരു ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്ക് രീതി റേറ്റിംഗ് വഴിയാണ് ലായക പ്രവേശനക്ഷമത പ്രവചിക്കുന്നത്
ഗുണകം (പരീക്ഷണപരമായി നിരീക്ഷിച്ചതും പ്രവചിക്കപ്പെട്ടതുമായ ആപേക്ഷിക ലായകങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള പരസ്പരബന്ധം
0.54 ഗ്ലോബുലാർ പ്രോട്ടീനുകളുടെ (റോസ്റ്റ് & സാണ്ടർ,) 238 ക്രോസ്-സാധുതയുള്ള പ്രവേശനക്ഷമത
പ്രോട്ടീനുകൾ, 1994, 20, 216-226; കൃത്യതയുടെ വിലയിരുത്തൽ). ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്കിന്റെ ഔട്ട്പുട്ട്
ആപേക്ഷിക പ്രവേശനക്ഷമതയുടെ 10 സംസ്ഥാനങ്ങൾക്കുള്ള കോഡുകൾ. വ്യത്യാസത്തിന്റെ യൂണിറ്റുകളിൽ പ്രകടിപ്പിക്കുന്നു
ഹോമോളജി മോഡലിംഗിലൂടെയുള്ള പ്രവചനത്തിനും (മികച്ച രീതി) ക്രമരഹിതമായ പ്രവചനത്തിനും ഇടയിൽ (ഏറ്റവും മോശം
രീതി), താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്ന ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്കിനേക്കാൾ 26 ശതമാനം പോയിന്റാണ് PROFAcc
മൂന്ന് ഔട്ട്‌പുട്ട് അവസ്ഥകൾ (അടക്കം, ഇന്റർമീഡിയറ്റ്, എക്സ്പോസ്ഡ്) ഉപയോഗിക്കുകയും അതിൽ നിന്നുള്ള വിവരങ്ങളൊന്നും ഉപയോഗിക്കാതിരിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു
ഒന്നിലധികം വിന്യാസങ്ങൾ.

ഇന്റഗ്രൽ മെംബ്രൻ പ്രോട്ടീനുകളിലെ ട്രാൻസ്മെംബ്രെൻ ഹെലിസുകൾ ഒരു ന്യൂറൽ സിസ്റ്റം പ്രവചിക്കുന്നു
നെറ്റ്വർക്കുകൾ. നെറ്റ്‌വർക്ക് സിസ്റ്റത്തിന്റെ പോരായ്മ പലപ്പോഴും വളരെ ദൈർഘ്യമേറിയ ഹെലിസുകളാണ്
പ്രവചിച്ചു. ഒരു അനുഭവപരിചയമുള്ള ഫിൽട്ടർ ഉപയോഗിച്ചാണ് ഇവ മുറിക്കുന്നത്. അന്തിമ പ്രവചനം (റോസ്റ്റ് et al.,
പ്രോട്ടീൻ സയൻസ്, 1995, 4, 521-533; കൃത്യതയുടെ മൂല്യനിർണ്ണയം) ഓരോ അവശിഷ്ടവും പ്രതീക്ഷിക്കുന്നു
ഏകദേശം 95% കൃത്യത. തെറ്റായ പോസിറ്റീവുകളുടെ എണ്ണം, അതായത്, ട്രാൻസ്മെംബ്രെൻ ഹെലിസുകൾ
ഗോളാകൃതിയിലുള്ള പ്രോട്ടീനുകളിൽ പ്രവചിച്ചിരിക്കുന്നത് ഏകദേശം 2% ആണ്. ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്ക് പ്രവചനം
ട്രാൻസ്‌മെംബ്രെൻ ഹെലിസുകൾ (PHDhtm) ഒരു ഡൈനാമിക് പ്രോഗ്രാമിംഗ് പോലുള്ള അൽഗോരിതം ഉപയോഗിച്ചാണ് ശുദ്ധീകരിക്കുന്നത്. ഈ
89-ൽ 131% ട്രാൻസ്മെംബ്രെൻ ഹെലിസുകളുടെയും ശരിയായ പ്രവചനങ്ങൾക്ക് ഈ രീതി കാരണമായി.
ക്രോസ്-വാലിഡേഷൻ ടെസ്റ്റിൽ ഉപയോഗിക്കുന്ന പ്രോട്ടീനുകൾ; ട്രാൻസ്‌മെംബ്രെൻ ഹെലിസുകളിൽ 98 ശതമാനത്തിലധികം
ശരിയായി പ്രവചിച്ചു. ടോപ്പോളജി പ്രവചിക്കാൻ ഈ രീതിയുടെ ഔട്ട്പുട്ട് ഉപയോഗിക്കുന്നു, അതായത്
മെംബ്രണുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് എൻ-ടേമിന്റെ ഓറിയന്റേഷൻ. പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന കൃത്യത
ടോപ്പോളജി പ്രവചനം > 86% ആണ്. യൂക്കറിയോട്ടിക്കിന്റെ പ്രവചന കൃത്യത ശരാശരിയേക്കാൾ കൂടുതലാണ്
പ്രോട്ടീനുകളും പ്രോകാരിയോട്ടുകളുടെ ശരാശരിയേക്കാൾ കുറവാണ്. PHDtopology എല്ലാറ്റിനേക്കാളും കൂടുതൽ കൃത്യമാണ്
സമാന ഡാറ്റാ സെറ്റുകളിൽ പരീക്ഷിച്ച മറ്റ് രീതികൾ.

ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ ഓപ്ഷൻ ഇല്ലെങ്കിൽ (ഉദാ --fileRdb or --fileOut) RDB ഫോർമാറ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു
ഔട്ട്പുട്ട് എഴുതിയിരിക്കുന്നു ./INPUTFILENAME.prof ഇവിടെ 'prof' എന്നതിന്റെ വിപുലീകരണത്തെ മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുന്നു
ഇൻപുട്ട് ഫയൽ. വിപുലീകരണത്തിന്റെ അഭാവത്തിൽ, ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പേരിൽ '.prof' ചേർത്തിരിക്കുന്നു.

ഔട്ട്പുട്ട് ഫോർമാറ്റ്
RDB ഫോർമാറ്റ് സ്വയം വ്യാഖ്യാനിക്കുന്നതാണ്, ഉദാഹരണ ഔട്ട്പുട്ടുകൾ കാണുക /ഷെയർ/പ്രൊഫ്‌ഫ്‌ഡ്/പ്രൊഫ്/എക്സ.

അവലംബം

റോസ്റ്റ്, ബി. ആൻഡ് സാൻഡർ, സി. (1994എ). പരിണാമ വിവരങ്ങളും ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്കുകളും സംയോജിപ്പിക്കുന്നു
പ്രോട്ടീൻ ദ്വിതീയ ഘടന പ്രവചിക്കുക. പ്രോട്ടീനുകൾ, 19(1), 55-72.
റോസ്റ്റ്, ബി. ആൻഡ് സാൻഡർ, സി. (1994ബി). ലായക പ്രവേശനക്ഷമതയുടെ സംരക്ഷണവും പ്രവചനവും
പ്രോട്ടീൻ കുടുംബങ്ങൾ. പ്രോട്ടീനുകൾ, 20(3), 216-26.
റോസ്റ്റ്, ബി., കാസാഡിയോ, ആർ., ഫാരിസെല്ലി, പി., സാൻഡർ, സി. (1995). ട്രാൻസ്മെംബ്രെൻ ഹെലിസുകൾ
95% കൃത്യതയിൽ പ്രവചിക്കുന്നു. പ്രോട്ടീൻ സയൻസ്, 4(3), 521-33.

ഓപ്ഷനുകൾ

കൂടുതൽ സഹായത്തിന് ഓരോ കീവേഡും കാണുക. ഇവയിൽ മിക്കതും തകരാൻ സാധ്യതയുണ്ട്.

ഒരു ഇതര കണക്റ്റിവിറ്റി പാറ്റേണുകൾ (സ്ഥിരസ്ഥിതി=3)

3 സെക്കന്റ് + acc + htm പ്രവചിക്കുക

acc ലായക പ്രവേശനക്ഷമത പ്രവചിക്കുന്നു, മാത്രം

'മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാവുന്ന' PROF ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയലിലേക്ക് അലൈൻ ചേർക്കുക

കമാനം
സിസ്റ്റം ആർക്കിടെക്ചർ (ഉദാ: SGI64|SGI5|SGI32|SUNMP|ALPHA)

ASCII
'മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാവുന്ന' PROF ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയൽ(കൾ) എഴുതുക

മികച്ച
മികച്ച കൃത്യതയും ദൈർഘ്യമേറിയ പ്രവർത്തന സമയവുമുള്ള PROF

രണ്ടും
ദ്വിതീയ ഘടനയും ലായക പ്രവേശനക്ഷമതയും പ്രവചിക്കുക

ഡാറ്റ
ഡാറ്റ = HTML ഔട്ട്: പ്രവചനങ്ങളുടെ ആ ഭാഗങ്ങൾ മാത്രം എഴുതിയിരിക്കുന്നു

ഡീബഗ്
മിക്ക ഇന്റർമീഡിയറ്റ് ഫയലുകളും സൂക്ഷിക്കുക, ഡീബഗ്ഗിംഗ് സന്ദേശങ്ങൾ പ്രിന്റ് ചെയ്യുക

dirwork
വർക്ക് ഡയറക്‌ടറി, ഡിഫോൾട്ട്: File::Temp::tempdir എന്നതിൽ നിന്നുള്ള ഒരു താൽക്കാലിക ഡയറക്ടറി. പൂർണ്ണമായും ആയിരിക്കണം
യോഗ്യതയുള്ള പാത.

ജോലി ചെയ്യാൻ അറിയപ്പെടുന്നു.

doEval
ലിസ്റ്റിനായുള്ള മൂല്യനിർണ്ണയം നടത്തുക (അറിയപ്പെടുന്ന ഘടനകൾക്കും ലിസ്റ്റുകൾക്കും മാത്രം)

doFilterHssp
ഇൻപുട്ട് HSSP ഫയൽ ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക (ചില ജോഡികൾ ഒഴികെ)

doHtmfil
മെംബ്രൺ പ്രവചനം ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി)

doHtmisit
പ്രവചിച്ച മെംബ്രൻ ഹെലിക്സിന്റെ ശക്തി പരിശോധിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി)

doHtmref
മെംബ്രൺ പ്രവചനം പരിഷ്കരിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി)

doHtmtop
DO മെംബ്രൻ ഹെലിക്സ് ടോപ്പോളജി (ഡിഫോൾട്ട്)

dssp
PROF-നെ DSSP ഫോർമാറ്റിലേക്ക് മാറ്റുക

വിപുലീകരിക്കാൻ
ഔട്ട്‌പുട്ട് MSF ഫോർമാറ്റിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുമ്പോൾ ഉൾപ്പെടുത്തലുകൾ വികസിപ്പിക്കുക

ഉപവാസം
ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ കൃത്യതയും ഉയർന്ന വേഗതയും ഉള്ള PROF

fileCasp
CASP ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്‌പുട്ടിന്റെ പേര് (file.caspProf)

ഫയൽDssp
DSSP ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ പേര് (file.dsspProf)

fileHtml
HTML ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്‌പുട്ടിന്റെ പേര് (file.htmlProf)

ഫയൽഎംഎസ്എഫ്
MSF ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്‌പുട്ടിന്റെ പേര് (file.msfProf)

fileNotHtm
മെംബ്രൻ ഹെലിക്‌സ് കണ്ടെത്തിയില്ല എന്ന് ഫ്ലാഗ് ചെയ്യുന്ന ഫയലിന്റെ പേര്

ഫയൽ ഔട്ട്
RDB ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ പേര് (file.rdbProf)

ജോലി ചെയ്യാൻ അറിയപ്പെടുന്നു.

ഫയൽപ്രൊഫ
മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാവുന്ന ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ പേര് (file.prof)

തകർന്നു.

fileRdb
RDB ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ പേര് (file.rdbProf)

ജോലി ചെയ്യാൻ അറിയപ്പെടുന്നു.

fileSaf
SAF ഫോർമാറ്റിലുള്ള PROF ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ പേര് (file.safProf)

ഫിൽറ്റർ ചെയ്യുക
ഇൻപുട്ട് HSSP ഫയൽ ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക (ചില ജോഡികൾ ഒഴികെ)

നല്ല
നല്ല കൃത്യതയും മിതമായ വേഗതയും ഉള്ള PROF

ഗ്രാഫ്
'മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാൻ കഴിയുന്ന' PROF ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയലിലേക്ക് ASCII ഗ്രാഫ് ചേർക്കുക

htm ഉപയോഗം: 'htm= ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ ട്രാൻസ്‌മെംബ്രെൻ ഹെലിക്‌സ് കണ്ടെത്തി ഡിഫോൾട്ട് 'htm=0' ആണ്
(resp. htm=0.8) ചെറിയ സംഖ്യകൾ കൂടുതൽ തെറ്റായ പോസിറ്റീവുകളും കുറച്ച് തെറ്റായ നെഗറ്റീവുകളും!

html വാദം
'hmtl' അല്ലെങ്കിൽ 'html= 'html' എന്ന പ്രവചനത്തിന്റെ HTML ഫോർമാറ്റ് എഴുതുക
PROF ഔട്ട്‌പുട്ട് HTML 'html=body' ആയി പരിവർത്തനം ചെയ്യപ്പെടുന്നത് HTML ഫയലിനെ പരിമിതപ്പെടുത്തുന്നു
HTML_BODY ടാഗ് ഭാഗം 'html=head' HTML ഫയലിനെ HTML_HEADER ടാഗ് ഭാഗത്തേക്ക് പരിമിതപ്പെടുത്തുന്നു
'html=all' HEADER ഉം BODY ഉം നൽകുന്നു

സൂക്ഷിക്കുക
ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പരിവർത്തനം HSSP ഫോർമാറ്റിലേക്ക് സൂക്ഷിക്കുക

KeepFilter വാദം
<*|doKeepFilter=1> ഫിൽട്ടർ ചെയ്ത HSSP ഫയൽ സൂക്ഷിക്കുക

KeepHssp വാദം
<*|doKeepHssp=1> ഇന്റർമീഡിയറ്റ് HSSP ഫയൽ സൂക്ഷിക്കുക

KeepNetDb വാദം
<*|doKeepNetDb=1> ഇന്റർമീഡിയറ്റ് DbNet ഫയൽ(കൾ) സൂക്ഷിക്കുക

ലിസ്റ്റ് വാദം
<*|isList=1> ഇൻപുട്ട് ഫയൽ ഫയലുകളുടെ പട്ടികയാണ്

msf PROF നെ MSF ഫോർമാറ്റിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു

നൈസ്
ജോലിയുടെ നല്ല മൂല്യം (മുൻഗണന) സജ്ജമാക്കാൻ 'nice-D' നൽകുക

noProfHead
പട്ടികകളുള്ള ഫയൽ ലോക്കൽ ഡയറക്ടറിയിലേക്ക് പകർത്തരുത്

നോ സെർച്ച്
doSearchFile=0 എന്നതിന്റെ ചുരുക്കം, അതായത് DB ഫയലുകൾ തിരയുന്നില്ല

നോസ്കി
ASCII (അതായത് മനുഷ്യർക്ക് വായിക്കാൻ കഴിയുന്ന) ഫല ഫയലുകൾ എഴുതുന്നത് അടിച്ചമർത്തുക

nohtml
HTML ഫല ഫയലുകൾ എഴുതുന്നത് അടിച്ചമർത്തുക

അല്ല
ജോലി നല്ലതല്ല, അതായത് കുറഞ്ഞ മുൻഗണനയിൽ പ്രവർത്തിക്കില്ല

notEval
അറിയപ്പെടുന്ന ഘടനകളിൽ പോലും കൃത്യത പരിശോധിക്കരുത്

Htmfil അല്ല
മെംബ്രൻ പ്രവചനം ഫിൽട്ടർ ചെയ്യരുത്

അല്ല Htmisit
മെംബ്രൻ ഹെലിക്സ് വേണ്ടത്ര ശക്തമാണോ അല്ലയോ എന്ന് പരിശോധിക്കരുത്

അല്ല Htmref
മെംബ്രൺ പ്രവചനം പരിഷ്കരിക്കരുത്

Htmtop അല്ല
മെംബ്രൻ ഹെലിക്സ് ടോപ്പോളജി ചെയ്യരുത്

nresPerLineAli
MSF ഫയലിനായി ഉപയോഗിക്കുന്ന പ്രതീകങ്ങളുടെ എണ്ണം. സ്ഥിരസ്ഥിതി: 50.

സംഖ്യകൾമിനിറ്റ്
നെറ്റ്‌വർക്ക് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ എണ്ണം അവശിഷ്ടങ്ങൾ, അല്ലാത്തപക്ഷം prd=symbolPrdShort. സ്ഥിരസ്ഥിതി: 9.

optJury
ജൂറിയിലേക്ക് PHD ചേർക്കുന്നു. ഡിഫോൾട്ട്: `സാധാരണ, ഉപയോഗംPHD'.

മറ്റ് പല പാരാമീറ്ററുകളും ഇതിന്റെ ഡിഫോൾട്ട് ഒരു പാർശ്വഫലമായി മാറ്റുന്നു, ലിസ്റ്റ് ഇതാണ്
സമഗ്രമല്ല:

phd, nophd, /^para(3|Both|Sec|Acc|Htm|CapH|CapE|CapHE)/, /^para?/, jct

para3
sec+acc+htm-നുള്ള പാരാമീറ്റർ ഫയൽ. സ്ഥിരസ്ഥിതി: ` /net/PROFboth_best.par'.

paraAcc
acc-നുള്ള പാരാമീറ്റർ ഫയൽ. സ്ഥിരസ്ഥിതി: ` /net/PROFAcc_best.par'.

പാരാബോത്ത്
sec+ac-നുള്ള പാരാമീറ്റർ ഫയൽ. സ്ഥിരസ്ഥിതി: ` /net/PROFboth_best.par'.

പാരാസെക്കന്റ്
സെക്കന്റിനുള്ള പാരാമീറ്റർ ഫയൽ. സ്ഥിരസ്ഥിതി: ` /net/PROFsec_best.par'.

riSubAcc
PROFAcc എന്ന ഉപവിഭാഗത്തിനായുള്ള ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ വിശ്വാസ്യത സൂചിക (RI). സ്ഥിരസ്ഥിതി: 4.

riSubSec
PROFsec എന്ന ഉപവിഭാഗത്തിനായുള്ള ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ വിശ്വാസ്യത സൂചിക (RI). സ്ഥിരസ്ഥിതി: 5.

riSubSym
RI < riSubSec/Acc ഉപയോഗിച്ച് പ്രവചിച്ച അവശിഷ്ടങ്ങൾക്കുള്ള ചിഹ്നം. സ്ഥിരസ്ഥിതി: `.'.

s_k_i_p
പ്രശ്നങ്ങൾ, മാനുവൽ, സൂചനകൾ, നൊട്ടേഷൻ, txt, അറിയപ്പെടുന്നത്, പൂർത്തിയായി, തീയതി, തീയതി, aa, Lhssp, numaa,
കോഡ്

saf PROF-നെ SAF ഫോർമാറ്റിലേക്ക് പരിവർത്തനം ചെയ്യുന്നു

scrAddHelp
scrGoal
ന്യൂറൽ നെറ്റ്‌വർക്ക് സ്വിച്ചിംഗ്

scrHelpTxt
ഇൻപുട്ട് ഫയൽ ഫോർമാറ്റുകൾ സ്വീകരിച്ചു:
hssp,dssp,msf,saf,fastamul,pirmul,fasta,pir,gcg,swiss

scrIn
list_of_files (അല്ലെങ്കിൽ ഒറ്റ ഫയൽ) parameter_file

scrName
പ്രൊഫ

scrNarg
2

സെക്കൻഡറി ഘടന പ്രവചിക്കുക, മാത്രം

നിശബ്ദത
സ്ക്രീനിൽ വിവരങ്ങളൊന്നും എഴുതിയിട്ടില്ല - ഇതാണ് സ്ഥിരസ്ഥിതി

ഒഴിവാക്കുന്നു
ഇൻപുട്ട് ഫയൽ നഷ്‌ടപ്പെട്ടാൽ അബോർട്ട് ചെയ്യരുത്!

sourcefile
പ്രൊഫ

പരിശോധന
ഒരു പരീക്ഷണം മാത്രമാണ് (വേഗതയുള്ളത്)

തർജ്ജമ-ജോബിഡ്-ഇൻ-പാരം-മൂല്യങ്ങൾ
'ജോബിഡ്' എന്ന സ്ട്രിംഗ് $par{jobid} ഉപയോഗിച്ച് മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുന്നു

പ്രോഗ്രാമിലൂടെ വേഗത്തിൽ ഓടുക, കുറഞ്ഞ കൃത്യത

ഉപയോക്താവ്
ഉപയോക്തൃ നാമം

--പതിപ്പ്
പ്രിന്റ് പതിപ്പ്

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് പ്രൊഫൈൽ ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക